More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3385 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3385  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 		 214 aa  424  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00201071 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3353  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  48.61 
 
 		 218 aa  204  1e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3676  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  47.91 
 
 		 218 aa  201  7e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0073  transporter transmembrane protein  46.01 
 
 		 215 aa  190  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1238  lysine exporter protein LysE/YggA  48.15 
 
 		 212 aa  185  4e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0801686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0162  LysE family translocator protein  45.58 
 
 		 211 aa  179  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0144  homoserine/threonine efflux protein, putative  45.58 
 
 		 211 aa  179  2e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0348  homoserine/homoserine lactone efflux protein  45.58 
 
 		 211 aa  179  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2355  LysE family translocator protein  45.58 
 
 		 211 aa  179  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2277  LysE family translocator protein  45.58 
 
 		 211 aa  179  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0153  LysE family translocator protein  45.58 
 
 		 211 aa  180  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2803  LysE family translocator protein  45.58 
 
 		 211 aa  179  2e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6476  lysine exporter protein LysE/YggA  46.26 
 
 		 211 aa  177  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.772782 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0037  lysine exporter protein LysE/YggA  45.37 
 
 		 214 aa  176  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3063  lysine exporter protein LysE/YggA  45.79 
 
 		 213 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3141  lysine exporter protein LysE/YggA  45.33 
 
 		 213 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.514565  normal  0.554318 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2511  lysine exporter protein LysE/YggA  45.79 
 
 		 213 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3180  lysine exporter protein LysE/YggA  45.33 
 
 		 213 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.920743  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3125  lysine exporter protein LysE/YggA  45.79 
 
 		 213 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.298747  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0130  LysE family protein  44.65 
 
 		 211 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3122  lysine exporter protein LysE/YggA  45.83 
 
 		 213 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.188461 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0311  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  43.46 
 
 		 214 aa  167  8e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4414  amino acid efflux pump, RhtB family protein  44.44 
 
 		 213 aa  165  5e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.897061 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3865  lysine exporter protein LysE/YggA  36.45 
 
 		 210 aa  155  4e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.149729 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3931  amino acid transporter LysE  35.35 
 
 		 213 aa  142  4e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2059  LysE family amino acid efflux protein  36.79 
 
 		 217 aa  140  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.513091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1442  lysine exporter protein LysE/YggA  36.28 
 
 		 217 aa  139  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754857 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1611  lysine exporter protein LysE/YggA  36.92 
 
 		 207 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0311017  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4520  lysine exporter protein LysE/YggA  37.56 
 
 		 211 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.286419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2002  lysine exporter protein LysE/YggA  36.92 
 
 		 208 aa  136  2e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.272931  normal  0.707068 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4453  lysine exporter protein LysE/YggA  35.19 
 
 		 216 aa  133  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1160  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.45 
 
 		 207 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000397574  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2383  lysine exporter protein LysE/YggA  36.79 
 
 		 217 aa  133  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.77882  normal  0.612853 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2900  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.43 
 
 		 209 aa  132  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.297506 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0577  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.33 
 
 		 219 aa  132  5e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2925  amino acid transporter LysE  33.33 
 
 		 209 aa  132  6e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0920317  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1191  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.89 
 
 		 211 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217594  normal  0.390598 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4362  lysine exporter protein LysE/YggA  40 
 
 		 211 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.815141  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3434  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35 
 
 		 218 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1045  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.71 
 
 		 211 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0364  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 		 203 aa  128  5.0000000000000004e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0277  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.33 
 
 		 208 aa  128  6e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2266  lysine exporter protein LysE/YggA  35.41 
 
 		 211 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000228935  hitchhiker  0.000000285135 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0322  lysine exporter protein LysE/YggA  38.46 
 
 		 209 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.279488  normal  0.801106 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5581  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.95 
 
 		 212 aa  124  9e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2117  homoserine/threonine efflux protein  34.6 
 
 		 210 aa  124  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.045272  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4942  lysine exporter protein LysE/YggA  37.02 
 
 		 208 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.774081  normal  0.20679 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2162  lysine exporter protein LysE/YggA  33.81 
 
 		 209 aa  124  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0727412  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2589  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.95 
 
 		 243 aa  124  1e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2194  homoserine/threonine efflux protein  34.6 
 
 		 210 aa  123  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534032  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0986  leucine export protein LeuE  34.3 
 
 		 225 aa  123  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2355  homoserine/threonine efflux protein  34.6 
 
 		 210 aa  123  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5140  lysine exporter protein LysE/YggA  35.19 
 
 		 210 aa  123  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2321  putative homoserine/threonine efflux protein  34.91 
 
 		 210 aa  123  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2131  homoserine/threonine efflux protein  34.12 
 
 		 210 aa  122  3e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000187844  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2374  putative homoserine/threonine efflux protein  34.12 
 
 		 210 aa  122  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0612  RhtB family transporter  32.86 
 
 		 209 aa  122  4e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3964  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.34 
 
 		 209 aa  122  4e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5326  lysine exporter protein LysE/YggA  36.54 
 
 		 208 aa  122  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.692371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0810  leucine export protein LeuE  35.68 
 
 		 219 aa  122  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3040  lysine exporter protein LysE/YggA  36.54 
 
 		 208 aa  122  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.408857  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1291  leucine export protein LeuE  35.68 
 
 		 219 aa  122  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2456  putative homoserine/threonine efflux protein  34.12 
 
 		 210 aa  122  6e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.506268  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0334  lysine exporter protein LysE/YggA  34.62 
 
 		 204 aa  121  8e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4155  lysine exporter protein LysE/YggA  35.81 
 
 		 210 aa  121  8e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.646483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4807  lysine exporter protein LysE/YggA  35.19 
 
 		 210 aa  121  8e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0152252  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3360  lysine exporter protein LysE/YggA  35.19 
 
 		 210 aa  121  8e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.742854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3003  putative homoserine/threonine efflux protein  34.74 
 
 		 210 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.132575 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1262  leucine export protein LeuE  35.68 
 
 		 219 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00908947  normal  0.254179 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2895  lysine exporter protein LysE/YggA  35.48 
 
 		 210 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4244  lysine exporter protein LysE/YggA  36 
 
 		 212 aa  120  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0024  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.64 
 
 		 208 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6528  lysine exporter protein LysE/YggA  38.21 
 
 		 205 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.28884 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3344  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.88 
 
 		 210 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240621 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5636  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.98 
 
 		 211 aa  120  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0625165 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8095  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.42 
 
 		 225 aa  119  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1992  lysine exporter protein LysE/YggA  34.34 
 
 		 206 aa  118  6e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2255  lysine exporter protein LysE/YggA  33.95 
 
 		 210 aa  118  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674089 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1845  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.77 
 
 		 212 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1886  leucine export protein LeuE  30.77 
 
 		 212 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1835  leucine export protein LeuE  30.77 
 
 		 212 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.966652  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2524  leucine export protein LeuE  30.29 
 
 		 212 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2194  leucine export protein LeuE  36.45 
 
 		 223 aa  117  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.250499  normal  0.121922 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1168  leucine export protein LeuE  34.74 
 
 		 223 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.950564  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01768  neutral amino-acid efflux system  29.81 
 
 		 212 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2029  leucine export protein LeuE  37.09 
 
 		 219 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1147  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.11 
 
 		 208 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01756  hypothetical protein  29.81 
 
 		 212 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1390  leucine export protein LeuE  30.29 
 
 		 212 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.547214  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0827  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.31 
 
 		 210 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.282435 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2024  leucine export protein LeuE  30.29 
 
 		 212 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000174933  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1359  leucine export protein LeuE  29.95 
 
 		 212 aa  116  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0105441  normal  0.312431 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1385  LysE family amino acid efflux protein  38.34 
 
 		 213 aa  116  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.159501  normal  0.0685235 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2711  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.78 
 
 		 210 aa  115  3e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.223328  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0757  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.31 
 
 		 288 aa  116  3e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.935383  normal  0.0580671 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2092  leucine export protein LeuE  29.95 
 
 		 212 aa  115  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0133634  hitchhiker  0.00000159654 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1911  leucine export protein LeuE  29.95 
 
 		 212 aa  115  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000808789  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4433  leucine export protein LeuE  35.68 
 
 		 219 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0518339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3282  lysine exporter protein LysE/YggA  34.56 
 
 		 210 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.541526 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3884  lysine exporter protein LysE/YggA  36.82 
 
 		 215 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>