More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3257 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3257  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  100 
 
 
272 aa  534  1e-151  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.814913  normal  0.191415 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3991  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  46.88 
 
 
276 aa  236  3e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.608155  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3240  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  46.88 
 
 
276 aa  236  3e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.655899  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1280  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  46.48 
 
 
276 aa  234  1.0000000000000001e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.61484  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0912  phosphate ABC transporter permease  45.45 
 
 
275 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.166132  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3906  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  45.15 
 
 
277 aa  206  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.482347 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3857  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  45.15 
 
 
277 aa  206  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2888  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  46.35 
 
 
263 aa  206  2e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.117638  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2914  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  46.41 
 
 
269 aa  205  6e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.263053  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1522  phosphonate ABC transporter, permease protein  43.28 
 
 
264 aa  204  1e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0252842  normal  0.0146163 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0132  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  38.96 
 
 
266 aa  202  3e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.734689  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0127  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  38.96 
 
 
266 aa  202  3e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2284  phosphonate ABC transporter, permease protein  38.87 
 
 
266 aa  202  6e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0852833  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3793  phosphonate ABC transporter, permease protein  43.7 
 
 
264 aa  201  8e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.893389  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3473  phosphonate ABC transporter permease  42.91 
 
 
264 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.410084  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3748  phosphonate ABC transporter permease  42.91 
 
 
264 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3744  phosphonate ABC transporter, permease protein  42.52 
 
 
264 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000212765  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3702  phosphonate ABC transporter, permease protein  42.91 
 
 
264 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000191718 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3439  phosphonate ABC transporter, permease  42.91 
 
 
264 aa  200  3e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3390  phosphonate ABC transporter, permease  42.91 
 
 
264 aa  199  3e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0936447  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6089  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  46.29 
 
 
270 aa  199  5e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0307  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  42.15 
 
 
259 aa  198  7e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.685305  normal  0.115805 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4569  phosphonate ABC transporter, permease protein  44.53 
 
 
259 aa  198  7e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0367  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  39.77 
 
 
272 aa  198  9e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3371  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  45.7 
 
 
264 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0022523  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3721  phosphonate ABC transporter, permease protein  42.86 
 
 
264 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.254444  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5616  phosphonate ABC transporter, permease protein  44.98 
 
 
259 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4605  phosphonate ABC transporter, permease protein  45.06 
 
 
259 aa  196  5.000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4344  phosphonate ABC transporter, permease protein  45.06 
 
 
259 aa  195  8.000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03975  phosphonate/organophosphate ester transporter  45.06 
 
 
272 aa  194  9e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3923  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  45.06 
 
 
259 aa  194  1e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2966  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  45.89 
 
 
266 aa  194  1e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1747  phosphonate ABC transporter permease PhnE  47.21 
 
 
264 aa  194  1e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.415612  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20330  phosphonate ABC tranporter permease protein  47.21 
 
 
264 aa  194  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.293398  normal  0.582568 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4657  phosphonate ABC transporter, permease protein  45.06 
 
 
259 aa  194  1e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2338  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  40.38 
 
 
265 aa  192  4e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000033517  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3336  phosphonate ABC transporter, permease protein  46.12 
 
 
271 aa  189  5e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31183  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3302  phosphonate ABC transporter, permease protein  46.12 
 
 
271 aa  189  5e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.314465  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3348  phosphonates ABC transporter, permease protein  45.97 
 
 
271 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4522  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  42.4 
 
 
280 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0837  ABC phosphonate transporter, inner membrane subunit PhnE  43.33 
 
 
280 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0879001 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1319  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  39.1 
 
 
287 aa  188  9e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.758207  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2596  phosphonates ABC transporter, permease protein  45.66 
 
 
271 aa  187  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2409  phosphonates ABC transporter, permease protein  45.66 
 
 
271 aa  187  1e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1187  phosphonates ABC transporter, permease protein  45.66 
 
 
271 aa  187  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0326  phosphonates ABC transporter, permease protein  45.66 
 
 
271 aa  187  1e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0261  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  49.74 
 
 
271 aa  187  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0745614 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4621  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  42.16 
 
 
280 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.438003 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5875  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  43.78 
 
 
277 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0423  ABC type permease  51.87 
 
 
261 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.436548  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0459  ABC type permease  51.87 
 
 
261 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.110388  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2557  phosphonates ABC transporter, permease protein  45.37 
 
 
262 aa  183  3e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.108995  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2249  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  44.93 
 
 
262 aa  183  3e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.859646  normal  0.75616 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0250  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  40.44 
 
 
277 aa  183  3e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.435435  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17510  Phosphonate transport systems inner membrane component  39.16 
 
 
269 aa  181  9.000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.246448  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4996  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  40 
 
 
264 aa  181  1e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0396446  normal 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4151  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  39.66 
 
 
274 aa  180  2.9999999999999997e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2298  ABC phosphonate permease  41.35 
 
 
271 aa  179  4e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2287  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  39.66 
 
 
274 aa  179  4e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3380  putative phosphonate transport system permease protein htxC phnE  43.86 
 
 
273 aa  177  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.590376  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1925  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  39.92 
 
 
272 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.77597  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2081  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  45.96 
 
 
335 aa  176  3e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0183  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  41.56 
 
 
267 aa  176  3e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.685184  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0827  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  40.46 
 
 
267 aa  175  7e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.152622  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0773  phosphonate ABC transporter permease  39.39 
 
 
292 aa  175  8e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.741951  normal  0.989098 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0394  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  42.69 
 
 
679 aa  173  1.9999999999999998e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.417915 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6365  phosphonate ABC transporter, permease component  43.03 
 
 
289 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0563067  normal  0.924702 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4179  phosphonate ABC transporter permease  40.15 
 
 
288 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0216  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  44.95 
 
 
341 aa  172  5.999999999999999e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4036  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  44.95 
 
 
341 aa  172  5.999999999999999e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.311979  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1418  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  41.1 
 
 
266 aa  172  5.999999999999999e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2297  ABC phosphonate permease  42.41 
 
 
268 aa  171  1e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3693  ABC phosphonate transporter inner membrane protein  46.77 
 
 
335 aa  171  1e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0182  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  40.31 
 
 
542 aa  169  5e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2906  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  41.22 
 
 
511 aa  168  8e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00115761  normal  0.0544773 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3326  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  41.94 
 
 
365 aa  168  9e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4995  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  43.13 
 
 
245 aa  168  9e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.250762  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0177  phosphonate ABC transporter permease  37.15 
 
 
264 aa  167  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000132377  normal  0.0614362 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3965  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  39.09 
 
 
272 aa  167  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.692533 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3236  phosphonate ABC transporter permease  38.12 
 
 
276 aa  166  4e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6356  phosphonate ABC transporter, permease protein  38.46 
 
 
298 aa  166  5e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.690717  normal  0.762824 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0131  ABC-type phosphate/phosphonate transport system, permease component  42.27 
 
 
289 aa  166  5.9999999999999996e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0113761  hitchhiker  0.00000772966 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1322  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  40.45 
 
 
533 aa  165  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.497345  normal  0.731542 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0998  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  36.6 
 
 
265 aa  165  9e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2918  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  43.11 
 
 
294 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4086  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  42.49 
 
 
293 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0261465  normal  0.0836049 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11281  hypothetical protein  45.45 
 
 
269 aa  162  5.0000000000000005e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.157869 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2202  phosphonate ABC transporter inner membrane subunit  39.08 
 
 
542 aa  162  6e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1320  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  43.37 
 
 
294 aa  160  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4577  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  41.94 
 
 
271 aa  160  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2185  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  41.35 
 
 
290 aa  160  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.204474  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1451  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  32.46 
 
 
269 aa  160  3e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.349089  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0873  phosphonate ABC transporter inner membrane subunit  35.24 
 
 
265 aa  159  4e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.122179 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1523  phosphonate ABC transporter, permease protein  40.08 
 
 
267 aa  159  4e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0137606  normal  0.0137345 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4203  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  43.66 
 
 
294 aa  159  4e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.852389  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0766  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  40.82 
 
 
293 aa  159  6e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.688417  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2184  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  41.34 
 
 
290 aa  159  6e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.122688  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3792  phosphonate ABC transporter, permease protein  43.69 
 
 
267 aa  159  6e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12521  hypothetical protein  39.51 
 
 
265 aa  159  6e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.285208  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3701  phosphonate ABC transporter, permease protein  43.2 
 
 
267 aa  158  8e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000177586 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>