104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3531 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3531  hypothetical protein  100 
 
 		 215 aa  428  1e-119  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0125316  normal  0.0563858 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2442  hypothetical protein  97.21 
 
 		 215 aa  418  1e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3184  hypothetical protein  93.49 
 
 		 215 aa  404  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3252  hypothetical protein  94.88 
 
 		 214 aa  388  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3711  hypothetical protein  75.7 
 
 		 216 aa  322  4e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61306 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2419  hypothetical protein  71.43 
 
 		 224 aa  297  8e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.768585 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2686  hypothetical protein  69.12 
 
 		 221 aa  295  3e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2627  hypothetical protein  65.07 
 
 		 216 aa  276  1e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1674  hypothetical protein  66.5 
 
 		 221 aa  265  4e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.164971  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19450  hypothetical protein  65.53 
 
 		 221 aa  260  1e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04790  hypothetical protein  67.49 
 
 		 223 aa  257  9e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.02558  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0052  protein of unknown function DUF480  49.02 
 
 		 216 aa  186  3e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.102804  normal  0.491736 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03616  hypothetical protein  49.52 
 
 		 258 aa  181  1e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1867  hypothetical protein  42.51 
 
 		 222 aa  150  1e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4077  protein of unknown function DUF480  43.14 
 
 		 228 aa  149  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5328  protein of unknown function DUF480  50 
 
 		 287 aa  149  3e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1622  hypothetical protein  43.48 
 
 		 218 aa  149  4e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.138254 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1629  hypothetical protein  42.03 
 
 		 222 aa  148  6e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.039164 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1554  hypothetical protein  42.03 
 
 		 222 aa  146  3e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1644  hypothetical protein  41.26 
 
 		 221 aa  142  3e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.808623  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2469  hypothetical protein  41.06 
 
 		 213 aa  142  5e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.964701  normal  0.69032 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1967  hypothetical protein  41.59 
 
 		 210 aa  142  5e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.465185  normal  0.175017 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1265  hypothetical protein  40.09 
 
 		 215 aa  142  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.143853 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1280  hypothetical protein  40.09 
 
 		 215 aa  142  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.48257 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1236  hypothetical protein  40.09 
 
 		 215 aa  142  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.159536 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2020  hypothetical protein  40.09 
 
 		 215 aa  142  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2204  hypothetical protein  40.09 
 
 		 215 aa  142  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0185732 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1802  hypothetical protein  42.31 
 
 		 223 aa  141  7e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.694493 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1765  hypothetical protein  41.83 
 
 		 223 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.76394  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2520  protein of unknown function DUF480  41.15 
 
 		 223 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.60784  normal  0.805512 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1804  hypothetical protein  39.44 
 
 		 211 aa  139  3e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.817852  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2048  hypothetical protein  40.57 
 
 		 233 aa  139  3.9999999999999997e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1617  hypothetical protein  39.25 
 
 		 215 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.397537  normal  0.0239474 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2078  protein of unknown function DUF480  37.8 
 
 		 215 aa  138  6e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.424148  normal  0.164766 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2482  hypothetical protein  41.15 
 
 		 216 aa  137  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0256196  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1581  hypothetical protein  36.62 
 
 		 216 aa  137  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1758  hypothetical protein  41.35 
 
 		 223 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0262  hypothetical protein  40.09 
 
 		 219 aa  135  5e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.404279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0676  multidrug resistance protein A  38.94 
 
 		 216 aa  134  8e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.545698  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1648  hypothetical protein  40.3 
 
 		 228 aa  134  9e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0405293  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1161  hypothetical protein  38.16 
 
 		 230 aa  134  9e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3392  hypothetical protein  41.12 
 
 		 225 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.473482 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2730  protein of unknown function DUF480  38.79 
 
 		 225 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.395206  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2081  hypothetical protein  39.13 
 
 		 212 aa  134  9.999999999999999e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.781105  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05349  hypothetical protein  37.74 
 
 		 217 aa  132  3e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0084  protein of unknown function DUF480  38.86 
 
 		 215 aa  132  3e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3975100000000002e-18 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2516  hypothetical protein  40.87 
 
 		 205 aa  132  3.9999999999999996e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.338314 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2178  hypothetical protein  38.43 
 
 		 215 aa  132  3.9999999999999996e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1696  hypothetical protein  36.7 
 
 		 217 aa  132  6e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5373  hypothetical protein  39.42 
 
 		 240 aa  131  6e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.712311 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3509  hypothetical protein  37.39 
 
 		 218 aa  131  7.999999999999999e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.688553 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3645  hypothetical protein  39.23 
 
 		 214 aa  130  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.784319  normal  0.81819 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2903  hypothetical protein  39.02 
 
 		 219 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.159439  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01063  hypothetical protein  36.79 
 
 		 215 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2579  protein of unknown function DUF480  36.79 
 
 		 215 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3223  hypothetical protein  40.38 
 
 		 220 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2611  hypothetical protein  37.2 
 
 		 221 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0461289 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2062  hypothetical protein  36.62 
 
 		 215 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.174673 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2066  hypothetical protein  41.01 
 
 		 222 aa  129  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124636 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0605  hypothetical protein  35.68 
 
 		 221 aa  130  2.0000000000000002e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.209579  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01071  hypothetical protein  36.79 
 
 		 215 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2274  hypothetical protein  38.83 
 
 		 214 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0233  hypothetical protein  39.62 
 
 		 219 aa  129  3e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.363081  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2055  hypothetical protein  34.78 
 
 		 219 aa  129  3e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0305732  normal  0.0543921 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2259  hypothetical protein  36.79 
 
 		 215 aa  129  3e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1190  hypothetical protein  36.79 
 
 		 215 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1190  hypothetical protein  36.79 
 
 		 215 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2533  hypothetical protein  36.79 
 
 		 215 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.477556  normal  0.117101 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0102  protein of unknown function DUF480  37.44 
 
 		 215 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000409835  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1446  hypothetical protein  36.79 
 
 		 215 aa  128  7.000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.585817  hitchhiker  0.00180396 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3231  hypothetical protein  43.4 
 
 		 235 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.373258 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2426  hypothetical protein  36.97 
 
 		 223 aa  127  1.0000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.374899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1905  hypothetical protein  36.49 
 
 		 215 aa  127  1.0000000000000001e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0011352  hitchhiker  0.00151074 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3844  hypothetical protein  39.05 
 
 		 236 aa  126  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.368568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2782  hypothetical protein  43.67 
 
 		 400 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000539  hypothetical protein  36.62 
 
 		 216 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.755702  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3438  hypothetical protein  42.94 
 
 		 232 aa  126  3e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.333291 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0277  hypothetical protein  39.23 
 
 		 219 aa  124  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.521102  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2794  hypothetical protein  40.7 
 
 		 214 aa  124  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.127586 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2102  hypothetical protein  39.22 
 
 		 240 aa  123  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.59809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2282  hypothetical protein  40.45 
 
 		 243 aa  122  3e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.102117  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0399  hypothetical protein  40.98 
 
 		 297 aa  122  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1958  hypothetical protein  40.98 
 
 		 255 aa  122  4e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.473189  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1866  hypothetical protein  40.98 
 
 		 234 aa  122  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.409237  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0990  hypothetical protein  40 
 
 		 234 aa  121  7e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1449  hypothetical protein  43.75 
 
 		 233 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3715  hypothetical protein  39.38 
 
 		 230 aa  120  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5265  protein of unknown function DUF480  43.79 
 
 		 234 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.534627  normal  0.764141 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0106  hypothetical protein  34.5 
 
 		 221 aa  120  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3445  hypothetical protein  36.45 
 
 		 219 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00496877  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5439  hypothetical protein  37.75 
 
 		 236 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.118943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4889  hypothetical protein  37.25 
 
 		 236 aa  119  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.022245 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3509  protein of unknown function DUF480  36.54 
 
 		 225 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4618  hypothetical protein  37.75 
 
 		 236 aa  118  9e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.685823  hitchhiker  0.00167817 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5360  hypothetical protein  38.71 
 
 		 234 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.434043  normal  0.525827 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0081  hypothetical protein  38.65 
 
 		 235 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5610  hypothetical protein  39.13 
 
 		 297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.260426 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4455  hypothetical protein  40.61 
 
 		 234 aa  115  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1356  hypothetical protein  44.44 
 
 		 236 aa  115  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0108358 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0194  protein of unknown function DUF480  35.24 
 
 		 226 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>