More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3259 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3259  major facilitator transporter  100 
 
 		 431 aa  863    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0867581 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2142  major facilitator superfamily transporter  77.64 
 
 		 432 aa  666    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.697064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0577  glycerol-3-phosphate transporter  27.45 
 
 		 448 aa  139  7e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1713  sn-glycerol-3-phosphate transporter  26.38 
 
 		 483 aa  132  1.0000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0001  sn-glycerol-3-phosphate transporter  27.25 
 
 		 452 aa  131  3e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000530916  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002677  glycerol-3-phosphate transporter  25.76 
 
 		 454 aa  127  4.0000000000000003e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0556  glycerol-3-phosphate transporter  28.3 
 
 		 449 aa  126  7e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000367094  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03311  sn-glycerol-3-phosphate transporter  26.41 
 
 		 455 aa  125  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69130  sn-glycerol-3-phosphate transporter  27.43 
 
 		 448 aa  125  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5978  sn-glycerol-3-phosphate transporter  27.43 
 
 		 448 aa  124  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.207284  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3268  sn-glycerol-3-phosphate transporter  28.1 
 
 		 446 aa  124  4e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5451  sn-glycerol-3-phosphate transporter  27.82 
 
 		 449 aa  123  6e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00923139 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000089  hexose phosphate uptake regulatory protein UhpC  26.94 
 
 		 446 aa  120  3.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3240  putative regulatory protein UhpC  26.5 
 
 		 445 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.591266 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0790  glycerol-3-phosphate transporter  28.1 
 
 		 449 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000864698  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0575  glycerol-3-phosphate transporter  28.4 
 
 		 449 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0424748  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0729  glycerol-3-phosphate transporter  28.64 
 
 		 449 aa  118  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.221122  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0305  sn-glycerol-3-phosphate transporter  26.99 
 
 		 449 aa  117  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.886958 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0571  glycerol-3-phosphate transporter  28.4 
 
 		 449 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00198632  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3298  sn-glycerol-3-phosphate transporter  26.17 
 
 		 457 aa  117  5e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2870  glycerol-3-phosphate transporter  25.94 
 
 		 445 aa  117  5e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02166  sn-glycerol-3-phosphate transporter  24.5 
 
 		 452 aa  116  7.999999999999999e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1419  glycerol-3-phosphate transporter  24.5 
 
 		 452 aa  116  7.999999999999999e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.833771  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5238  glycerol-3-phosphate transporter  26.74 
 
 		 449 aa  116  7.999999999999999e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2622  sn-glycerol-3-phosphate transporter  24.5 
 
 		 452 aa  116  7.999999999999999e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02125  hypothetical protein  24.5 
 
 		 452 aa  116  7.999999999999999e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2537  sn-glycerol-3-phosphate transporter  24.5 
 
 		 452 aa  116  7.999999999999999e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1411  sn-glycerol-3-phosphate transporter  24.5 
 
 		 452 aa  116  7.999999999999999e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.476503 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2380  sn-glycerol-3-phosphate transporter  24.5 
 
 		 452 aa  116  7.999999999999999e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3377  sn-glycerol-3-phosphate transporter  24.5 
 
 		 452 aa  116  8.999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2392  sn-glycerol-3-phosphate transporter  24.5 
 
 		 452 aa  116  8.999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0572  glycerol-3-phosphate transporter  28.15 
 
 		 449 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00224555  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2474  hypothetical protein  27.12 
 
 		 455 aa  115  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0718  glycerol-3-phosphate transporter  28.15 
 
 		 449 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000170433 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1773  major facilitator superfamily MFS_1  27 
 
 		 441 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1367  major facilitator superfamily MFS_1  26.59 
 
 		 446 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0692  glycerol-3-phosphate transporter  28.15 
 
 		 449 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00296748  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0628  glycerol-3-phosphate transporter  27.9 
 
 		 449 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000215527  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2623  hypothetical protein  27.12 
 
 		 455 aa  115  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0661  glycerol-3-phosphate transporter  27.9 
 
 		 449 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00772133  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2511  sn-glycerol-3-phosphate transporter  24.5 
 
 		 452 aa  114  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2627  sn-glycerol-3-phosphate transporter  24.5 
 
 		 452 aa  114  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.588856 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4646  glycerol-3-phosphate transporter  27.9 
 
 		 449 aa  114  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000791973  unclonable  8.6547e-26 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2523  sn-glycerol-3-phosphate transporter  24.5 
 
 		 452 aa  114  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.791252 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2419  sn-glycerol-3-phosphate transporter  24.5 
 
 		 452 aa  114  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2468  sn-glycerol-3-phosphate transporter  24.5 
 
 		 452 aa  114  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0862405 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0222  glycerol-3-phosphate transporter  24.26 
 
 		 445 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.493626  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0222  glycerol-3-phosphate transporter  24.26 
 
 		 445 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1562  major facilitator transporter  28.21 
 
 		 450 aa  113  5e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796996 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0385  glycerol-3-phosphate transporter  25.71 
 
 		 452 aa  113  6e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000112087  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0395  glycerol-3-phosphate transporter  25.71 
 
 		 452 aa  113  6e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0536129  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0646  putative regulatory protein UhpC  25.64 
 
 		 459 aa  113  8.000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4149  sn-glycerol-3-phosphate transporter  24.25 
 
 		 449 aa  113  8.000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000087639  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4032  regulatory protein UhpC  26.68 
 
 		 439 aa  112  9e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.47751 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0199  sn-glycerol-3-phosphate transporter  23.75 
 
 		 451 aa  112  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.140488  normal  0.0295712 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03551  membrane protein regulates uhpT expression  26.68 
 
 		 439 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0036  phosphoglycerate transporter  26.68 
 
 		 439 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0831  GlpT/PgpT/UhpT family protein  25.08 
 
 		 456 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.571145  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0032  regulatory protein UhpC  26.68 
 
 		 439 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03493  hypothetical protein  26.68 
 
 		 439 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4252  regulatory protein UhpC  26.68 
 
 		 439 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4175  regulatory protein UhpC  26.68 
 
 		 439 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3880  regulatory protein UhpC  26.68 
 
 		 439 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5097  regulatory protein UhpC  26.68 
 
 		 439 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.113676 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2804  sn-glycerol-3-phosphate transporter  24.25 
 
 		 450 aa  112  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.42488  normal  0.676266 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0225  sn-glycerol-3-phosphate transporter  24.75 
 
 		 450 aa  110  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3958  sn-glycerol-3-phosphate transporter  24 
 
 		 449 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00220837  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0511  glycerol 3-phosphate transporter  24.94 
 
 		 481 aa  110  7.000000000000001e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000061877  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0247  sn-glycerol-3-phosphate transporter  24.52 
 
 		 450 aa  110  7.000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0274937  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5381  phosphoglycerate transporter family protein  25.24 
 
 		 444 aa  108  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0199  sn-glycerol-3-phosphate transporter  25.06 
 
 		 449 aa  108  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000543007  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5573  phosphoglycerate transporter family protein  25.24 
 
 		 444 aa  107  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2060  glycerol-3-phosphate transporter  25.12 
 
 		 452 aa  107  5e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0640  major facilitator transporter  24.32 
 
 		 480 aa  106  7e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0187826  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5109  phosphoglycerate transporter family protein  25.77 
 
 		 444 aa  106  8e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5500  phosphoglycerate transporter family protein  25.77 
 
 		 444 aa  106  8e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3790  phosphoglycerate transporter  25.31 
 
 		 446 aa  106  9e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5375  phosphoglycerate transporter family protein  26 
 
 		 444 aa  106  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4955  glycerol-3-phosphate transporter  25.77 
 
 		 444 aa  106  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5429  phosphoglycerate transporter family protein  26 
 
 		 444 aa  106  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2682  major facilitator transporter  24.94 
 
 		 447 aa  105  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.874415  normal  0.720259 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2750  major facilitator transporter  24.94 
 
 		 447 aa  105  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4940  glycerol-3-phosphate transporter  24.53 
 
 		 444 aa  105  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5349  phosphoglycerate transporter family protein  26 
 
 		 444 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2540  phosphoglycerate transport: transporter  23.75 
 
 		 463 aa  103  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0134  regulatory protein UhpC  25.84 
 
 		 443 aa  103  8e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2759  phosphoglycerate transporter  23.75 
 
 		 463 aa  103  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2588  phosphoglycerate transport: transporter  23.75 
 
 		 463 aa  103  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2629  phosphoglycerate transport: transporter  23.75 
 
 		 463 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2653  phosphoglycerate transport: transporter  23.75 
 
 		 463 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00132768 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3760  MFS family transporter  27.12 
 
 		 447 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4233  MFS family transporter  29.55 
 
 		 445 aa  100  5e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4130  regulatory protein UhpC  26.15 
 
 		 453 aa  99  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.543128  normal  0.246836 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2484  major facilitator superfamily MFS_1  27.31 
 
 		 437 aa  99.4  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.371428  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0083  regulatory protein UhpC  26.15 
 
 		 443 aa  99.4  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.644662  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4078  regulatory protein UhpC  26.15 
 
 		 443 aa  99.4  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1684  major facilitator superfamily MFS_1  24.88 
 
 		 422 aa  98.2  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.597788  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0834  major facilitator transporter  26.74 
 
 		 433 aa  98.2  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.789702 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5051  phosphoglycerate transporter  23.68 
 
 		 444 aa  95.9  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3680  general substrate transporter  28.93 
 
 		 441 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>