212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3289 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3289  paraquat-inducible protein A  100 
 
 		 214 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3140  paraquat-inducible protein A  93.69 
 
 		 209 aa  397  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2440  paraquat-inducible protein A  68.78 
 
 		 223 aa  288  3e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226744 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3044  paraquat-inducible protein A  65.83 
 
 		 204 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.123343 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2581  paraquat-inducible protein A  68.78 
 
 		 214 aa  282  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.502508 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6817  paraquat-inducible protein A  55.87 
 
 		 215 aa  240  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.776794 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44080  PqiA family protein  50 
 
 		 208 aa  209  3e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179105  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2534  paraquat-inducible protein A  50.49 
 
 		 224 aa  205  3e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36030  paraquat-inducible protein A  47.96 
 
 		 206 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000103971 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1446  Paraquat-inducible protein A  48.77 
 
 		 207 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.257026  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0650  PqiA family integral membrane protein  45.58 
 
 		 449 aa  198  5e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0149918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2673  paraquat-inducible protein A  48.06 
 
 		 209 aa  198  6e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.44394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4089  paraquat-inducible protein A  46.08 
 
 		 423 aa  196  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.645916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1014  paraquat-inducible protein A  48.48 
 
 		 205 aa  195  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  0.11146 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4564  paraquat-inducible protein A  44.55 
 
 		 207 aa  193  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0708  Paraquat-inducible protein A  49.76 
 
 		 220 aa  192  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.773576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0258  paraquat-inducible protein A  46.63 
 
 		 212 aa  191  5e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0644  paraquat-inducible protein A  44.78 
 
 		 207 aa  191  5e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00578555 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0580  paraquat-inducible protein A  49.49 
 
 		 249 aa  191  6e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0166734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0639  paraquat-inducible protein A  44.06 
 
 		 207 aa  191  6e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.224706 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0402  paraquat-inducible protein A  52.26 
 
 		 213 aa  191  7e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1269  hypothetical protein  47 
 
 		 220 aa  190  1e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62030  paraquat-inducible protein A-like protein  46.94 
 
 		 206 aa  191  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0197125 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2678  paraquat-inducible protein A  47.78 
 
 		 252 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5397  paraquat-inducible protein A  45.92 
 
 		 206 aa  188  5e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.563787  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3999  putative paraquat-inducible protein  51.27 
 
 		 216 aa  187  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.5072 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4781  paraquat-inducible protein A  42.86 
 
 		 207 aa  186  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0611001 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3339  paraquat-inducible protein A  45.62 
 
 		 220 aa  186  3e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3373  paraquat-inducible protein A  45.62 
 
 		 220 aa  186  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0293  paraquat-inducible protein A  45.62 
 
 		 220 aa  185  4e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1155  paraquat-inducible protein A  45.62 
 
 		 220 aa  185  4e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0228  paraquat-inducible protein A  47.12 
 
 		 211 aa  184  8e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0712  paraquat-inducible protein A  47.12 
 
 		 211 aa  184  8e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0679  paraquat-inducible protein A  47.12 
 
 		 211 aa  184  8e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283686  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2894  Paraquat-inducible protein A  50.76 
 
 		 238 aa  183  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.174277  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0627  paraquat-inducible protein A  47.57 
 
 		 209 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3381  putative paraquat-inducible protein  46.8 
 
 		 209 aa  182  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0603  paraquat-inducible protein A  47.09 
 
 		 209 aa  181  7e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3800  paraquat-inducible protein A  46.38 
 
 		 209 aa  180  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3536  PqiA family integral membrane protein  48.54 
 
 		 449 aa  180  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.281669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1999  Paraquat-inducible protein A  48.99 
 
 		 215 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42460  Paraquat-inducible protein A  42.57 
 
 		 207 aa  177  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0518  Paraquat-inducible protein A  43.98 
 
 		 245 aa  170  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0531  Paraquat-inducible protein A  43.52 
 
 		 245 aa  169  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1571  paraquat-inducible protein A  47.26 
 
 		 216 aa  170  2e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02850  hypothetical protein  42.18 
 
 		 426 aa  168  5e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2933  PqiA family integral membrane protein  45.18 
 
 		 423 aa  168  6e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0039  putative paraquat-inducible protein  41.95 
 
 		 220 aa  167  2e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.355976  normal  0.169833 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003029  paraquat-inducible protein A  41.83 
 
 		 401 aa  166  2e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3243  Paraquat-inducible protein A  48.22 
 
 		 212 aa  165  5e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2007  hypothetical protein  46.12 
 
 		 444 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5277  PqiA family integral membrane protein  47.21 
 
 		 460 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5801  PqiA family integral membrane protein  47.69 
 
 		 462 aa  162  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0413945  hitchhiker  0.00262359 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0329  Paraquat-inducible protein A  47.98 
 
 		 210 aa  161  6e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0602  hypothetical protein  47.8 
 
 		 247 aa  161  7e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0796336  normal  0.593328 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3375  paraquat-inducible protein A  45.74 
 
 		 212 aa  160  1e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0541727 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1919  PqiA family integral membrane protein  44.1 
 
 		 427 aa  157  8e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2114  PqiA family integral membrane protein  46.32 
 
 		 426 aa  156  2e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.387585  normal  0.0225112 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1864  PqiA family integral membrane protein  46.32 
 
 		 426 aa  156  3e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0424283 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3510  hypothetical protein  42.11 
 
 		 464 aa  155  5.0000000000000005e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.21998  normal  0.777652 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1462  PqiA family integral membrane protein  41.76 
 
 		 417 aa  154  9e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.103115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1745  PqiA family integral membrane protein  41.26 
 
 		 414 aa  154  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0758068  hitchhiker  0.0000336386 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2550  paraquat-inducible protein A  40.76 
 
 		 428 aa  152  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.731619  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1989  paraquat-inducible protein A  40.76 
 
 		 428 aa  152  2.9999999999999998e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1351  paraquat-inducible protein A  41.97 
 
 		 434 aa  152  2.9999999999999998e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00603606  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2639  PqiA family integral membrane protein  40.76 
 
 		 428 aa  152  4e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2169  paraquat-inducible protein A  39.18 
 
 		 417 aa  152  4e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000394614  normal  0.228835 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1114  paraquat-inducible protein A  39.18 
 
 		 417 aa  152  4e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0100863  normal  0.917256 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0365  PqiA family integral membrane protein  42.47 
 
 		 415 aa  152  5e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1651  integral membrane protein, PqiA family  39.15 
 
 		 422 aa  152  5e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4852  PqiA family integral membrane protein  42.47 
 
 		 415 aa  151  8e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000220019 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1682  integral membrane protein, PqiA family  42.05 
 
 		 422 aa  151  8e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00954  paraquat-inducible membrane protein A  38.66 
 
 		 417 aa  150  2e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000174021  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1172  paraquat-inducible protein A  40.68 
 
 		 417 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.718604  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2693  integral membrane protein, PqiA family  38.66 
 
 		 417 aa  150  2e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.098958  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3076  PqiA family integral membrane protein  43.35 
 
 		 405 aa  150  2e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1059  paraquat-inducible protein A  38.66 
 
 		 417 aa  150  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000508779  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2721  hypothetical protein  43.68 
 
 		 413 aa  150  2e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1138  paraquat-inducible protein A  40.68 
 
 		 417 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.946739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1705  PqiA family integral membrane protein  46.15 
 
 		 402 aa  150  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1021  paraquat-inducible protein A  40.68 
 
 		 417 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00323586  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2367  paraquat-inducible protein A  38.66 
 
 		 417 aa  150  2e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.658309  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1126  Pqi5  40.68 
 
 		 417 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.865331  normal  0.906807 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00961  hypothetical protein  38.66 
 
 		 417 aa  150  2e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000262211  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1065  paraquat-inducible protein A  38.66 
 
 		 417 aa  150  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000565994  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2646  PqiA family integral membrane protein  38.66 
 
 		 417 aa  150  2e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00999711  hitchhiker  0.00049713 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1104  paraquat-inducible protein A  40.68 
 
 		 417 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.163733 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3327  paraquat-inducible protein A  37.11 
 
 		 201 aa  149  3e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.695464  normal  0.406152 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1793  integral membrane protein, PqiA family  42.05 
 
 		 458 aa  148  7e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2066  integral membrane protein, PqiA family  43.02 
 
 		 448 aa  147  9e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1324  integral membrane protein, PqiA family  38.05 
 
 		 489 aa  146  2.0000000000000003e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.153858  normal  0.426119 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2693  paraquat-inducible protein A  44.78 
 
 		 219 aa  146  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02655  integral membrane protein, PqiA family  42.7 
 
 		 380 aa  144  7.0000000000000006e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.399105  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2073  PqiA family integral membrane protein  42.35 
 
 		 406 aa  142  3e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.225141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1570  paraquat-inducible protein A  38.97 
 
 		 204 aa  139  3e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1108  hypothetical protein  41.18 
 
 		 419 aa  139  3.9999999999999997e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000845315  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1540  paraquat-inducible membrane protein A  38.12 
 
 		 408 aa  137  8.999999999999999e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.541735  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5823  paraquat-inducible protein A  33.51 
 
 		 401 aa  124  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.166267  normal  0.696161 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1668  paraquat-inducible protein A  34.9 
 
 		 205 aa  122  5e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00504081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1743  paraquat-inducible protein A  34.9 
 
 		 205 aa  122  5e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.917956  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>