More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3493 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_2453  L-asparaginase, type II  98.62 
 
 
362 aa  730    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.620188 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3237  L-asparaginase, type II  98.9 
 
 
362 aa  731    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.764535  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3493  L-asparaginase, type II  100 
 
 
362 aa  737    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.821405 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1955  L-asparaginase, type II  98.34 
 
 
362 aa  728    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00433508 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1917  L-asparaginase, type II  85.08 
 
 
362 aa  588  1e-167  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.155631  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46970  glutaminase-asparaginase  82.32 
 
 
362 aa  577  1e-164  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.013825  normal  0.0254019 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4048  glutaminase-asparaginase  84 
 
 
350 aa  569  1e-161  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.493489  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07280  L-asparaginase, type II  77.35 
 
 
362 aa  522  1e-147  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.706918  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4206  L-asparaginases, type II  74.31 
 
 
356 aa  510  1e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4182  L-asparaginases, type II  71.39 
 
 
365 aa  499  1e-140  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.428323  normal  0.315829 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0442  L-asparaginases, type II  73.39 
 
 
379 aa  498  1e-140  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.228079  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4748  L-asparaginase, type II  74.31 
 
 
356 aa  498  1e-140  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0564  L-asparaginase, type II  73.09 
 
 
378 aa  492  9.999999999999999e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2689  L-asparaginase, type II  72.1 
 
 
356 aa  486  1e-136  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.373089 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3136  L-asparaginase, type II  70.55 
 
 
373 aa  480  1e-134  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.239344  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3863  L-asparaginases, type II  70.55 
 
 
366 aa  479  1e-134  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.354581 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1913  glutaminase-(asparagin-)ase  68.09 
 
 
363 aa  462  1e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.252419  normal  0.323954 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5349  L-asparaginase, type II  70.12 
 
 
372 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.438245  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5042  L-asparaginase, type II  70.03 
 
 
369 aa  456  1e-127  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.122979  hitchhiker  0.00128464 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3427  L-asparaginase, type II  68.18 
 
 
373 aa  450  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.104551 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1812  L-asparaginase, type II  59.18 
 
 
374 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0266176  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1583  asparaginase  59.21 
 
 
375 aa  375  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000246256  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0013  putative phage integrase  53.01 
 
 
344 aa  345  5e-94  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4228  L-asparaginase, type II  48.17 
 
 
330 aa  331  1e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.965091  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1178  L-asparaginase, type II  50 
 
 
347 aa  327  1.0000000000000001e-88  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06515  L-asparaginase II  48.48 
 
 
338 aa  314  1.9999999999999998e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000646  L-asparaginase  47.75 
 
 
354 aa  312  6.999999999999999e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2006  L-asparaginase, type II  49.85 
 
 
348 aa  311  7.999999999999999e-84  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.602671  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0056  L-asparaginase  46.88 
 
 
348 aa  305  1.0000000000000001e-81  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0031  L-asparaginase  46.59 
 
 
348 aa  303  2.0000000000000002e-81  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0646  L-asparaginase, type II  44.67 
 
 
352 aa  302  6.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0641  L-asparaginase, type II  44.67 
 
 
352 aa  302  6.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0619  L-asparaginase, type II  44.67 
 
 
352 aa  302  7.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3745  L-asparaginase, type II  44.67 
 
 
356 aa  301  1e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.148156  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3114  L-asparaginase, type II  45.89 
 
 
348 aa  299  5e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.526818  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1606  L-asparaginase, type II  43.91 
 
 
352 aa  293  3e-78  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.57786  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1705  L-asparaginase II  47.27 
 
 
348 aa  292  5e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.108514  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0080  L-asparaginase  46.13 
 
 
348 aa  292  7e-78  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3314  L-asparaginase, type II  45.98 
 
 
346 aa  292  7e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0996  L-asparaginase, type II  45.69 
 
 
346 aa  291  9e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.396669  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1657  L-asparaginase II  48.93 
 
 
348 aa  290  3e-77  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02787  periplasmic L-asparaginase II  48.18 
 
 
348 aa  289  7e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00534571  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02750  hypothetical protein  48.18 
 
 
348 aa  289  7e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00507808  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4260  L-asparaginase II  47.88 
 
 
348 aa  288  8e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1362  L-asparaginase II  47.09 
 
 
348 aa  288  1e-76  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000230453  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2924  L-asparaginase, type II  44.7 
 
 
348 aa  288  1e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3389  L-asparaginase II  47.88 
 
 
348 aa  287  2e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3099  L-asparaginase II  47.88 
 
 
348 aa  287  2e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149168 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1118  L-asparaginase II  47.88 
 
 
348 aa  287  2e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.881329 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3117  L-asparaginase II  47.88 
 
 
348 aa  287  2e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0757  L-asparaginase II  47.88 
 
 
348 aa  287  2e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00188173 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1025  L-asparaginase II  48.93 
 
 
347 aa  285  5.999999999999999e-76  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000214281  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3301  L-asparaginase II  47.88 
 
 
348 aa  285  7e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0738  L-asparaginase, type II  47.27 
 
 
348 aa  283  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3269  L-asparaginase II  46.97 
 
 
348 aa  281  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3345  L-asparaginase II  46.97 
 
 
348 aa  281  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.52837  normal  0.418181 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3449  L-asparaginase II  46.97 
 
 
348 aa  281  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.65351  normal  0.38324 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3353  L-asparaginase II  46.97 
 
 
348 aa  281  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.529278 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3280  L-asparaginase II  46.97 
 
 
348 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0792755 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0029  L-asparaginase  46.18 
 
 
338 aa  276  5e-73  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.304062  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1949  L-asparaginase II  45.98 
 
 
345 aa  273  5.000000000000001e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0010291  normal  0.072144 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2674  L-asparaginase II  45.66 
 
 
345 aa  271  1e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2586  L-asparaginase II  45.66 
 
 
345 aa  271  1e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1145  L-asparaginase, type II  44.55 
 
 
339 aa  270  2.9999999999999997e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.209792  normal  0.423972 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3973  L-asparaginase  44.24 
 
 
347 aa  269  5.9999999999999995e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3912  L-asparaginase  44.24 
 
 
347 aa  269  5.9999999999999995e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.278506  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3792  L-asparaginase  43.94 
 
 
347 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0751735  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3804  L-asparaginase  44.24 
 
 
347 aa  267  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3870  L-asparaginase  43.94 
 
 
347 aa  268  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0029  L-asparaginase  43.94 
 
 
331 aa  266  2.9999999999999995e-70  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.51172  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1624  L-asparaginase, type II  43.55 
 
 
355 aa  263  4e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.53483 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0683  L-asparaginases, type II  45 
 
 
316 aa  257  3e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2166  asparaginase family protein  45.65 
 
 
347 aa  256  4e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.559992  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2428  asparaginase family protein  45.65 
 
 
396 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1413  asparaginase family protein  45.65 
 
 
347 aa  253  3e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0424299  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1175  asparaginase family protein  45.65 
 
 
347 aa  253  3e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.120195  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2265  L-asparaginase, type II  45.65 
 
 
347 aa  253  3e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.609083  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2305  L-asparaginase, type II  45.65 
 
 
347 aa  253  3e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.820101  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1902  asparaginase family protein  45.65 
 
 
347 aa  253  3e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3402  asparaginase family protein  45.65 
 
 
347 aa  253  3e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.432934  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4951  L-asparaginase, type II  43.08 
 
 
323 aa  252  7e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1778  L-asparaginase, type II  43.2 
 
 
338 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.116458  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2464  L-asparaginase, type II  43.45 
 
 
346 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.232555  normal  0.387168 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5182  L-asparaginase, type II  43.6 
 
 
340 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.699287  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1905  L-asparaginase, type II  42.98 
 
 
340 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000217284 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6197  L-asparaginases, type II  42.69 
 
 
365 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.329515  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1882  L-asparaginases, type II  42.69 
 
 
365 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2492  putative asparaginase/glutaminase  48.03 
 
 
347 aa  240  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1791  L-asparaginase, type II  42.65 
 
 
340 aa  241  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1819  L-asparaginases, type II  42.99 
 
 
340 aa  236  4e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.498334  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1392  L-asparaginase, type II  41.18 
 
 
340 aa  235  8e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00300  asparaginase, aspartic hydroxamate res. (Eurofung)  39.87 
 
 
378 aa  216  2.9999999999999998e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0205708  normal  0.375032 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00150  L-asparaginase type II family protein  35.76 
 
 
328 aa  211  2e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.589872 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3916  L-asparaginase, type II  37 
 
 
349 aa  207  3e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.823534  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1980  asparaginase  38.92 
 
 
333 aa  206  4e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0624321 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1306  L-asparaginase II precursor signal peptide protein  39.05 
 
 
367 aa  206  5e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0303  Asparaginase/glutaminase  36.04 
 
 
333 aa  202  5e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.203906  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1242  Asparaginase  37.43 
 
 
330 aa  202  9e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0987888  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2007  L-asparaginase, type II  40.95 
 
 
378 aa  196  7e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.354174  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4029  asparaginase  37.98 
 
 
338 aa  196  7e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.404026 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>