31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3370 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3370  hypothetical protein  100 
 
 		 123 aa  241  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.335239 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2546  hypothetical protein  87.8 
 
 		 123 aa  182  9e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.474537  decreased coverage  0.00618755 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3169  hypothetical protein  89.43 
 
 		 123 aa  166  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2217  hypothetical protein  83.33 
 
 		 136 aa  157  5e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.409261 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20280  hypothetical protein  70.18 
 
 		 121 aa  145  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.333652  normal  0.366346 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3300  hypothetical protein  66.39 
 
 		 128 aa  140  7e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3754  hypothetical protein  63.78 
 
 		 126 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.05576 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1243  hypothetical protein  62.5 
 
 		 123 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.833895  normal  0.479275 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35010  hypothetical protein  59.66 
 
 		 119 aa  134  3.0000000000000003e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0381514  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1626  hypothetical protein  62.83 
 
 		 125 aa  131  3e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.341963  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2757  hypothetical protein  54.17 
 
 		 134 aa  122  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.718868  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1743  hypothetical protein  71.57 
 
 		 122 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4875  hypothetical protein  49.58 
 
 		 142 aa  115  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.701798 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3110  hypothetical protein  48.65 
 
 		 120 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3285  hypothetical protein  52.63 
 
 		 120 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2578  hypothetical protein  47.9 
 
 		 119 aa  100  7e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000124522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1613  hypothetical protein  42.62 
 
 		 121 aa  97.4  6e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000288043  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1113  hypothetical protein  46.09 
 
 		 123 aa  94.4  4e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0429  hypothetical protein  46.53 
 
 		 125 aa  89.4  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1175  hypothetical protein  43.4 
 
 		 128 aa  79  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0936518  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12081  hypothetical protein  39.81 
 
 		 116 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2134  hypothetical protein  43.48 
 
 		 137 aa  72.4  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.61144  normal  0.708059 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38480  hypothetical protein  36.36 
 
 		 132 aa  72.4  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3164  hypothetical protein  42.7 
 
 		 127 aa  66.6  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00413057  normal  0.13869 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6934  hypothetical protein  38.37 
 
 		 129 aa  62.8  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.772274  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0224  hypothetical protein  24.32 
 
 		 120 aa  57.8  0.00000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000354158  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2574  hypothetical protein  37.76 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1176  hypothetical protein  38.14 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0740486  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2166  hypothetical protein  37.89 
 
 		 132 aa  51.6  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2022  hypothetical protein  33.33 
 
 		 125 aa  52  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3704  hypothetical protein  34.74 
 
 		 146 aa  44.3  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.385221 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>