91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3341 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3341  hypothetical protein  100 
 
 		 353 aa  700    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1565  monooxygenase, putative  60.52 
 
 		 352 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.519738  hitchhiker  0.000170358 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7801  hypothetical protein  61.42 
 
 		 368 aa  392  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1550  hypothetical protein  40.18 
 
 		 347 aa  245  9e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00115977  normal  0.0339055 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2606  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  43.36 
 
 		 348 aa  235  8e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.35467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3987  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  42.73 
 
 		 348 aa  233  5e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.106064 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3532  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  42.73 
 
 		 348 aa  233  5e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.304569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2602  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  41.3 
 
 		 358 aa  229  5e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3536  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  41.89 
 
 		 354 aa  229  7e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0480036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3983  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  41.59 
 
 		 354 aa  227  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.502517  normal  0.156548 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3989  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  40.92 
 
 		 358 aa  223  4e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.104406 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3530  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  40.92 
 
 		 358 aa  223  4e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.033604  normal  0.927318 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2525  hypothetical protein  36.72 
 
 		 360 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5652  hypothetical protein  38.62 
 
 		 344 aa  219  3.9999999999999997e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.34266  normal  0.777199 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2608  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  40.06 
 
 		 358 aa  219  6e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.300884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7180  desulfurizing enzyme  37.28 
 
 		 344 aa  214  9.999999999999999e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.857064  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3347  hypothetical protein  37.35 
 
 		 352 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1546  hypothetical protein  35.17 
 
 		 355 aa  211  1e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.062934 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3346  hypothetical protein  39.4 
 
 		 354 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0147  putative desulfurizing enzyme  38.81 
 
 		 354 aa  210  3e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.975202  normal  0.633025 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5654  hypothetical protein  37.01 
 
 		 346 aa  204  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.235146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1391  hypothetical protein  40.06 
 
 		 319 aa  200  3e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000110401  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3816  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  42.39 
 
 		 344 aa  191  1e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.442978 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1041  desulfurizing enzyme  39.71 
 
 		 302 aa  141  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.460145 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3874  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.2 
 
 		 343 aa  66.6  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7220  ABC transporter substrate binding protein (aliphatic sulfonate)  31.47 
 
 		 322 aa  62.4  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0943127  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2895  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  31.31 
 
 		 324 aa  62  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.528553  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0115  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  30.93 
 
 		 328 aa  59.7  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.991586 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2920  putative sulfonate ABC transporter, sulfonate-binding protein  23.89 
 
 		 328 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.10374e-18 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2921  sulfonate ABC transporter sulfonate-binding protein  23.89 
 
 		 328 aa  58.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0777  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  33.33 
 
 		 322 aa  58.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2664  alkanesulfonates-binding protein  23.57 
 
 		 328 aa  58.5  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.760849  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2713  sulfonate ABC transporter sulfonate-binding protein  23.89 
 
 		 328 aa  58.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.38086  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2312  putative sulfonate ABC transporter, sulfonate-binding protein  23.89 
 
 		 328 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.355114  hitchhiker  0.0000000431055 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2960  sulfonate ABC transporter, sulfonate-binding protein, putative  23.89 
 
 		 328 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.641077  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2967  putative sulfonate ABC transporter, sulfonate-binding protein  23.89 
 
 		 328 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.588828  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2641  alkanesulfonates-binding protein  23.89 
 
 		 328 aa  56.6  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.245447  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3007  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  27.22 
 
 		 322 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.7861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1999  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.97 
 
 		 331 aa  55.1  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2931  putative sulfonate ABC transporter, sulfonate-binding protein  23.25 
 
 		 328 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7503  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein, aliphatic sulphonates  26.59 
 
 		 353 aa  53.5  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00283351  normal  0.871735 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0767  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  31.55 
 
 		 322 aa  53.1  0.000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.250566 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0425  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplasmic ligand-binding protein  32.8 
 
 		 348 aa  52.8  0.000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.313806  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1383  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplasmic ligand-binding protein  34.55 
 
 		 349 aa  52.8  0.000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0150888 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4036  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.51 
 
 		 330 aa  52.4  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.110095 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7647  putative sulfonate ABC transporter, periplasmic binding protein  32.22 
 
 		 324 aa  52  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.640067 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3337  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  33.83 
 
 		 326 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.181277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1573  extracellular solute-binding protein  23.12 
 
 		 326 aa  52  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.817202  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2622  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  33.56 
 
 		 341 aa  50.8  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000404129  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3886  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  22.62 
 
 		 374 aa  50.8  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0267  sulfate ester transport system substrate-binding protein  24.39 
 
 		 353 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.173265  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6753  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  31.82 
 
 		 330 aa  50.8  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0691662 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6519  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  31.82 
 
 		 330 aa  50.8  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2952  NMT1/THI5 like domain protein  28.19 
 
 		 318 aa  50.4  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6342  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  31.82 
 
 		 330 aa  50.8  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3439  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  29.67 
 
 		 345 aa  49.7  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3484  twin-arginine translocation pathway signal:ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  43.68 
 
 		 327 aa  49.3  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0224965  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4455  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  42.53 
 
 		 313 aa  48.9  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.568773  normal  0.625935 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4589  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  42.53 
 
 		 313 aa  48.9  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.838268 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02360  putative binding protein component of ABC transporter  23.84 
 
 		 353 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000681113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0967  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  24.23 
 
 		 314 aa  48.5  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00256112 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2507  ABC transporter substrate-binding protein  31.36 
 
 		 334 aa  47.8  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.553979  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2788  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.95 
 
 		 336 aa  47  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0498257  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2186  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  30.94 
 
 		 324 aa  46.6  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.589842  normal  0.269946 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30540  putative periplasmic aliphatic sulfonate-binding protein  32.49 
 
 		 318 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.558339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3294  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  31.15 
 
 		 328 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1150  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  58 
 
 		 332 aa  46.2  0.0009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3872  extracellular solute-binding protein family 3  27.71 
 
 		 329 aa  46.2  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1678  hypothetical protein  33.33 
 
 		 334 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.296494  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3228  periplasmic aliphatic sulfonate-binding protein, putative  37.93 
 
 		 321 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.579009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7086  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  28.11 
 
 		 332 aa  44.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19500  hypothetical protein  33.33 
 
 		 334 aa  45.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0825  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  25.11 
 
 		 335 aa  44.3  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.262946  normal  0.791109 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2516  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  30.33 
 
 		 336 aa  44.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.445481  normal  0.551196 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1172  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  41.38 
 
 		 313 aa  44.7  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0629619  normal  0.0181854 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3865  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  35.63 
 
 		 321 aa  44.7  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0721  alkanesulfonate ABC transporter  31.76 
 
 		 345 aa  43.9  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.587353  normal  0.0488805 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19360  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulfonates family  33.76 
 
 		 365 aa  43.9  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.429227  normal  0.813225 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0439  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  33.62 
 
 		 346 aa  43.1  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.257068  normal  0.286027 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1556  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  40.91 
 
 		 328 aa  43.1  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4250  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  30.77 
 
 		 317 aa  43.1  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.125058  normal  0.0898326 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3267  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  30.77 
 
 		 317 aa  43.1  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.731397 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2061  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  30.15 
 
 		 355 aa  43.1  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0563567  normal  0.28199 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2838  twin-arginine translocation pathway signal  28.05 
 
 		 318 aa  43.1  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.884222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4116  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  30.77 
 
 		 317 aa  43.1  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.723901  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0413  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  30.39 
 
 		 324 aa  42.7  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.523769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1965  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  35.63 
 
 		 320 aa  42.7  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0136316 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4895  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  38.78 
 
 		 313 aa  42.7  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0251  putative sulfonate binding protein precursor  38.68 
 
 		 346 aa  42.7  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0334  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  31 
 
 		 324 aa  42.7  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.316546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0381  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  31 
 
 		 324 aa  42.7  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.996496 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>