45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3437 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3437  hypothetical protein  100 
 
 		 123 aa  250  6e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000604853  unclonable  6.86407e-17 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2986  hypothetical protein  43.33 
 
 		 117 aa  95.9  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.57206  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4151  hypothetical protein  43.33 
 
 		 178 aa  87.4  6e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.0043925  normal  0.91822 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5711  hypothetical protein  43 
 
 		 137 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6193  hypothetical protein  36.21 
 
 		 313 aa  72.8  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0113828  normal  0.0194796 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4225  hypothetical protein  31.15 
 
 		 312 aa  69.7  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.263637  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1561  hypothetical protein  33.81 
 
 		 135 aa  69.7  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4157  hypothetical protein  33.91 
 
 		 313 aa  68.6  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0316718  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2151  hypothetical protein  33.9 
 
 		 125 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3917  hypothetical protein  32.77 
 
 		 327 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2646  hypothetical protein  33.05 
 
 		 131 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0769  hypothetical protein  31.93 
 
 		 308 aa  65.1  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7719  hypothetical protein  33.05 
 
 		 307 aa  65.1  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.746604 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2130  hypothetical protein  33.05 
 
 		 307 aa  64.7  0.0000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.632513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2860  hypothetical protein  34.48 
 
 		 308 aa  64.7  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.496484  normal  0.125752 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3336  hypothetical protein  31.36 
 
 		 304 aa  64.7  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0190  hypothetical protein  34.78 
 
 		 302 aa  63.5  0.0000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0261596  normal  0.413386 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0375  hypothetical protein  31.09 
 
 		 309 aa  62.4  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7415  hypothetical protein  31.93 
 
 		 339 aa  62  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.535459  normal  0.763852 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1216  hypothetical protein  33.33 
 
 		 308 aa  61.6  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.766236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3519  hypothetical protein  33.33 
 
 		 308 aa  61.6  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.980926  normal  0.759326 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2786  hypothetical protein  31.93 
 
 		 309 aa  62  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1531  hypothetical protein  31.62 
 
 		 308 aa  60.5  0.000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0410908 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4023  hypothetical protein  31.62 
 
 		 307 aa  60.5  0.000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0850174 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5569  hypothetical protein  34.38 
 
 		 309 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.64366  normal  0.0668153 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3563  hypothetical protein  31.09 
 
 		 312 aa  60.1  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2650  hypothetical protein  30.43 
 
 		 310 aa  60.1  0.000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.817192  normal  0.104991 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0573  hypothetical protein  30.77 
 
 		 306 aa  59.7  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.153804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0533  hypothetical protein  29.57 
 
 		 307 aa  60.1  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.39822  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0718  hypothetical protein  31.62 
 
 		 308 aa  58.9  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6059  hypothetical protein  30.77 
 
 		 313 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1482  hypothetical protein  29.57 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8282  hypothetical protein  33.33 
 
 		 311 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.167728  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3176  hypothetical protein  32.48 
 
 		 311 aa  58.2  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0169526  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1044  hypothetical protein  30.77 
 
 		 309 aa  57  0.00000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.526643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2344  hypothetical protein  29.41 
 
 		 310 aa  57  0.00000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3024  hypothetical protein  30.77 
 
 		 308 aa  56.6  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3917  hypothetical protein  32.76 
 
 		 127 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4581  hypothetical protein  29.91 
 
 		 307 aa  55.5  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.807477  normal  0.179791 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3067  hypothetical protein  29.91 
 
 		 401 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0551  hypothetical protein  36.05 
 
 		 150 aa  52  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2516  hypothetical protein  28.7 
 
 		 313 aa  49.7  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.311845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3830  hypothetical protein  35.8 
 
 		 310 aa  47.8  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.279081  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3994  hypothetical protein  30.28 
 
 		 309 aa  41.2  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.548217  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3660  hypothetical protein  30.28 
 
 		 309 aa  41.2  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0855564  decreased coverage  0.00000145048 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>