More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3263 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_4505  uracil-xanthine permease  75.55 
 
 		 505 aa  735    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.552965  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4643  xanthine/uracil permease family protein  75.75 
 
 		 505 aa  735    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.422723 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3209  xanthine permease  71.88 
 
 		 501 aa  662    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0795  xanthine permease  75.55 
 
 		 505 aa  741    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.868998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0163  uracil-xanthine permease  80.66 
 
 		 503 aa  776    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4854  xanthine permease  67.99 
 
 		 497 aa  637    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1871  xanthine/uracil permease  78.09 
 
 		 506 aa  743    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.168569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0967  uracil-xanthine permease  73.47 
 
 		 496 aa  678    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3263  xanthine permease  100 
 
 		 501 aa  986    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.480223  normal  0.169511 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1300  uracil-xanthine permease  73.01 
 
 		 493 aa  694    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26050  putative transporter  80.85 
 
 		 485 aa  729    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.940504 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2224  putative transporter  81.2 
 
 		 509 aa  758    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3428  uracil-xanthine permease  71.99 
 
 		 500 aa  664    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4637  xanthine permease  75 
 
 		 505 aa  735    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08240  uracil-xanthine permease  60.98 
 
 		 566 aa  580  1e-164  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0249  xanthine permease  51.22 
 
 		 487 aa  422  1e-117  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0717  xanthine permease  45.49 
 
 		 502 aa  390  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1670  xanthine permease  47.03 
 
 		 460 aa  385  1e-105  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2599  uracil-xanthine permease  51.18 
 
 		 459 aa  383  1e-105  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.765117  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2840  uracil-xanthine permease  49.21 
 
 		 458 aa  383  1e-105  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2478  uracil-xanthine permease  48.18 
 
 		 431 aa  382  1e-104  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000102506  decreased coverage  0.00126456 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0266  xanthine permease  49.4 
 
 		 489 aa  378  1e-103  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2436  xanthine/uracil permease  45.87 
 
 		 482 aa  368  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.120352  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0883  uracil-xanthine permease  45.87 
 
 		 468 aa  367  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.244227  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4183  xanthine permease  45.62 
 
 		 475 aa  361  2e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4071  xanthine permease  45.62 
 
 		 475 aa  361  2e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2057  xanthine permease  45.17 
 
 		 444 aa  361  2e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0614609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0683  xanthine/uracil permease family protein  43.58 
 
 		 457 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.355729  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3824  putative transporter  45.73 
 
 		 455 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.208531  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1021  putative permease protein  44.39 
 
 		 457 aa  356  5e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0317497  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0858  xanthine permease  44.39 
 
 		 457 aa  356  5e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44950  putative transporter  45.5 
 
 		 455 aa  356  6.999999999999999e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0863  xanthine permease  44.39 
 
 		 479 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2047  purine permease  47.27 
 
 		 465 aa  354  2e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.679547  normal  0.900156 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2118  putative xanthine permease transmembrane protein  45.13 
 
 		 468 aa  353  5e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.261398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1701  xanthine/uracil permease  46.01 
 
 		 452 aa  352  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.226413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3255  xanthine permease  43.92 
 
 		 469 aa  349  5e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2526  xanthine permease  43.14 
 
 		 458 aa  349  6e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.10385 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2653  uracil-xanthine permease  43.14 
 
 		 458 aa  349  6e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.139978  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3616  xanthine permease  45.64 
 
 		 451 aa  349  7e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.267738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1996  uracil-xanthine permease  42.48 
 
 		 458 aa  348  9e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0659686  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2606  uracil-xanthine permease  42.48 
 
 		 458 aa  348  9e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.779678  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2258  xanthine permease  44.4 
 
 		 469 aa  348  1e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5937  xanthine/uracil transporter  42.7 
 
 		 458 aa  348  1e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0247365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2630  xanthine permease  42.57 
 
 		 457 aa  348  2e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3941  xanthine permease  42.21 
 
 		 495 aa  348  2e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0162348  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0691  xanthine permease  44.39 
 
 		 458 aa  348  2e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.298309  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4290  xanthine/uracil permease family protein  45.41 
 
 		 451 aa  347  4e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2729  xanthine/uracil permease  43.93 
 
 		 446 aa  346  6e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.562669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1578  uracil-xanthine permease  45.41 
 
 		 451 aa  345  8e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1935  xanthine permease  44.64 
 
 		 469 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39014  normal  0.0274682 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3854  xanthine permease  45.27 
 
 		 451 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00662261  normal  0.542415 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0481  xanthine permease  41.54 
 
 		 471 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0273217 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0711  xanthine/uracil - cation symporter  42.13 
 
 		 469 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1691  xanthine permease  40.75 
 
 		 466 aa  336  5e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0626617 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2010  xanthine permease  40.75 
 
 		 466 aa  336  5.999999999999999e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0376042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1127  xanthine permease  42.16 
 
 		 465 aa  336  7e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2911  uracil-xanthine permease  41.38 
 
 		 494 aa  335  9e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.295839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1141  xanthine permease  41 
 
 		 490 aa  327  3e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0261  xanthine permease  41.07 
 
 		 825 aa  326  7e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5248  xanthine permease  45.21 
 
 		 466 aa  325  8.000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0121197 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0633  xanthine/uracil transporter  39.65 
 
 		 457 aa  322  7e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.757735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3140  xanthine permease  40.67 
 
 		 457 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2107  xanthine permease  39.55 
 
 		 495 aa  320  5e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.439445  normal  0.198609 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1340  xanthine permease  42.7 
 
 		 466 aa  318  2e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000141627  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3917  uracil-xanthine permease  41.99 
 
 		 493 aa  317  4e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.51079  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02720  predicted transporter  40.39 
 
 		 482 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.553016  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3213  putative xanthine permease  40.39 
 
 		 482 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0805  xanthine permease  40.39 
 
 		 482 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.568005  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0821  xanthine permease  40.39 
 
 		 482 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02683  hypothetical protein  40.39 
 
 		 482 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.673646  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3020  putative xanthine permease  40.39 
 
 		 525 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3047  putative xanthine permease  40.39 
 
 		 482 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6205  xanthine permease  44.1 
 
 		 463 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1277  uracil-xanthine permease  38.52 
 
 		 496 aa  313  5.999999999999999e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0599203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2917  xanthine permease  40.77 
 
 		 449 aa  312  9e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4177  putative xanthine permease  40.17 
 
 		 525 aa  312  1e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7137  xanthine permease  40.38 
 
 		 446 aa  311  2e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.946612 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3433  xanthine/uracil permease  41.78 
 
 		 451 aa  311  2e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3606  xanthine permease  41.53 
 
 		 457 aa  311  2e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.556926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4001  uracil-xanthine permease  41.94 
 
 		 463 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.787039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3072  xanthine/uracil permease  41.61 
 
 		 463 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.362165  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1034  xanthine permease  38.01 
 
 		 495 aa  307  3e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.581901  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3292  uracil-xanthine permease  43.45 
 
 		 463 aa  306  4.0000000000000004e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.967032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1113  uracil-xanthine permease  37.8 
 
 		 495 aa  303  3.0000000000000004e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4724  xanthine permease  40.48 
 
 		 518 aa  302  1e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0102171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1307  xanthine permease  40.76 
 
 		 499 aa  298  2e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.225701  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2965  xanthine permease  40.64 
 
 		 640 aa  298  2e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.276589  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5275  uracil-xanthine permease  40.09 
 
 		 633 aa  297  3e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03150  uracil-xanthine permease  39.87 
 
 		 647 aa  296  5e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3080  xanthine/uracil permease  39.95 
 
 		 449 aa  288  2e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230022  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2128  uracil-xanthine permease  40.23 
 
 		 450 aa  282  9e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.344536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0536  xanthine/uracil permease  38.81 
 
 		 448 aa  280  4e-74  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000490682  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0228  xanthine/uracil permease  37.53 
 
 		 442 aa  273  5.000000000000001e-72  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000515312  decreased coverage  6.186300000000001e-25 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1826  xanthine permease  37.61 
 
 		 665 aa  272  8.000000000000001e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1266  xanthine/uracil permease  39.9 
 
 		 427 aa  271  2e-71  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0144889  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1828  uracil-xanthine permease  38.39 
 
 		 442 aa  270  5e-71  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3343  xanthine permease  41.61 
 
 		 469 aa  270  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0161  xanthine permease  35.88 
 
 		 451 aa  269  8e-71  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3668  xanthine permease  41.37 
 
 		 469 aa  269  1e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0396635  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>