More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2984 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009512  Pput_2429  alcohol dehydrogenase  93 
 
 
400 aa  773    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0410446  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3970  alcohol dehydrogenase GroES domain protein  92.75 
 
 
400 aa  769    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.143776 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2641  alcohol dehydrogenase  82.53 
 
 
396 aa  675    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0246923  normal  0.569601 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1875  glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase  82.52 
 
 
411 aa  669    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.231387  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3527  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  82.01 
 
 
411 aa  676    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.129082  normal  0.366185 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2984  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
400 aa  816    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.29856  normal  0.505288 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2481  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  75.52 
 
 
387 aa  614  9.999999999999999e-175  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2300  alcohol dehydrogenase  75.77 
 
 
388 aa  609  1e-173  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.394357  hitchhiker  0.00000777829 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00577  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  74.23 
 
 
412 aa  605  9.999999999999999e-173  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3016  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  73.98 
 
 
412 aa  605  9.999999999999999e-173  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00665749  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3035  alcohol dehydrogenase  73.98 
 
 
412 aa  605  9.999999999999999e-173  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00566  hypothetical protein  74.23 
 
 
412 aa  605  9.999999999999999e-173  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0695  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  74.49 
 
 
412 aa  606  9.999999999999999e-173  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0630  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  73.98 
 
 
412 aa  602  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0660  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  74.1 
 
 
412 aa  603  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0669  alcohol dehydrogenase GroES-like domain protein  72.96 
 
 
412 aa  597  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.432264  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0655  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  72.96 
 
 
412 aa  597  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0774  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase (glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase) (fdh) (faldh)  72.7 
 
 
412 aa  595  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0728  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase (glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase) (fdh) (faldh)  72.96 
 
 
412 aa  597  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0714  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  72.7 
 
 
412 aa  593  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2149  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  70.1 
 
 
386 aa  584  1e-166  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.406335  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0322  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  70.62 
 
 
387 aa  586  1e-166  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3112  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  70.36 
 
 
388 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.152698  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1441  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  67.95 
 
 
390 aa  558  1e-158  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.42991 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0573  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  50.26 
 
 
389 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1352  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  50.26 
 
 
388 aa  384  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4500  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  48.47 
 
 
392 aa  378  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.658078  normal  0.320847 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3663  hypothetical protein  50.88 
 
 
394 aa  372  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.184617  normal  0.501234 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0165  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  47.19 
 
 
389 aa  370  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3104  putative glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase  50.76 
 
 
394 aa  369  1e-101  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.345929  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3833  alcohol dehydrogenase  50.76 
 
 
394 aa  368  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.24597  normal  0.375314 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3010  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  47.47 
 
 
398 aa  364  1e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.609837  decreased coverage  0.000185041 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0122  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  45.2 
 
 
401 aa  359  4e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.566245 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4498  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  46.43 
 
 
389 aa  359  5e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.709145 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0065  alcohol dehydrogenase  47.31 
 
 
386 aa  358  7e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.130136  normal  0.343389 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5446  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  47.47 
 
 
392 aa  358  9.999999999999999e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.715601  normal  0.534231 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0139  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  44.39 
 
 
401 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3683  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  47.97 
 
 
397 aa  354  1e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4057  alcohol dehydrogenase  47.07 
 
 
433 aa  352  5e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.788461  normal  0.848638 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5345  alcohol dehydrogenase  46.62 
 
 
399 aa  352  5.9999999999999994e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.501465  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5561  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  47.07 
 
 
389 aa  352  7e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.210102  normal  0.0249106 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0720  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  46.43 
 
 
389 aa  350  2e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00145968  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0166  putative glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase  44.97 
 
 
395 aa  350  4e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.912922  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3368  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  44.92 
 
 
384 aa  348  1e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2636  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  45.29 
 
 
384 aa  347  2e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4691  alcohol dehydrogenase  46.31 
 
 
389 aa  347  2e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4212  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  46.04 
 
 
376 aa  347  3e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000750849  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2370  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  46.06 
 
 
389 aa  347  3e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.456638  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1223  zinc-binding alcohol dehydrogenase  47.07 
 
 
390 aa  347  3e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000417243 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2540  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  45.29 
 
 
384 aa  346  5e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.14774  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5047  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  46.65 
 
 
385 aa  345  6e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557083  hitchhiker  0.00205277 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5582  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  48.6 
 
 
391 aa  344  2e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.351593  normal  0.119261 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2657  alcohol dehydrogenase  46.95 
 
 
388 aa  342  5.999999999999999e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2860  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  46.31 
 
 
389 aa  342  9e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.489026  normal  0.707248 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2482  putative zinc-containing dehydrogenase  44.78 
 
 
389 aa  340  2e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3187  alcohol dehydrogenase  45.8 
 
 
389 aa  338  7e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3396  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  44.64 
 
 
393 aa  338  7e-92  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4801  alcohol dehydrogenase  44.78 
 
 
389 aa  338  9e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0751128 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4200  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  45.1 
 
 
385 aa  338  9.999999999999999e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0041  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  45.57 
 
 
405 aa  337  1.9999999999999998e-91  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.950338 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2255  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  47.28 
 
 
393 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000285596  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4017  alcohol dehydrogenase  44.13 
 
 
382 aa  337  2.9999999999999997e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.530875 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5822  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  46.43 
 
 
391 aa  335  5.999999999999999e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1320  zinc-binding alcohol dehydrogenase  46.06 
 
 
384 aa  335  7.999999999999999e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.106118  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0553  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  44.64 
 
 
382 aa  334  1e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.81642  hitchhiker  0.000850612 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0575  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  44.13 
 
 
389 aa  333  4e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00340  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  46.6 
 
 
403 aa  332  7.000000000000001e-90  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.349198 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2264  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  45.09 
 
 
390 aa  331  1e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1507  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  43.08 
 
 
382 aa  330  2e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.653968 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1246  zinc-type alcohol dehydrogenase  45.1 
 
 
385 aa  329  6e-89  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.939827  normal  0.312443 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4725  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  43.29 
 
 
391 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105849  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5415  alcohol dehydrogenase GroES domain protein  46.29 
 
 
393 aa  327  2.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2307  alcohol dehydrogenase  44.84 
 
 
390 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0161452 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3145  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  43.33 
 
 
377 aa  326  3e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3437  alcohol dehydrogenase  47.77 
 
 
391 aa  327  3e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2124  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  43.33 
 
 
377 aa  326  5e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.770168  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2582  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  44.84 
 
 
390 aa  325  7e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.481198 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2838  alcohol dehydrogenase, glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase  43.33 
 
 
377 aa  325  8.000000000000001e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.409585  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3114  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  43.08 
 
 
377 aa  325  1e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3133  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  43.08 
 
 
377 aa  325  1e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2912  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  43.08 
 
 
377 aa  323  2e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.549195  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2881  alcohol dehydrogenase, glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase  43.08 
 
 
377 aa  324  2e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.523818  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3131  alcohol dehydrogenase  43.08 
 
 
377 aa  323  2e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0160  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  44.67 
 
 
392 aa  324  2e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4105  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  43.4 
 
 
390 aa  324  2e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1619  alcohol dehydrogenase  44.47 
 
 
384 aa  322  7e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.682346 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3155  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  42.82 
 
 
377 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.633298  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0110  alcohol dehydrogenase  43.83 
 
 
390 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3148  alcohol dehydrogenase  44.85 
 
 
382 aa  321  9.999999999999999e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.539421  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5159  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  43.58 
 
 
390 aa  319  5e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.150662  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4441  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.05 
 
 
384 aa  319  5e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.204388  normal  0.287337 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0835  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  41.84 
 
 
396 aa  319  7e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.202579 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5217  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  41.58 
 
 
384 aa  318  1e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0818  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  45.01 
 
 
401 aa  317  3e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4494  alcohol dehydrogenase  42.57 
 
 
390 aa  316  4e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.134818  normal  0.0652457 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0531  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  41.81 
 
 
390 aa  316  4e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6253  alcohol dehydrogenase  42.78 
 
 
391 aa  316  5e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.731237 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4359  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  41.58 
 
 
389 aa  315  9.999999999999999e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0748  alcohol dehydrogenase  42.6 
 
 
388 aa  314  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.57534  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0768  alcohol dehydrogenase  42.6 
 
 
388 aa  314  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.87513  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>