40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3133 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3133  hypothetical protein  100 
 
 		 392 aa  793    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.637765 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3093  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  93.94 
 
 		 397 aa  671    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1948  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  78.89 
 
 		 391 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.105929  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1278  hypothetical protein  49.59 
 
 		 367 aa  354  2e-96  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2258  hypothetical protein  45.06 
 
 		 400 aa  352  8e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1846  hypothetical protein  45.58 
 
 		 429 aa  335  9e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1797  putative exported protein of unknown function  45.5 
 
 		 427 aa  334  1e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.227031  normal  0.544981 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2181  hypothetical protein  45.3 
 
 		 422 aa  333  4e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.376116 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1891  hypothetical protein  42.97 
 
 		 408 aa  330  2e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.999876  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1858  hypothetical protein  43.9 
 
 		 405 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2664  hypothetical protein  48.86 
 
 		 386 aa  321  1.9999999999999998e-86  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.164078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2721  hypothetical protein  44.62 
 
 		 423 aa  310  2e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.157004 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5945  hypothetical protein  45.76 
 
 		 400 aa  309  5e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5317  hypothetical protein  43.47 
 
 		 424 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0865725  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2412  hypothetical protein  47.22 
 
 		 411 aa  302  6.000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5013  hypothetical protein  42.93 
 
 		 423 aa  302  8.000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.333808  normal  0.0166676 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3621  hypothetical protein  49.03 
 
 		 402 aa  299  6e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0789115 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3938  hypothetical protein  42.66 
 
 		 429 aa  298  1e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.350729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1537  hypothetical protein  46.26 
 
 		 408 aa  296  3e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.505562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0028  hypothetical protein  41.69 
 
 		 420 aa  296  4e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1336  hypothetical protein  45.72 
 
 		 408 aa  293  3e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.616275 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4870  hypothetical protein  46.61 
 
 		 408 aa  290  3e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.128964 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0007  hypothetical protein  43.51 
 
 		 410 aa  282  8.000000000000001e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0026  hypothetical protein  41.41 
 
 		 395 aa  272  8.000000000000001e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1941  hypothetical protein  40.41 
 
 		 393 aa  270  2e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.86402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2612  hypothetical protein  37.53 
 
 		 416 aa  265  1e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0743279  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3146  hypothetical protein  37.72 
 
 		 412 aa  263  4e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1240  hypothetical protein  39.28 
 
 		 394 aa  263  4e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.314539  normal  0.831655 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0483  hypothetical protein  40 
 
 		 395 aa  259  8e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.715666 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2582  hypothetical protein  40.51 
 
 		 369 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2846  hypothetical protein  35.94 
 
 		 394 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.194777  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4978  hypothetical protein  36.88 
 
 		 406 aa  212  9e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.638405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0722  hypothetical protein  38.51 
 
 		 402 aa  204  2e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.126756 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3037  hypothetical protein  36.21 
 
 		 393 aa  196  6e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.245994  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1795  hypothetical protein  36.64 
 
 		 391 aa  186  4e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175604 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4699  extracellular ligand-binding receptor  22.14 
 
 		 432 aa  63.5  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.525381 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2901  extracellular ligand-binding receptor  23.62 
 
 		 419 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3574  hypothetical protein  22.61 
 
 		 413 aa  55.5  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3901  inner-membrane translocator  24.14 
 
 		 413 aa  52.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.295568 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0430  extracellular ligand-binding receptor  21.46 
 
 		 445 aa  47.4  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.249043 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>