248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3631 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3631  deaminase-reductase domain-containing protein  100 
 
 
205 aa  417  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1327  deaminase-reductase domain-containing protein  53.55 
 
 
228 aa  234  9e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152684  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2826  bifunctional deaminase-reductase domain protein  55.83 
 
 
221 aa  226  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676201  normal  0.258226 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1797  deaminase-reductase domain-containing protein  54.85 
 
 
219 aa  224  8e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.558254  hitchhiker  0.000529334 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0136  bifunctional deaminase-reductase domain protein  48.04 
 
 
212 aa  198  3.9999999999999996e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0562  hypothetical protein  51.47 
 
 
198 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.154273  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1353  bifunctional deaminase-reductase domain protein  45.59 
 
 
217 aa  193  2e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.137932 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5175  bifunctional deaminase-reductase domain protein  46.57 
 
 
219 aa  191  6e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0126564 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  48.29 
 
 
221 aa  188  4e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.335275  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3912  bifunctional deaminase-reductase-like  47.06 
 
 
215 aa  186  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4011  bifunctional deaminase-reductase domain protein  45.85 
 
 
204 aa  186  3e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1010  bifunctional deaminase-reductase-like  47.8 
 
 
221 aa  185  4e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1073  bifunctional deaminase-reductase domain protein  47.32 
 
 
221 aa  184  9e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0488933  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4053  bifunctional deaminase-reductase domain protein  44.88 
 
 
204 aa  181  9.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5078  bifunctional deaminase-reductase domain protein  49.49 
 
 
210 aa  180  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6219  deaminase-reductase domain-containing protein  47.32 
 
 
221 aa  178  4e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.330344 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2260  deaminase-reductase domain-containing protein  44.33 
 
 
218 aa  174  7e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.163458  normal  0.0390077 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2317  hypothetical protein  44.83 
 
 
199 aa  174  9.999999999999999e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1818  deaminase-reductase domain-containing protein  43.9 
 
 
200 aa  174  9.999999999999999e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0584367  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3251  deaminase-reductase domain-containing protein  45.05 
 
 
204 aa  173  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3986  bifunctional deaminase-reductase domain protein  44.28 
 
 
201 aa  166  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.348417  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3814  deaminase-reductase domain-containing protein  47.09 
 
 
205 aa  157  8e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3694  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  41.58 
 
 
201 aa  155  5.0000000000000005e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.426681  normal  0.227028 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21110  dihydrofolate reductase  46.28 
 
 
208 aa  154  6e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.540595  normal  0.320706 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2306  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  43.43 
 
 
196 aa  146  2.0000000000000003e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0916856 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1616  bifunctional deaminase-reductase domain protein  43.22 
 
 
204 aa  144  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.363546  normal  0.130243 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6223  deaminase-reductase domain-containing protein  44.33 
 
 
214 aa  143  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1444  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.73 
 
 
209 aa  140  9e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.87184  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1400  bifunctional deaminase-reductase domain protein  42.33 
 
 
209 aa  137  7.999999999999999e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2385  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.51 
 
 
197 aa  136  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0718176  decreased coverage  0.000891672 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2627  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36 
 
 
194 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.299497  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4363  deaminase-reductase domain-containing protein  45.23 
 
 
203 aa  135  5e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1554  bifunctional deaminase-reductase domain protein  42.37 
 
 
224 aa  135  5e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00264154  normal  0.0363963 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1904  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  38.76 
 
 
200 aa  134  8e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0360214  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2667  deaminase-reductase domain-containing protein  41.24 
 
 
217 aa  134  8e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.440195  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26350  dihydrofolate reductase  37.88 
 
 
208 aa  134  8e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.595114 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2638  bifunctional deaminase-reductase-like protein  41.24 
 
 
217 aa  134  9e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2683  deaminase-reductase domain-containing protein  41.24 
 
 
217 aa  134  9e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449808  normal  0.0195663 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1391  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.93 
 
 
204 aa  134  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.942421  normal  0.0216388 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2088  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.11 
 
 
201 aa  134  9.999999999999999e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.810748 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2027  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40 
 
 
221 aa  129  3e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2593  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.58 
 
 
200 aa  129  3e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000229137 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3226  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  37.31 
 
 
181 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3623  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.11 
 
 
192 aa  125  6e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0073  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.73 
 
 
202 aa  123  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.785173  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3191  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  35.75 
 
 
181 aa  122  5e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9200  hypothetical protein  35 
 
 
183 aa  117  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.461066 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2316  bifunctional deaminase-reductase-like protein  36.65 
 
 
179 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4641  deaminase-reductase domain-containing protein  36.71 
 
 
199 aa  116  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.487001  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4224  hypothetical protein  36.79 
 
 
178 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233961  hitchhiker  0.00450142 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05750  dihydrofolate reductase  37.57 
 
 
213 aa  116  3e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.222473  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2769  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.05 
 
 
180 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000125006  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0446  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.73 
 
 
192 aa  115  3.9999999999999997e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.218483 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5735  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  40.24 
 
 
203 aa  112  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.592899 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0483  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.17 
 
 
182 aa  110  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3696  deaminase-reductase domain-containing protein  37.35 
 
 
181 aa  110  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0966015 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6982  deaminase-reductase domain-containing protein  38.32 
 
 
183 aa  110  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17636  normal  0.296954 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.73 
 
 
178 aa  108  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.64062 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0902  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.66 
 
 
199 aa  108  7.000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3561  deaminase-reductase domain-containing protein  35.57 
 
 
180 aa  108  8.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1734  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.5 
 
 
187 aa  106  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.594103  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4124  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.51 
 
 
181 aa  104  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2196  bifunctional deaminase-reductase-like  35.68 
 
 
183 aa  103  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0947  bifunctional deaminase-reductase-like protein  38.27 
 
 
180 aa  101  6e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.828499  normal  0.189337 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3264  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.33 
 
 
199 aa  100  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.254237 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5486  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.6 
 
 
181 aa  99.8  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.024354  normal  0.977362 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6890  putative pyrimidine reductase  38.41 
 
 
179 aa  100  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.041344  normal  0.0312743 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1520  deaminase-reductase domain-containing protein  34.34 
 
 
178 aa  99.8  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0559645  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.02 
 
 
188 aa  98.2  7e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.169407 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.5 
 
 
188 aa  96.7  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0840105  normal  0.042227 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1513  deaminase-reductase domain-containing protein  35.94 
 
 
187 aa  95.9  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000068195 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1147  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.47 
 
 
183 aa  95.5  5e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000436586 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2027  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.86 
 
 
189 aa  95.1  6e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.954873  normal  0.0836204 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3842  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.84 
 
 
189 aa  94.4  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2336  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.16 
 
 
185 aa  94  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00114514  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3816  deaminase-reductase domain-containing protein  32.99 
 
 
187 aa  92.8  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.600873  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1109  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.42 
 
 
190 aa  92.8  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.05668  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3635  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.46 
 
 
208 aa  92.8  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2707  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  35.15 
 
 
192 aa  91.7  7e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3935  deaminase-reductase domain-containing protein  35.05 
 
 
181 aa  91.3  8e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0619635  normal  0.0228656 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7858  hypothetical protein  30.65 
 
 
199 aa  87  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3871  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.71 
 
 
180 aa  86.7  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.957428  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0181  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.98 
 
 
204 aa  86.3  3e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0235  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.09 
 
 
185 aa  86.3  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.574714  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0067  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.62 
 
 
157 aa  84.7  8e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.482424  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4631  deaminase-reductase domain-containing protein  34.16 
 
 
192 aa  84.7  9e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0166005 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7653  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.71 
 
 
187 aa  84  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3142  deaminase-reductase domain-containing protein  33.99 
 
 
192 aa  84.3  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.921485 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3158  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.66 
 
 
190 aa  83.6  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253763  normal  0.175179 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1784  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.16 
 
 
189 aa  83.6  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.577777  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00910  dihydrofolate reductase  37.68 
 
 
183 aa  82.4  0.000000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1085  deaminase-reductase domain-containing protein  32.2 
 
 
197 aa  81.6  0.000000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.655465  normal  0.734607 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0206  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.57 
 
 
187 aa  81.3  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399944  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0841  hypothetical protein  30.15 
 
 
189 aa  80.1  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.74 
 
 
178 aa  80.1  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1507  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  38.18 
 
 
186 aa  80.1  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.467899  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6952  dihydrofolate reductase  30.18 
 
 
178 aa  80.5  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1267  deaminase-reductase domain-containing protein  37.72 
 
 
200 aa  79  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.924885  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1023  bifunctional deaminase-reductase-like protein  27.07 
 
 
178 aa  79  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4299  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.5 
 
 
188 aa  78.6  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.293289  normal  0.211021 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>