More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3366 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3366  hypothetical protein  100 
 
 		 237 aa  485  1e-136  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.699657  normal  0.467325 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2550  hypothetical protein  98.31 
 
 		 237 aa  478  1e-134  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.390667  decreased coverage  0.00627186 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3165  hypothetical protein  98.31 
 
 		 237 aa  478  1e-134  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2221  hypothetical protein  94.94 
 
 		 236 aa  437  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3677  hypothetical protein  77.45 
 
 		 234 aa  371  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3178  hypothetical protein  75.74 
 
 		 233 aa  358  3e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.235776 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0382  hypothetical protein  71.06 
 
 		 237 aa  353  1e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.681475  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3561  hypothetical protein  70.64 
 
 		 237 aa  353  2e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.200071  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18190  hypothetical protein  73.31 
 
 		 232 aa  347  1e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3028  hypothetical protein  73.19 
 
 		 234 aa  336  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.154556 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2376  hypothetical protein  65.53 
 
 		 237 aa  336  1.9999999999999998e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2928  hypothetical protein  67.23 
 
 		 237 aa  336  1.9999999999999998e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.732932  normal  0.848921 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1700  hypothetical protein  66.67 
 
 		 234 aa  322  5e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3162  hypothetical protein  70.64 
 
 		 234 aa  321  6e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0308091  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3517  hypothetical protein  62.87 
 
 		 233 aa  303  2.0000000000000002e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000201859  normal  0.326196 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3172  hypothetical protein  44.63 
 
 		 243 aa  176  3e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0624  hypothetical protein  44.96 
 
 		 244 aa  169  3e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0655  hypothetical protein  42.13 
 
 		 248 aa  162  6e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0743  hypothetical protein  42.44 
 
 		 247 aa  161  9e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000326938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0958  protein of unknown function DUF28  41.42 
 
 		 252 aa  160  1e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0577  hypothetical protein  41.7 
 
 		 248 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.236121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2308  hypothetical protein  41.7 
 
 		 248 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.431489  normal  0.117154 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1487  hypothetical protein  43.64 
 
 		 247 aa  158  8e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000223264  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1416  hypothetical protein  42.37 
 
 		 247 aa  157  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000254749  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2335  hypothetical protein  42.98 
 
 		 248 aa  157  1e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000225431  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0165  hypothetical protein  41.49 
 
 		 250 aa  157  1e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0933  hypothetical protein  42.37 
 
 		 247 aa  157  1e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000814789 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1074  hypothetical protein  42.02 
 
 		 247 aa  157  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.414553  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1643  hypothetical protein  41.67 
 
 		 250 aa  157  2e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1449  hypothetical protein  40.93 
 
 		 246 aa  156  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0371  hypothetical protein  41.1 
 
 		 246 aa  157  2e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00064064  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3313  hypothetical protein  41.42 
 
 		 247 aa  155  4e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1905  hypothetical protein  41.28 
 
 		 246 aa  155  4e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.192843 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2673  hypothetical protein  40.43 
 
 		 247 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000969674  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2629  hypothetical protein  39.66 
 
 		 251 aa  155  6e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.404447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3631  hypothetical protein  42.36 
 
 		 248 aa  154  9e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2641  hypothetical protein  43.67 
 
 		 248 aa  154  9e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1893  hypothetical protein  40.85 
 
 		 246 aa  154  1e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.519482  normal  0.766951 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1269  hypothetical protein  44.49 
 
 		 249 aa  153  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.196217  normal  0.639481 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3911  protein of unknown function DUF28  40.76 
 
 		 249 aa  153  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.662224  normal  0.0433199 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0060  hypothetical protein  42.44 
 
 		 250 aa  153  2.9999999999999998e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0149328  normal  0.895421 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0059  hypothetical protein  42.44 
 
 		 250 aa  153  2.9999999999999998e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.852085  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1200  hypothetical protein  43.53 
 
 		 248 aa  152  4e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1717  hypothetical protein  42.67 
 
 		 248 aa  152  5e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1660  hypothetical protein  42.67 
 
 		 248 aa  152  5e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0657  hypothetical protein  41.25 
 
 		 250 aa  151  7e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.384968  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1245  hypothetical protein  41.1 
 
 		 247 aa  151  7e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.136267  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0475  hypothetical protein  39.17 
 
 		 250 aa  151  8e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0839  DNA-binding regulatory protein, YebC/PmpR family  43.39 
 
 		 252 aa  150  1e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0538  hypothetical protein  40.42 
 
 		 250 aa  151  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3179  protein of unknown function DUF28  38.91 
 
 		 250 aa  150  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12350  hypothetical protein  39.75 
 
 		 253 aa  150  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.242675  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36720  hypothetical protein  42.13 
 
 		 249 aa  150  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0508  hypothetical protein  41.28 
 
 		 246 aa  150  2e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0137  hypothetical protein  39.57 
 
 		 248 aa  149  3e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.153689  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3214  hypothetical protein  43.48 
 
 		 248 aa  149  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1106  hypothetical protein  41.35 
 
 		 252 aa  149  5e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3509  hypothetical protein  43.48 
 
 		 248 aa  149  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.208978 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0454  hypothetical protein  41.6 
 
 		 253 aa  148  7e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.588948  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0496  hypothetical protein  39.66 
 
 		 250 aa  148  9e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.813063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0469  hypothetical protein  41.35 
 
 		 253 aa  148  9e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0536  hypothetical protein  42.02 
 
 		 245 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.297552  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2524  hypothetical protein  38.59 
 
 		 246 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.4403  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003925  hypothetical protein  40.25 
 
 		 248 aa  146  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00219055  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1371  protein of unknown function DUF28  40.34 
 
 		 252 aa  147  2.0000000000000003e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.82714  normal  0.0256064 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3192  hypothetical protein  42.92 
 
 		 249 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4544  hypothetical protein  41.7 
 
 		 248 aa  146  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.528574  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1899  hypothetical protein  39.66 
 
 		 248 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000661567  hitchhiker  0.000893936 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2079  hypothetical protein  39.66 
 
 		 248 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00551786  hitchhiker  0.0017448 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1954  hypothetical protein  39.66 
 
 		 248 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.04417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0924  hypothetical protein  38.17 
 
 		 246 aa  145  5e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2722  hypothetical protein  38.98 
 
 		 240 aa  145  5e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1220  hypothetical protein  39.83 
 
 		 248 aa  145  6e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0163  hypothetical protein  40.52 
 
 		 248 aa  145  6e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2018  protein of unknown function DUF28  40.25 
 
 		 245 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.687235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51810  hypothetical protein  41.28 
 
 		 248 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73043  hitchhiker  0.0000547975 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2492  hypothetical protein  40.08 
 
 		 250 aa  144  9e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2114  hypothetical protein  40.52 
 
 		 248 aa  144  9e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.308852  normal  0.355584 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2779  hypothetical protein  40.25 
 
 		 247 aa  144  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0375824  normal  0.0326422 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2433  hypothetical protein  40.33 
 
 		 253 aa  144  1e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0450  hypothetical protein  42.5 
 
 		 251 aa  144  1e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01835  hypothetical protein  39.57 
 
 		 246 aa  144  2e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712982  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1776  protein of unknown function DUF28  39.15 
 
 		 246 aa  143  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00344475  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2094  hypothetical protein  39.57 
 
 		 246 aa  144  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00559066  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2432  hypothetical protein  39.66 
 
 		 248 aa  144  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3380  hypothetical protein  39 
 
 		 255 aa  144  2e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2600  hypothetical protein  39.57 
 
 		 246 aa  144  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.21652  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01823  hypothetical protein  39.57 
 
 		 246 aa  144  2e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.562952  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1322  hypothetical protein  39.57 
 
 		 246 aa  144  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1842  hypothetical protein  39.66 
 
 		 248 aa  143  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.302719 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1957  hypothetical protein  39.57 
 
 		 246 aa  144  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.522715  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1768  hypothetical protein  39.15 
 
 		 246 aa  143  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2365  hypothetical protein  39.24 
 
 		 247 aa  143  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00180131  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2215  hypothetical protein  39.92 
 
 		 243 aa  142  3e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0612934 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1108  hypothetical protein  39.15 
 
 		 246 aa  143  3e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4171  hypothetical protein  40.52 
 
 		 248 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.265987  normal  0.79352 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1103  hypothetical protein  36.82 
 
 		 243 aa  142  3e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000610466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1368  hypothetical protein  37.55 
 
 		 251 aa  142  4e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.251758 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1276  hypothetical protein  36.21 
 
 		 243 aa  142  5e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2039  hypothetical protein  40.66 
 
 		 248 aa  142  5e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000194196  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>