More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3518 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3518  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 431 aa  870    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00768036  normal  0.224647 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0459  FAD dependent oxidoreductase  71.86 
 
 		 430 aa  630  1e-179  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3166  FAD dependent oxidoreductase  70.23 
 
 		 430 aa  623  1e-177  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.71572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1592  FAD dependent oxidoreductase  71.86 
 
 		 430 aa  609  1e-173  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1838  FAD dependent oxidoreductase  69.07 
 
 		 430 aa  592  1e-168  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.659002  normal  0.295676 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3761  FAD dependent oxidoreductase  67.67 
 
 		 431 aa  550  1e-155  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6338  FAD dependent oxidoreductase  44.6 
 
 		 446 aa  351  2e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3826  FAD dependent oxidoreductase  42.4 
 
 		 442 aa  338  9.999999999999999e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0702  D-amino acid oxidase family protein  42.17 
 
 		 442 aa  333  3e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.382621  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5297  oxidoreductase  43.12 
 
 		 443 aa  332  6e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.893259  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0765  putative FAD dependent oxidoreductase  41.82 
 
 		 442 aa  324  2e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.144956 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4605  FAD dependent oxidoreductase  44.06 
 
 		 444 aa  324  2e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4955  FAD dependent oxidoreductase  38.84 
 
 		 442 aa  320  1.9999999999999998e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.916041  normal  0.433563 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8165  oxidoreductase  37.41 
 
 		 460 aa  311  2e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0557691  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2277  FAD dependent oxidoreductase  41 
 
 		 433 aa  305  9.000000000000001e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.811789 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0236  AgaE protein  40.42 
 
 		 447 aa  289  7e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1879  FAD dependent oxidoreductase  40.48 
 
 		 447 aa  288  1e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.846969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2825  FAD dependent oxidoreductase  42.19 
 
 		 443 aa  288  2e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.893963 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5888  oxidoreductase  38.84 
 
 		 445 aa  284  3.0000000000000004e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2645  FAD dependent oxidoreductase  36.11 
 
 		 443 aa  282  8.000000000000001e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.864133  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5517  FAD dependent oxidoreductase  36.06 
 
 		 441 aa  280  4e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.176807  normal  0.255694 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1548  FAD dependent oxidoreductase  38.66 
 
 		 441 aa  274  2.0000000000000002e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.746039 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5298  FAD dependent oxidoreductase  39.86 
 
 		 441 aa  274  3e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.494862  normal  0.217732 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1649  FAD dependent oxidoreductase  39.21 
 
 		 441 aa  273  4.0000000000000004e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.756737  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1578  FAD dependent oxidoreductase  39.01 
 
 		 447 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.497346  normal  0.349993 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3695  FAD dependent oxidoreductase  35.58 
 
 		 445 aa  266  4e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.822265  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4956  FAD dependent oxidoreductase  35.61 
 
 		 439 aa  265  1e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.579279  normal  0.246978 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6361  FAD dependent oxidoreductase  37.73 
 
 		 441 aa  263  4e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6064  FAD dependent oxidoreductase  37.73 
 
 		 441 aa  262  8e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5907  FAD dependent oxidoreductase  38.43 
 
 		 441 aa  260  3e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.579318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2637  FAD dependent oxidoreductase  36.64 
 
 		 441 aa  257  2e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.754665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6437  FAD dependent oxidoreductase  37.27 
 
 		 441 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6672  FAD dependent oxidoreductase  37.27 
 
 		 441 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.160579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3290  FAD dependent oxidoreductase  36.92 
 
 		 451 aa  256  4e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.298058 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6270  FAD dependent oxidoreductase  37.27 
 
 		 441 aa  256  5e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.119616 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2919  FAD dependent oxidoreductase  36.56 
 
 		 442 aa  256  6e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3346  FAD dependent oxidoreductase  36.79 
 
 		 446 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00864738 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3069  FAD dependent oxidoreductase  32.75 
 
 		 441 aa  252  9.000000000000001e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.211431  hitchhiker  0.00906466 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2806  FAD dependent oxidoreductase  38.56 
 
 		 466 aa  251  2e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00827549  normal  0.954723 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5589  FAD dependent oxidoreductase  36.61 
 
 		 441 aa  248  1e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.17966 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5300  FAD dependent oxidoreductase  37.32 
 
 		 441 aa  247  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.158205 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1284  FAD-dependent oxidoreductase  37.02 
 
 		 442 aa  246  6e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2539  agaE protein  37.02 
 
 		 442 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.154835  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1294  hypothetical protein  37.02 
 
 		 442 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1023  FAD-dependent oxidoreductase  37.02 
 
 		 442 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0272  hypothetical protein  37.02 
 
 		 442 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0655938  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1362  FAD-dependent oxidoreductase  37.02 
 
 		 442 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0543  hypothetical protein  37.02 
 
 		 442 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1461  putative lipoprotein  36.54 
 
 		 436 aa  244  3e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1161  FAD dependent oxidoreductase  37.77 
 
 		 444 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.309102 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1927  putative deaminase  36.48 
 
 		 441 aa  243  5e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.70122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1769  hypothetical protein  35.56 
 
 		 446 aa  241  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000748216 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5640  FAD dependent oxidoreductase  36.08 
 
 		 444 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.738738  normal  0.548415 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3709  FAD dependent oxidoreductase  35.85 
 
 		 444 aa  239  8e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.611519  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4659  FAD dependent oxidoreductase  35.85 
 
 		 444 aa  239  8e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5001  FAD dependent oxidoreductase  34.59 
 
 		 441 aa  237  4e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.58394  normal  0.404419 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4505  FAD dependent oxidoreductase  35.13 
 
 		 444 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4903  FAD dependent oxidoreductase  36.04 
 
 		 446 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0595104 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0860  FAD dependent oxidoreductase  33.49 
 
 		 471 aa  230  3e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.300011 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4047  FAD dependent oxidoreductase  34.66 
 
 		 455 aa  229  6e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345279  normal  0.812767 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1159  putative FAD dependent oxidoreductase  32.46 
 
 		 428 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4693  FAD dependent oxidoreductase  31.12 
 
 		 423 aa  182  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2644  FAD dependent oxidoreductase  30.66 
 
 		 396 aa  133  6e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.875281  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3942  FAD dependent oxidoreductase  28.06 
 
 		 385 aa  127  3e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.741631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1938  FAD dependent oxidoreductase  28.09 
 
 		 388 aa  124  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6497  oxidoreductase  28.99 
 
 		 380 aa  123  7e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  27.7 
 
 		 394 aa  121  3e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6294  FAD dependent oxidoreductase  25.13 
 
 		 387 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3036  FAD dependent oxidoreductase  27.38 
 
 		 394 aa  120  6e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  24.23 
 
 		 390 aa  120  7e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2939  FAD dependent oxidoreductase  29.01 
 
 		 378 aa  119  7.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2330  FAD dependent oxidoreductase  26.97 
 
 		 394 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00484515  normal  0.869499 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3532  FAD dependent oxidoreductase  28.22 
 
 		 392 aa  118  1.9999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4434  FAD dependent oxidoreductase  28.77 
 
 		 378 aa  117  5e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.862237  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4107  FAD dependent oxidoreductase  27.68 
 
 		 393 aa  116  6.9999999999999995e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0968917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  26.86 
 
 		 369 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0303  FAD dependent oxidoreductase  26.78 
 
 		 376 aa  114  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1254  FAD dependent oxidoreductase  26.9 
 
 		 799 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0777915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1501  FAD dependent oxidoreductase  26.29 
 
 		 389 aa  114  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190283  normal  0.0251893 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0151  FAD dependent oxidoreductase  27.43 
 
 		 389 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4544  glycine oxidase ThiO  26.09 
 
 		 369 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4803  FAD dependent oxidoreductase  27.87 
 
 		 399 aa  111  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355272  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0086  FAD dependent oxidoreductase  24.94 
 
 		 385 aa  110  4.0000000000000004e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.024354  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4373  FAD dependent oxidoreductase  26.23 
 
 		 385 aa  110  4.0000000000000004e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  29.31 
 
 		 500 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0617  glycine oxidase ThiO  25.85 
 
 		 369 aa  110  5e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3808  FAD dependent oxidoreductase  26.51 
 
 		 385 aa  109  8.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0800  glycine oxidase  26.86 
 
 		 369 aa  108  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0884  glycine oxidase ThiO  27.1 
 
 		 369 aa  109  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  30.45 
 
 		 492 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0807  glycine oxidase ThiO  26.33 
 
 		 369 aa  109  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.35515e-47 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0640  glycine oxidase  26.33 
 
 		 369 aa  108  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4350  FAD dependent oxidoreductase  24.05 
 
 		 816 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248836 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1073  FAD dependent oxidoreductase  25.75 
 
 		 385 aa  108  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0787  glycine oxidase ThiO  26.09 
 
 		 369 aa  108  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1890  FAD dependent oxidoreductase  25.54 
 
 		 390 aa  108  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125592  normal  0.229246 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0255  oxidoreductase, FAD-binding protein  26.21 
 
 		 384 aa  107  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2290  FAD dependent oxidoreductase  24.18 
 
 		 823 aa  107  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.407986 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6084  FAD dependent oxidoreductase  25.82 
 
 		 389 aa  107  6e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.793169 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6532  FAD dependent oxidoreductase  25.24 
 
 		 374 aa  106  8e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330707  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>