More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3033 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3033  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 133 aa  269  1e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0661406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1930  MerR family transcriptional regulator  82.11 
 
 		 123 aa  208  2e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127523  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3841  MerR family transcriptional regulator  82.11 
 
 		 123 aa  207  3e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4498  MerR family transcriptional regulator  63.48 
 
 		 129 aa  149  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.119505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3828  MerR family transcriptional regulator  48.36 
 
 		 122 aa  112  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0373  transcriptional regulator, MerR family  41.9 
 
 		 158 aa  76.3  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0543  transcriptional regulator, MerR family  41.9 
 
 		 158 aa  76.3  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.166066  hitchhiker  0.000000593111 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2454  transcriptional regulator, MerR family  41.44 
 
 		 159 aa  75.1  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.589296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5050  putative transcriptional regulator, MerR family  34.88 
 
 		 131 aa  74.7  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.999579  normal  0.135086 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4396  transcriptional regulator, MerR family  37.6 
 
 		 133 aa  74.3  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.742321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4049  MerR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 149 aa  74.3  0.0000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4286  transcriptional regulator, MerR family  37.6 
 
 		 133 aa  74.3  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2198  transcriptional regulator, MerR family  38.78 
 
 		 134 aa  72.8  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4898  MerR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 147 aa  72.8  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.627224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0198  MerR family transcriptional regulator  42 
 
 		 137 aa  72.4  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2008  transcriptional regulator, MerR family  36.73 
 
 		 148 aa  71.6  0.000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.505788  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25610  predicted transcriptional regulator  36 
 
 		 129 aa  71.2  0.000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7842  transcriptional regulator, MerR family  42.42 
 
 		 149 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3790  MerR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 132 aa  70.5  0.000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0361759  normal  0.548118 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4066  MerR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 132 aa  70.5  0.000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5683  MerR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 149 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6047  MerR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 149 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.790418 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1646  MerR family transcriptional regulator  37 
 
 		 133 aa  70.5  0.000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2572  MerR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 141 aa  70.1  0.000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.957862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2718  transcriptional regulator, MerR family  36.45 
 
 		 150 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.654055  hitchhiker  0.0000347436 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3456  MerR family transcriptional regulator  37 
 
 		 149 aa  69.7  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4039  MerR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 130 aa  70.1  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576602  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02983  putative transcription regulator protein  50.68 
 
 		 152 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.179274  normal  0.643629 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6009  transcriptional regulator, MerR family  38.14 
 
 		 129 aa  68.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.241161  normal  0.0668881 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7157  transcriptional regulator, MerR family  38.14 
 
 		 129 aa  69.3  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.267404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2307  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  37.11 
 
 		 132 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0993  MerR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 137 aa  69.3  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.335093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1260  transcriptional regulator  37.37 
 
 		 131 aa  68.9  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.332121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0677  MerR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 116 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00486381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2889  transcriptional regulator  37.14 
 
 		 137 aa  68.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.359034  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2399  transcriptional regulator, MerR family  39.39 
 
 		 132 aa  68.6  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000424023  normal  0.796089 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1739  MerR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 141 aa  68.6  0.00000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.784519 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06140  predicted transcriptional regulator  35 
 
 		 129 aa  68.6  0.00000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1535  MerR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 137 aa  68.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.139036  normal  0.469721 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0442  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 132 aa  68.2  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.856657  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1777  MerR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 145 aa  68.6  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0466  MerR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 120 aa  68.2  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2198  MerR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 135 aa  68.2  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3676  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 143 aa  68.2  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.511555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0303  transcriptional regulator, MerR family  36.73 
 
 		 154 aa  68.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00540997  normal  0.988288 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1129  MerR family transcriptional regulator  38 
 
 		 131 aa  67.4  0.00000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.560457  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3410  hypothetical protein  35.25 
 
 		 142 aa  67.4  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3299  MerR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 149 aa  67.4  0.00000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3184  transcriptional regulator, MerR family  37.76 
 
 		 142 aa  67  0.00000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3653  transcriptional regulator, MerR family  34.65 
 
 		 234 aa  66.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.885436  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1150  transcriptional regulator, MerR family  37.37 
 
 		 135 aa  66.2  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00496019 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4536  transcriptional regulator, MerR family  37.4 
 
 		 146 aa  66.2  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.228678  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9141  putative transcriptional regulator, MerR family  39.22 
 
 		 124 aa  66.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0537  MerR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 133 aa  66.6  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.705155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3892  MerR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 149 aa  66.6  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00526993  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2318  MerR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 143 aa  66.2  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4537  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  36.08 
 
 		 132 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3219  MerR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 147 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.199693  normal  0.39103 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3103  MerR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 145 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6119  MerR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 125 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0529361  normal  0.0458667 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0947  transcriptional regulator, MerR family  38.24 
 
 		 137 aa  65.5  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4947  regulatory protein, MerR  33.62 
 
 		 129 aa  65.5  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.459947  decreased coverage  0.00286067 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6360  transcriptional regulator, MerR family  40.2 
 
 		 152 aa  65.1  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241077  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1339  mercuric resistance operon regulatory protein  32.09 
 
 		 135 aa  65.1  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2322  transcription regulator protein  35.42 
 
 		 124 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.161487 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3704  MerR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 116 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2256  MerR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 136 aa  65.1  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.773576 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2538  transcriptional regulator, MerR family  36.04 
 
 		 147 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.329159  normal  0.129188 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4528  transcriptional regulator, MerR family  36 
 
 		 129 aa  65.1  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.355526 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2087  MerR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 128 aa  65.1  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.545443  normal  0.539836 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0838  MerR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2848  MerR family transcriptional regulator  34 
 
 		 142 aa  65.5  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0869  MerR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 145 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4509  transcriptional regulator, MerR family  34 
 
 		 129 aa  65.1  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125189 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5500  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  37.76 
 
 		 132 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4226  MerR family transcriptional regulator  36 
 
 		 150 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.795335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2760  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  32.32 
 
 		 135 aa  64.7  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5359  transcriptional regulator, MerR family  37.76 
 
 		 142 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14720  predicted transcriptional regulator  36.27 
 
 		 148 aa  64.7  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.590627  normal  0.772199 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3242  transcriptional regulator, MerR family  38.38 
 
 		 132 aa  64.7  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3620  transcriptional regulator, MerR family  35.71 
 
 		 148 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2494  transcriptional regulator, MerR family  35.71 
 
 		 148 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.453842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1697  MerR family transcriptional regulator  39.82 
 
 		 157 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.115653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3005  MerR family transcriptional regulator  37 
 
 		 144 aa  64.3  0.0000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.44472  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4090  putative MerR/CueR family transcriptional regulator  50 
 
 		 137 aa  64.3  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.849727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2558  MerR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16670  putative transcriptional regulator CadR  35 
 
 		 156 aa  64.7  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0593  MerR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 137 aa  64.3  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.429444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3477  MerR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 120 aa  63.9  0.0000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.137212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1328  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  37.74 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.185828  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1449  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  35 
 
 		 156 aa  63.9  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2773  MerR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 132 aa  63.9  0.0000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2821  MerR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 138 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.353313 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2325  MerR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 147 aa  63.9  0.0000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2009  transcriptional regulator, MerR family  47.22 
 
 		 152 aa  63.9  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0226  MerR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 154 aa  63.9  0.0000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3502  transcriptional regulator, MerR family  35 
 
 		 140 aa  63.9  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.733746 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3996  MerR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 143 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0624  MerR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 136 aa  63.9  0.0000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9863  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  36 
 
 		 147 aa  63.5  0.0000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>