30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3321 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3321  hypothetical protein  100 
 
 		 161 aa  329  9e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2562  hypothetical protein  96.84 
 
 		 161 aa  315  1e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.559467  normal  0.419528 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3153  hypothetical protein  96.84 
 
 		 161 aa  315  1e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.678742  normal  0.723292 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2849  isochorismatase hydrolase  86.54 
 
 		 159 aa  282  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.403126 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1832  hypothetical protein  64.15 
 
 		 163 aa  216  1e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21520  hypothetical protein  64.1 
 
 		 167 aa  214  5e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0847336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5202  hypothetical protein  66.67 
 
 		 161 aa  214  5.9999999999999996e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.730727  normal  0.1349 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4674  hypothetical protein  66.67 
 
 		 161 aa  213  5.9999999999999996e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.533703 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5127  hypothetical protein  58.44 
 
 		 154 aa  183  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.152283 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5205  hypothetical protein  58.17 
 
 		 168 aa  178  2e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4664  hypothetical protein  57.14 
 
 		 154 aa  179  2e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1133  hypothetical protein  37.04 
 
 		 159 aa  89.7  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0774875  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0774  hypothetical protein  34.75 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0101  hypothetical protein  26.02 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0099  hypothetical protein  26.02 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4964  isochorismatase family protein  26.71 
 
 		 181 aa  47  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0356  isochorismatase family protein  26.71 
 
 		 181 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0290  isochorismatase hydrolase  23.97 
 
 		 181 aa  44.7  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0291  isochorismatase hydrolase  24.66 
 
 		 181 aa  43.9  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0311  isochorismatase family protein  23.29 
 
 		 187 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0283  isochorismatase (isochorismatase hydrolase) (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  23.97 
 
 		 187 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0280  isochorismatase (isochorismatase hydrolase) (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  23.29 
 
 		 187 aa  43.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0296  isochorismatase family protein  23.29 
 
 		 187 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0342  isochorismatase family protein  23.97 
 
 		 187 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0383  isochorismatase family protein  23.29 
 
 		 187 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0340  isochorismatase family protein  23.29 
 
 		 187 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2754  isochorismatase hydrolase  29.81 
 
 		 174 aa  41.6  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.609473  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2348  amidase  21.94 
 
 		 180 aa  41.6  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0331088  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2020  Isochorismatase  31.05 
 
 		 327 aa  41.6  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.745871 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0845  isochorismatase hydrolase  30 
 
 		 180 aa  40.4  0.01  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.052747  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>