10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3277 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3277  hypothetical protein  100 
 
 		 51 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.878206 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2580  hypothetical protein  86.27 
 
 		 51 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3136  hypothetical protein  88.24 
 
 		 51 aa  87  8e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2863  hypothetical protein  76.6 
 
 		 59 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.327982 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2391  hypothetical protein  68.89 
 
 		 54 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.595265  hitchhiker  0.00196894 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2649  hypothetical protein  59.57 
 
 		 65 aa  50.8  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000100004  normal  0.0307301 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000079  hypothetical protein  53.85 
 
 		 63 aa  50.8  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.231186  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05692  hypothetical protein  56.52 
 
 		 62 aa  46.2  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1178  hypothetical protein  69.23 
 
 		 53 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.121521 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1408  hypothetical protein  46.55 
 
 		 67 aa  41.2  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>