258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3213 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3213  hypothetical protein  100 
 
 		 246 aa  504  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2108  hypothetical protein  68.98 
 
 		 256 aa  334  5.999999999999999e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.327419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1371  hypothetical protein  70.48 
 
 		 242 aa  305  5.0000000000000004e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.197598 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1036  hypothetical protein  70.67 
 
 		 246 aa  304  8.000000000000001e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.285404  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3692  hypothetical protein  63.85 
 
 		 227 aa  277  1e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3355  hypothetical protein  49.78 
 
 		 262 aa  206  3e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2072  hypothetical protein  48.18 
 
 		 263 aa  201  7e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00109635 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0770  hypothetical protein  45 
 
 		 263 aa  199  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4466  hypothetical protein  44.58 
 
 		 263 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.354651 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3412  hypothetical protein  44.58 
 
 		 268 aa  198  6e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3468  hypothetical protein  46.78 
 
 		 263 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3801  hypothetical protein  49.07 
 
 		 257 aa  196  3e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0321  hypothetical protein  47.17 
 
 		 262 aa  187  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6267  hypothetical protein  42.37 
 
 		 263 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0194247  normal  0.315847 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_6293  predicted protein  46.97 
 
 		 205 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.000494252 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5841  hypothetical protein  44.09 
 
 		 261 aa  182  6e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0980  class II aldolase/adducin-like  41.03 
 
 		 254 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.112638  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2461  hypothetical protein  44.29 
 
 		 244 aa  153  2e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0534  hypothetical protein  38.94 
 
 		 249 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0857  aldolase II superfamily protein  35.9 
 
 		 257 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1369  class II aldolase/adducin family protein  34.05 
 
 		 247 aa  124  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.352769 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3023  hypothetical protein  37.8 
 
 		 249 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.405547 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0893  aldolase II superfamily protein  34.76 
 
 		 256 aa  121  9e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4013  aldolase II superfamily protein  34.63 
 
 		 258 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.60091 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4533  aldolase II superfamily protein  35.06 
 
 		 258 aa  119  6e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.159765 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4074  aldolase II superfamily protein  34.63 
 
 		 258 aa  119  6e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.639944 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19700  aldolase II superfamily protein  36.11 
 
 		 259 aa  118  7e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1652  class II aldolase/adducin-like  37.14 
 
 		 257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.48855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2007  hypothetical protein  31.73 
 
 		 242 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2818  aldolase II superfamily protein  35.5 
 
 		 251 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1696  aldolase II superfamily protein  35.19 
 
 		 259 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5236  class II aldolase/adducin family protein  34.74 
 
 		 282 aa  115  6e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4305  aldolase II superfamily protein  33.82 
 
 		 264 aa  115  6e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2698  aldolase II superfamily protein  34 
 
 		 246 aa  115  7.999999999999999e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1506  class II aldolase/adducin family protein  35.68 
 
 		 252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.443125  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2871  aldolase II superfamily protein  34.83 
 
 		 251 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1406  aldolase II superfamily protein  34.67 
 
 		 256 aa  113  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3368  aldolase II superfamily protein  35.27 
 
 		 259 aa  112  6e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000643093  hitchhiker  0.0000000000000156191 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2707  class II aldolase/adducin family protein  34.29 
 
 		 258 aa  112  6e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0901  aldolase II superfamily protein  31.62 
 
 		 260 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.693732 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3521  aldolase II superfamily protein  33.33 
 
 		 259 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.568287  normal  0.727743 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3131  class II aldolase/adducin family protein  30.96 
 
 		 255 aa  111  9e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.22582  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0438  hypothetical protein  34.29 
 
 		 243 aa  111  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.433605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0672  class II aldolase/adducin family protein  36.11 
 
 		 252 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.999953 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3039  aldolase II superfamily protein  36.45 
 
 		 259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31370  aldolase II superfamily protein  37.31 
 
 		 257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.331304  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0427  class II aldolase/adducin-like  35.35 
 
 		 263 aa  109  5e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.358684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1938  aldolase II superfamily protein  32.9 
 
 		 259 aa  109  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0215875  normal  0.268304 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3687  aldolase II superfamily protein  33.48 
 
 		 257 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3366  class II aldolase/adducin-like  31.84 
 
 		 250 aa  108  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4680  aldolase II superfamily protein  33.48 
 
 		 257 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0426137 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3183  class II aldolase/adducin family protein  35.68 
 
 		 256 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0280906  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0822  aldolase II superfamily protein  33.94 
 
 		 261 aa  106  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0953493  normal  0.275996 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5988  class II aldolase/adducin family protein  32.64 
 
 		 271 aa  105  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2609  class II aldolase/adducin family protein  34.36 
 
 		 257 aa  105  6e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.79052  decreased coverage  0.00794454 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0807  aldolase II superfamily protein  33.81 
 
 		 257 aa  105  6e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3038  aldolase II superfamily protein  32.9 
 
 		 259 aa  105  7e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.774237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01199  class II aldolase/adducin-like protein  32.04 
 
 		 251 aa  105  9e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1139  aldolase II superfamily protein  32.61 
 
 		 258 aa  104  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.8489  normal  0.168164 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7790  hypothetical protein  31.18 
 
 		 263 aa  104  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2055  aldolase II superfamily protein  31.8 
 
 		 260 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0806  aldolase II superfamily protein  33.48 
 
 		 261 aa  103  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.666611  normal  0.411116 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2693  hypothetical protein  32.38 
 
 		 259 aa  103  3e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.717791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1319  aldolase II superfamily protein  33.77 
 
 		 255 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.764419 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1977  putative class II aldolase/adducin  33.01 
 
 		 261 aa  103  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621706  normal  0.451747 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3281  aldolase II superfamily protein  34.69 
 
 		 261 aa  103  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1719  class II aldolase/adducin family protein  34.12 
 
 		 267 aa  102  7e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.174281 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0859  aldolase II superfamily protein  34.26 
 
 		 255 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1340  aldolase II superfamily protein  34.26 
 
 		 255 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0340  aldolase II superfamily protein  31.02 
 
 		 237 aa  101  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.945791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5620  aldolase II superfamily protein  33.02 
 
 		 257 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0279  hypothetical protein  33.01 
 
 		 241 aa  100  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.400085 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5956  aldolase II superfamily protein  35.24 
 
 		 271 aa  100  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.931337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0795  hypothetical protein  31.78 
 
 		 271 aa  100  3e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2788  hypothetical protein  31.46 
 
 		 244 aa  99  6e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0752  aldolase II superfamily protein  32.58 
 
 		 261 aa  98.6  7e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.322405 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0382  aldolase II superfamily protein  30.13 
 
 		 250 aa  98.6  8e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.583518  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3900  aldolase II superfamily protein  31.31 
 
 		 251 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4472  aldolase II superfamily protein  32.77 
 
 		 255 aa  97.8  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0173222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4440  class II aldolase/adducin family protein  32.86 
 
 		 262 aa  97.1  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.140435 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5445  aldolase II superfamily protein  30.22 
 
 		 260 aa  96.7  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0975629  normal  0.0271848 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3892  hypothetical protein  30.28 
 
 		 286 aa  96.3  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2856  aldolase II superfamily protein  31.12 
 
 		 250 aa  96.3  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.180826  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4212  class II aldolase/adducin-like protein  31.8 
 
 		 262 aa  96.3  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2536  aldolase II superfamily protein  35.94 
 
 		 264 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0456669  hitchhiker  0.00862817 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0310  hypothetical protein  32.02 
 
 		 253 aa  95.9  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2494  aldolase II superfamily protein  33.85 
 
 		 258 aa  95.5  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0024  aldolase II superfamily protein  33.85 
 
 		 258 aa  95.5  6e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.178448  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2213  aldolase II superfamily protein  33.85 
 
 		 258 aa  95.5  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2870  aldolase II superfamily protein  33.85 
 
 		 258 aa  95.5  6e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1767  hypothetical protein  30.05 
 
 		 268 aa  95.5  7e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.546797  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1098  aldolase II superfamily protein  30.42 
 
 		 331 aa  95.5  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.674816  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1964  aldolase II superfamily protein  33.49 
 
 		 252 aa  95.1  8e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.467535 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2332  hypothetical protein  29.27 
 
 		 268 aa  95.1  8e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4868  hypothetical protein  29.36 
 
 		 287 aa  95.1  9e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0206045  normal  0.305277 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2703  aldolase II superfamily protein  30.42 
 
 		 322 aa  95.1  9e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0803  aldolase II superfamily protein  33.85 
 
 		 258 aa  95.1  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0518  aldolase II superfamily protein  31.48 
 
 		 258 aa  94.7  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0638  aldolase II superfamily protein  33.85 
 
 		 258 aa  94.7  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4873  aldolase II superfamily protein  33.02 
 
 		 258 aa  94.7  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00795086  normal  0.948884 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>