More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3322 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3322  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 828 aa  1701    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2861  ferrichrome-iron receptor  44.73 
 
 		 808 aa  638    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.331625  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  38.58 
 
 		 833 aa  542  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6086  TonB-dependent siderophore receptor  39.12 
 
 		 829 aa  531  1e-149  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0747  TonB-dependent siderophore receptor  38.8 
 
 		 806 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0576  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  39.25 
 
 		 806 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  39.03 
 
 		 778 aa  502  1e-140  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06160  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  38.32 
 
 		 797 aa  497  1e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.616824  normal  0.0240396 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2772  TonB-dependent receptor  38.85 
 
 		 794 aa  491  1e-137  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.600395  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4852  TonB-dependent siderophore receptor  37.95 
 
 		 810 aa  490  1e-137  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0121  TonB-dependent siderophore receptor  37.75 
 
 		 797 aa  488  1e-136  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1319  TonB-dependent siderophore receptor  39.52 
 
 		 740 aa  488  1e-136  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000200525  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32740  TonB-dependent receptor  39.09 
 
 		 820 aa  486  1e-136  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.014522  hitchhiker  0.000022757 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2920  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor signal peptide protein  38.49 
 
 		 801 aa  485  1e-135  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0160  TonB-dependent siderophore receptor  37.38 
 
 		 828 aa  481  1e-134  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  hitchhiker  0.000124393 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0378  TonB-dependent siderophore receptor  37.44 
 
 		 810 aa  482  1e-134  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.177868 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0179  TonB-dependent siderophore receptor  37.35 
 
 		 828 aa  476  1e-133  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.267617 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5189  TonB-dependent siderophore receptor  37.07 
 
 		 808 aa  473  1e-132  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.435834  normal  0.330016 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1976  TonB-dependent siderophore receptor  38.1 
 
 		 829 aa  474  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0178  TonB-dependent siderophore receptor  36.7 
 
 		 828 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1491  TonB-dependent siderophore receptor  38.26 
 
 		 717 aa  472  1.0000000000000001e-131  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000036194  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0350  TonB-dependent siderophore receptor  36.62 
 
 		 810 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6866  TonB-dependent siderophore receptor  39.48 
 
 		 748 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0376  TonB-dependent siderophore receptor  36.77 
 
 		 810 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.319241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2675  TonB-dependent siderophore receptor  38.33 
 
 		 802 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3979  ferrichrome outer membrane transporter  39.27 
 
 		 729 aa  457  1e-127  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1826  TonB-dependent siderophore receptor  38.43 
 
 		 779 aa  457  1e-127  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.605271  normal  0.34402 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3043  TonB-dependent siderophore receptor  36.98 
 
 		 819 aa  455  1.0000000000000001e-126  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.635062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3270  TonB-dependent siderophore receptor  37.7 
 
 		 831 aa  453  1.0000000000000001e-126  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0050464 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4752  TonB-dependent siderophore receptor  36.52 
 
 		 799 aa  456  1.0000000000000001e-126  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0186383  normal  0.142458 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2881  TonB-dependent siderophore receptor  36.51 
 
 		 821 aa  448  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196032  normal  0.431289 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3736  TonB-dependent siderophore receptor  37.27 
 
 		 735 aa  444  1e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3613  TonB-dependent siderophore receptor  39.36 
 
 		 789 aa  443  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.187378 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3327  TonB-dependent siderophore receptor  37.95 
 
 		 799 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0142  ferrichrome outer membrane transporter  38.22 
 
 		 729 aa  436  1e-121  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1502  ferrichrome outer membrane transporter  36.51 
 
 		 729 aa  439  1e-121  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0154  ferrichrome outer membrane transporter  37.94 
 
 		 729 aa  436  1e-120  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0209  ferrichrome outer membrane transporter  38.05 
 
 		 703 aa  433  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2395  TonB-dependent siderophore receptor  36.5 
 
 		 812 aa  434  1e-120  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0162  ferrichrome outer membrane transporter  37.12 
 
 		 752 aa  434  1e-120  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1079  TonB-dependent siderophore receptor  37.98 
 
 		 714 aa  434  1e-120  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.181404  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0220  ferrichrome outer membrane transporter  37.99 
 
 		 729 aa  433  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.874732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0208  ferrichrome outer membrane transporter  38.05 
 
 		 703 aa  433  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00149  ferrichrome outer membrane transporter  36.86 
 
 		 747 aa  430  1e-119  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.145506  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3509  ferrichrome outer membrane transporter  36.86 
 
 		 747 aa  430  1e-119  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0167136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0160  ferrichrome outer membrane transporter  37 
 
 		 747 aa  431  1e-119  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00148  hypothetical protein  37.19 
 
 		 745 aa  429  1e-119  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.140481  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0690  ferrichrome outer membrane transporter  35.06 
 
 		 747 aa  427  1e-118  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0227  ferrichrome outer membrane transporter  36.27 
 
 		 747 aa  429  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.71013  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0224  ferrichrome outer membrane transporter  36.73 
 
 		 747 aa  427  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.969953  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22630  TonB-dependent siderophore receptor protein  36.68 
 
 		 799 aa  423  1e-117  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3452  TonB-dependent siderophore receptor  36.86 
 
 		 747 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.380409  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0155  ferrichrome outer membrane transporter  36.86 
 
 		 747 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3895  TonB-dependent siderophore receptor  36.72 
 
 		 753 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.495237  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3728  TonB-dependent siderophore receptor  38.22 
 
 		 733 aa  416  1e-114  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0317837  normal  0.454435 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1338  TonB-dependent siderophore receptor  35.78 
 
 		 815 aa  411  1e-113  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2415  TonB-dependent siderophore receptor  36.73 
 
 		 738 aa  409  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0592424  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3502  TonB-dependent siderophore receptor  39.07 
 
 		 771 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0943385  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3741  TonB-dependent siderophore receptor  37.64 
 
 		 723 aa  405  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.433802  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3258  TonB-dependent siderophore receptor  36.53 
 
 		 736 aa  401  9.999999999999999e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.875335  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2082  TonB-dependent siderophore receptor  38.42 
 
 		 771 aa  402  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340788  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1178  TonB-dependent siderophore receptor  35.66 
 
 		 741 aa  396  1e-109  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0776508  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2091  TonB-dependent siderophore receptor  35.89 
 
 		 737 aa  399  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.552144  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1945  ferric malleobactin transporter  35.89 
 
 		 753 aa  399  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0342742  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1930  ferric malleobactin transporter  35.89 
 
 		 753 aa  399  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1775  TonB-dependent siderophore receptor  36.52 
 
 		 721 aa  396  1e-109  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.441598 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4365  TonB-dependent siderophore receptor  38.09 
 
 		 769 aa  396  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145999  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2776  TonB-dependent siderophore receptor  35.32 
 
 		 817 aa  395  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.265415  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2192  ferrioxamine B receptor precursor protein  35.92 
 
 		 724 aa  395  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.411084  decreased coverage  0.00773577 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4075  TonB-dependent siderophore receptor  37.21 
 
 		 745 aa  395  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0876  TonB-dependent siderophore receptor  35.66 
 
 		 736 aa  395  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.195373  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0285  TonB-dependent siderophore receptor  35.66 
 
 		 752 aa  395  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0472595  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1622  TonB-dependent siderophore receptor  35.66 
 
 		 736 aa  395  1e-108  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4066  TonB-dependent siderophore receptor  37.57 
 
 		 785 aa  388  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2374  TonB-dependent siderophore receptor  34.17 
 
 		 822 aa  389  1e-106  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.18637  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4121  TonB-dependent siderophore receptor  34.15 
 
 		 791 aa  384  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1644  TonB-dependent siderophore receptor  37.77 
 
 		 745 aa  384  1e-105  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4121  TonB-dependent siderophore receptor  35.95 
 
 		 785 aa  385  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.922703 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4273  TonB-dependent receptor protein  34.31 
 
 		 791 aa  383  1e-105  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.12812  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4602  TonB-dependent siderophore receptor  35.77 
 
 		 784 aa  385  1e-105  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4489  TonB-dependent siderophore receptor  35.82 
 
 		 785 aa  384  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2736  TonB-dependent siderophore receptor  34.87 
 
 		 705 aa  381  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111092 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1619  TonB-dependent siderophore receptor  35.5 
 
 		 754 aa  382  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00285071 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0687  TonB-dependent siderophore receptor  35.07 
 
 		 797 aa  381  1e-104  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.862135  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1164  TonB-dependent siderophore receptor  35.5 
 
 		 754 aa  382  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0408687  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3773  TonB-dependent siderophore receptor  35.57 
 
 		 701 aa  379  1e-104  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1644  TonB-dependent siderophore receptor  35.5 
 
 		 754 aa  382  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.107171  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2654  TonB-dependent siderophore receptor  35.4 
 
 		 757 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0434213 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1594  TonB-dependent siderophore receptor  34.65 
 
 		 734 aa  376  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.000849595  hitchhiker  0.00416618 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3272  TonB-dependent siderophore receptor  35.4 
 
 		 750 aa  375  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.46801  normal  0.424622 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0416  ferrichrome-iron receptor  33.84 
 
 		 696 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345861 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0458  TonB-dependent siderophore receptor  35.11 
 
 		 705 aa  372  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1436  TonB-dependent siderophore receptor  36.96 
 
 		 750 aa  370  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1474  TonB-dependent siderophore receptor  36.49 
 
 		 715 aa  372  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.052337 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4098  TonB-dependent siderophore receptor  36.69 
 
 		 754 aa  372  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7042  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  33.53 
 
 		 689 aa  369  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0458  ferrichrome-iron receptor  33.84 
 
 		 696 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000766311 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3324  TonB-dependent siderophore receptor  36.25 
 
 		 745 aa  369  1e-100  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.177313 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0398  ferrichrome-iron receptor  33.84 
 
 		 698 aa  369  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0404  ferrichrome-iron receptor  33.84 
 
 		 696 aa  366  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000262521 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>