79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2844 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2928  saccharopine dehydrogenase  99.5 
 
 		 414 aa  826    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2125  saccharopine dehydrogenase  99.75 
 
 		 399 aa  828    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.530272  normal  0.238501 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2844  saccharopine dehydrogenase  100 
 
 		 399 aa  829    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.241943 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1380  saccharopine dehydrogenase  77.47 
 
 		 412 aa  647    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000104449  normal  0.291708 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2764  saccharopine dehydrogenase  99.5 
 
 		 414 aa  826    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.114818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0352  hypothetical protein  75.25 
 
 		 413 aa  634    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0988  saccharopine dehydrogenase  91.92 
 
 		 413 aa  769    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000577497 
 
 
-
 
NC_004310  BR0335  hypothetical protein  75.25 
 
 		 413 aa  634    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0438  saccharopine dehydrogenase  74.24 
 
 		 426 aa  625  1e-178  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0417875  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4157  saccharopine dehydrogenase  73.6 
 
 		 413 aa  627  1e-178  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.152115  normal  0.83779 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5844  hypothetical protein  70.71 
 
 		 413 aa  601  1.0000000000000001e-171  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2884  saccharopine dehydrogenase  70.71 
 
 		 412 aa  599  1e-170  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1475  saccharopine dehydrogenase family protein  70.74 
 
 		 412 aa  585  1e-166  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1715  saccharopine dehydrogenase  70.63 
 
 		 422 aa  586  1e-166  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000659439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1501  saccharopine dehydrogenase  70.56 
 
 		 424 aa  587  1e-166  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0126  saccharopine dehydrogenase  70.74 
 
 		 412 aa  585  1e-166  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.281282 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0914  putative saccharopine dehydrogenase family protein  70.56 
 
 		 424 aa  587  1e-166  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.867111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0028  saccharopine dehydrogenase  69.72 
 
 		 412 aa  571  1.0000000000000001e-162  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2955  saccharopine dehydrogenase  69.54 
 
 		 407 aa  565  1e-160  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2289  saccharopine dehydrogenase  46.17 
 
 		 405 aa  366  1e-100  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.772575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02740  hypothetical protein  46.27 
 
 		 417 aa  362  5.0000000000000005e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003102  carboxynorspermidine dehydrogenase putative  45.32 
 
 		 414 aa  362  6e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.185885  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2137  saccharopine dehydrogenase  44.81 
 
 		 414 aa  358  7e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0299628  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1231  hypothetical protein  44.91 
 
 		 414 aa  345  7e-94  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00001292  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1128  Saccharopine dehydrogenase  43.23 
 
 		 399 aa  329  5.0000000000000004e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.785881  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1555  Saccharopine dehydrogenase  42.23 
 
 		 401 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000142738  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1922  saccharopine dehydrogenase  41.41 
 
 		 392 aa  324  1e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00339893 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6504  Saccharopine dehydrogenase  42.23 
 
 		 395 aa  323  2e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.752719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2320  Saccharopine dehydrogenase  41.79 
 
 		 396 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1181  saccharopine dehydrogenase  40.36 
 
 		 394 aa  316  4e-85  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.886294  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2607  saccharopine dehydrogenase  40.4 
 
 		 398 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0208  saccharopine dehydrogenase  40.73 
 
 		 401 aa  314  1.9999999999999998e-84  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.69447  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0165  saccharopine dehydrogenase  40.73 
 
 		 401 aa  313  2.9999999999999996e-84  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0902  saccharopine dehydrogenase  41.56 
 
 		 397 aa  312  6.999999999999999e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000168136 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0186  saccharopine dehydrogenase  40.21 
 
 		 401 aa  311  2e-83  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2095  saccharopine dehydrogenase-like protein  40.41 
 
 		 399 aa  310  2e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1676  Saccharopine dehydrogenase  40.51 
 
 		 398 aa  309  5e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0203222  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1790  saccharopine dehydrogenase  40.36 
 
 		 401 aa  308  8e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2539  saccharopine dehydrogenase  40.82 
 
 		 398 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0572  saccharopine dehydrogenase  39.48 
 
 		 398 aa  307  3e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3052  saccharopine dehydrogenase  41.41 
 
 		 399 aa  306  3e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0458  saccharopine dehydrogenase  39.43 
 
 		 401 aa  307  3e-82  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1307  Saccharopine dehydrogenase  40.31 
 
 		 399 aa  307  3e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000784986 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1597  Acyl carrier protein (ACP)  40 
 
 		 399 aa  306  4.0000000000000004e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.30891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0981  saccharopine dehydrogenase  40.31 
 
 		 398 aa  305  9.000000000000001e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0620633  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2918  Saccharopine dehydrogenase  40.31 
 
 		 398 aa  302  6.000000000000001e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0747  saccharopine dehydrogenase  39.39 
 
 		 403 aa  302  8.000000000000001e-81  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000418334  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0061  saccharopine dehydrogenase  39.39 
 
 		 403 aa  301  2e-80  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1201  saccharopine dehydrogenase  39.75 
 
 		 402 aa  299  5e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.150944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0148  Saccharopine dehydrogenase  40.05 
 
 		 409 aa  299  7e-80  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0125  Saccharopine dehydrogenase  39.19 
 
 		 403 aa  296  3e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0415  saccharopine dehydrogenase  38.54 
 
 		 405 aa  296  4e-79  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2516  saccharopine dehydrogenase  38.22 
 
 		 396 aa  295  1e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.558897  normal  0.297438 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1535  Saccharopine dehydrogenase  39.01 
 
 		 396 aa  295  1e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.82797 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0999  saccharopine dehydrogenase  38.92 
 
 		 405 aa  293  3e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0445398  hitchhiker  0.00533099 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2142  Saccharopine dehydrogenase  39.35 
 
 		 404 aa  293  3e-78  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4440  saccharopine dehydrogenase  39.85 
 
 		 401 aa  291  1e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2888  Saccharopine dehydrogenase  38.18 
 
 		 403 aa  288  1e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.120454 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3519  Saccharopine dehydrogenase  38.6 
 
 		 405 aa  287  2.9999999999999996e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.368548  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0677  saccharopine dehydrogenase  38.02 
 
 		 397 aa  286  2.9999999999999996e-76  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.10466 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0748  saccharopine dehydrogenase  38.66 
 
 		 400 aa  286  5e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0285  saccharopine dehydrogenase  36.95 
 
 		 404 aa  285  1.0000000000000001e-75  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03351  Carboxynorspermidine dehydrogenase  39.64 
 
 		 400 aa  285  1.0000000000000001e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00142848  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1081  saccharopine dehydrogenase  38.68 
 
 		 399 aa  283  3.0000000000000004e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.706576  normal  0.0928318 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1950  hypothetical protein  30.21 
 
 		 408 aa  165  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3295  Saccharopine dehydrogenase  28.97 
 
 		 403 aa  161  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.886794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4677  Saccharopine dehydrogenase  30.86 
 
 		 401 aa  157  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3221  saccharopine dehydrogenase  29.77 
 
 		 407 aa  140  3e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4946  saccharopine dehydrogenase  28.69 
 
 		 407 aa  136  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5034  saccharopine dehydrogenase  28.69 
 
 		 407 aa  136  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5327  saccharopine dehydrogenase  28.69 
 
 		 407 aa  136  8e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0356987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2976  saccharopine dehydrogenase  23 
 
 		 415 aa  73.9  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.809568  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1835  Saccharopine dehydrogenase  22.99 
 
 		 398 aa  70.5  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.257501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3651  Saccharopine dehydrogenase  23.12 
 
 		 367 aa  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1495  Saccharopine dehydrogenase  31.15 
 
 		 376 aa  47  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000691069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4394  saccharopine dehydrogenase  28.15 
 
 		 384 aa  46.6  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130212 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4609  hypothetical protein  26.23 
 
 		 392 aa  45.8  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.856643  normal  0.0914614 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1202  saccharopine dehydrogenase  20.98 
 
 		 403 aa  45.4  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5058  saccharopine dehydrogenase  25.26 
 
 		 369 aa  42.7  0.01  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>