46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2891 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2891  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 		 216 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0118501  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2891  acetyltransferase  97.22 
 
 		 225 aa  435  1e-121  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00698581  normal  0.826178 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2799  GCN5-related N-acetyltransferase  97.22 
 
 		 216 aa  435  1e-121  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.17689 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2394  GCN5-related N-acetyltransferase  87.04 
 
 		 216 aa  390  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.130564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3648  acetyltransferase  74.52 
 
 		 216 aa  333  2e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0594947 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2435  GCN5-related N-acetyltransferase  68.27 
 
 		 214 aa  301  5.000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.272876  normal  0.75781 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2748  hypothetical protein  62.87 
 
 		 223 aa  278  7e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.176962  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2477  hypothetical protein  61.88 
 
 		 223 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.184959  normal  0.165942 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28870  GCN5-related N-acetyltransferase  60.1 
 
 		 223 aa  268  5e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.114287  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2693  hypothetical protein  62.75 
 
 		 210 aa  265  4e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31660  hypothetical protein  61.93 
 
 		 237 aa  261  4.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.286419 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1358  GCN5-related N-acetyltransferase  42.29 
 
 		 223 aa  182  4.0000000000000006e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03041  predicted acetyltransferase, GNAT family  34.05 
 
 		 215 aa  130  1.0000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2917  GCN5-related N-acetyltransferase  31.4 
 
 		 215 aa  122  3e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.170067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1255  GCN5-related N-acetyltransferase  32.21 
 
 		 209 aa  123  3e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.73602  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1467  GCN5-related N-acetyltransferase  30.92 
 
 		 215 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.770866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1431  GCN5-related N-acetyltransferase  30.92 
 
 		 215 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2829  GCN5-related N-acetyltransferase  30.92 
 
 		 212 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1519  GCN5-related N-acetyltransferase  30.73 
 
 		 212 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1437  GCN5-related N-acetyltransferase  30.43 
 
 		 215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.947543  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1335  GCN5-related N-acetyltransferase  31.91 
 
 		 212 aa  119  3e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2655  GCN5-related N-acetyltransferase  30.92 
 
 		 212 aa  119  3e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1126  acetyltransferase  31.16 
 
 		 213 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1614  acetyltransferase  30.92 
 
 		 212 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2722  GCN5-related N-acetyltransferase  30.43 
 
 		 212 aa  115  5e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3529  hypothetical protein  31.52 
 
 		 223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.770322  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3294  GCN5-related N-acetyltransferase  29.95 
 
 		 215 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000278112 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3173  GCN5-related N-acetyltransferase  31.58 
 
 		 215 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3188  hypothetical protein  31.69 
 
 		 214 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.255733  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2648  GCN5-related N-acetyltransferase  32.63 
 
 		 216 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2896  GCN5-related N-acetyltransferase  29.95 
 
 		 212 aa  105  6e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.289244  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7239  GCN5-related N-acetyltransferase  22.81 
 
 		 203 aa  52.8  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.343936  normal  0.19806 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0677  acetyltransferase  20.43 
 
 		 202 aa  48.9  0.00007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.339067  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4881  GCN5-related N-acetyltransferase  23.88 
 
 		 197 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.910277 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5244  GCN5-related N-acetyltransferase  34.67 
 
 		 186 aa  46.6  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.109908  normal  0.421664 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1896  acetyltransferase  26.61 
 
 		 295 aa  45.1  0.0009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.108924  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2180  acetyltransferase, GNAT family  25.81 
 
 		 295 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1886  acetyltransferase  27.68 
 
 		 295 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.708702  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2112  acetyltransferase, GNAT family  26.61 
 
 		 295 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0591  GCN5-related N-acetyltransferase  30 
 
 		 215 aa  43.9  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.28295  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2762  GCN5-related N-acetyltransferase  30.43 
 
 		 153 aa  42  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.123126 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3166  acetyltransferase, GNAT family  30.43 
 
 		 153 aa  42  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0840877  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1933  GCN5-related N-acetyltransferase  28.32 
 
 		 312 aa  41.6  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.367916  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0869  GCN5-related N-acetyltransferase  32.1 
 
 		 145 aa  42  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.700495 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2071  acetyltransferase, GNAT family  25.98 
 
 		 289 aa  42  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1284  GCN5-related N-acetyltransferase  35.21 
 
 		 198 aa  41.6  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.608599  normal  0.127102 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>