More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2644 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2644  aldo/keto reductase  100 
 
 		 303 aa  618  1e-176  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.077473  normal  0.480296 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2513  aldo/keto reductase  90.76 
 
 		 303 aa  565  1e-160  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2662  aldo/keto reductase  86.8 
 
 		 302 aa  544  1e-154  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3249  aldo/keto reductase  92.65 
 
 		 272 aa  518  1e-146  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.492949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1798  twin-arginine translocation pathway signal  54.61 
 
 		 308 aa  332  4e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.116127  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26350  Aldo/keto reductase protein  58.09 
 
 		 307 aa  323  2e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4003  aldo/keto reductase  52.27 
 
 		 271 aa  277  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444769  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0376  aldo/keto reductase  45.42 
 
 		 306 aa  271  1e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2106  aldo/keto reductase  45.75 
 
 		 314 aa  261  8.999999999999999e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7084  aldo/keto reductase  49.42 
 
 		 301 aa  259  3e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.881605  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49120  Aldo/keto reductase  44.3 
 
 		 305 aa  259  5.0000000000000005e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0384545  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6222  aldo/keto reductase  47.9 
 
 		 302 aa  257  2e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4782  putative aldo/keto reductase  50.94 
 
 		 307 aa  256  4e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0411643  normal  0.476662 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2471  aldo/keto reductase  42.21 
 
 		 312 aa  248  1e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.367665 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5330  aldo/keto reductase  46.79 
 
 		 333 aa  246  3e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.685362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1266  aldo/keto reductase  43.75 
 
 		 331 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5422  aldo/keto reductase  44.74 
 
 		 316 aa  241  9e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3208  aldo/keto reductase  46.99 
 
 		 323 aa  228  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00561471  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0310  aldo/keto reductase  43.92 
 
 		 309 aa  226  5.0000000000000005e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.66643  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0028  aldo/keto reductase  41.94 
 
 		 311 aa  224  1e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.277769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1231  aldo/keto reductase  43.53 
 
 		 302 aa  218  7.999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3859  aldo/keto reductase  41.04 
 
 		 309 aa  215  7e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.665179  normal  0.078293 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4168  aldo/keto reductase  40.67 
 
 		 309 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.528392 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4332  aldo/keto reductase  41.13 
 
 		 305 aa  212  4.9999999999999996e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00722247 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1371  aldo/keto reductase  40.82 
 
 		 304 aa  211  1e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0625876 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1065  aldo/keto reductase  39.71 
 
 		 310 aa  209  3e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4318  aldo/keto reductase  39.55 
 
 		 317 aa  206  3e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.443363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0446  aldo/keto reductase  39.33 
 
 		 301 aa  205  9e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1200  putative oxidoreductase protein  42.63 
 
 		 305 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2819  aldo/keto reductase  40.23 
 
 		 317 aa  196  5.000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.842326  normal  0.173648 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0575  twin-arginine translocation pathway signal  34.52 
 
 		 345 aa  192  7e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.451662  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0777  aldo/keto reductase  36.09 
 
 		 296 aa  183  3e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0409977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1310  putative oxidoreductase protein  38.1 
 
 		 277 aa  175  8e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.679533  normal  0.414408 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5296  aldo/keto reductase  34.87 
 
 		 271 aa  141  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.107588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2769  aldo/keto reductase  31.05 
 
 		 329 aa  79.7  0.00000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1681  aldo/keto reductase  30.69 
 
 		 316 aa  77  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.67029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0928  aldo/keto reductase  28.52 
 
 		 339 aa  75.9  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.339617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0695  aldo/keto reductase  24.82 
 
 		 396 aa  75.1  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.994792  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1286  aldo/keto reductase  28.17 
 
 		 410 aa  75.1  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0119891  decreased coverage  0.00591823 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4306  aldo/keto reductase  31.78 
 
 		 332 aa  73.2  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2639  aldo/keto reductase  25.19 
 
 		 400 aa  73.2  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.258498  normal  0.182592 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1801  aldo/keto reductase  27.78 
 
 		 338 aa  72.4  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3173  aldo/keto reductase  28.29 
 
 		 279 aa  72.4  0.000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.115675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0951  aldo/keto reductase  28.57 
 
 		 406 aa  72.4  0.000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3225  aldo/keto reductase  30.16 
 
 		 323 aa  72  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.779629  normal  0.443318 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2006  aldo/keto reductase  28.68 
 
 		 281 aa  71.6  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0536  putative aldose reductase  25.99 
 
 		 315 aa  71.6  0.00000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0284216  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2739  aldo/keto reductase  28.52 
 
 		 352 aa  70.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.8158 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2446  aldo/keto reductase  30.04 
 
 		 342 aa  71.2  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.05241 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1537  aldo/keto reductase  28.46 
 
 		 329 aa  71.2  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499861 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1226  aldo/keto reductase  24.15 
 
 		 408 aa  70.5  0.00000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4055  aldo/keto reductase  26.27 
 
 		 280 aa  70.1  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.239082 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2484  aldo/keto reductase  27.84 
 
 		 352 aa  69.3  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.797379  normal  0.441954 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1924  aldo/keto reductase  24.74 
 
 		 413 aa  69.3  0.00000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2034  aldo/keto reductase  32.09 
 
 		 357 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1275  aldo/keto reductase  29.44 
 
 		 315 aa  69.3  0.00000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.13271 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1644  aldo/keto reductase  26.26 
 
 		 323 aa  69.3  0.00000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.539861  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1081  aldo/keto reductase  35.09 
 
 		 286 aa  68.9  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3355  aldo/keto reductase  28.51 
 
 		 343 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2076  aldo/keto reductase  26.98 
 
 		 338 aa  68.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3502  aldo/keto reductase  30.2 
 
 		 276 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0118394  normal  0.431594 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0432  aldo/keto reductase  30.5 
 
 		 343 aa  68.2  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.320892  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0288  aldo/keto reductase  29.33 
 
 		 328 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1556  aldo/keto reductase  28.47 
 
 		 349 aa  68.2  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206898  normal  0.568157 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2798  aldo/keto reductase  27.72 
 
 		 281 aa  67.8  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.503233  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0550  aldo/keto reductase  26.56 
 
 		 343 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.216152  normal  0.992757 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0521  aldo/keto reductase  26 
 
 		 294 aa  67  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.166117  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1880  aldo/keto reductase  26.59 
 
 		 338 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1210  aldo/keto reductase  25.19 
 
 		 409 aa  67.4  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.97605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1382  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  27.76 
 
 		 282 aa  66.6  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.211606 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2068  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  28.22 
 
 		 282 aa  66.6  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000333228 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2281  aldo/keto reductase  32.56 
 
 		 312 aa  66.6  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000892258  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1887  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  28.22 
 
 		 282 aa  66.6  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0335857  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1399  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  28.22 
 
 		 282 aa  66.6  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0161673 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1415  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  28.22 
 
 		 282 aa  66.6  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.111165  normal  0.725362 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3467  aldo/keto reductase  27.73 
 
 		 361 aa  66.2  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.648507  normal  0.107464 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2200  aldo/keto reductase  28.8 
 
 		 314 aa  65.9  0.0000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0154507  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0288  aldo/keto reductase  28.85 
 
 		 328 aa  65.9  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.855792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3201  putative oxidoreductase  27.97 
 
 		 339 aa  65.9  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.448174  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6159  aldo/keto reductase  28.39 
 
 		 317 aa  65.9  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.145044  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1355  aldo/keto reductase  28.15 
 
 		 369 aa  65.9  0.0000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.630343  normal  0.0541825 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3940  aldo/keto reductase  27.97 
 
 		 339 aa  65.9  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.336434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2303  aldo/keto reductase  28.99 
 
 		 344 aa  65.9  0.0000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1335  aldo/keto reductase  27.23 
 
 		 329 aa  65.5  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.546872 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3663  aldo/keto reductase  31.28 
 
 		 344 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0553  aldo/keto reductase  25.48 
 
 		 281 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0509974 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1459  aldo/keto reductase  26.8 
 
 		 350 aa  65.5  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.209744  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0490  aldo/keto reductase family oxidoreductase  27.21 
 
 		 324 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1762  aldo/keto reductase  26.85 
 
 		 327 aa  64.7  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.385791 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0023  aldo/keto reductase  27.7 
 
 		 339 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2162  aldo/keto reductase  31.21 
 
 		 323 aa  64.3  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1417  aldo/keto reductase  28.33 
 
 		 349 aa  64.3  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.479026  normal  0.0673448 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3081  aldo/keto reductase  26.47 
 
 		 277 aa  63.9  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1665  aldo/keto reductase  25.58 
 
 		 377 aa  63.9  0.000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0033  aldo/keto reductase  27.7 
 
 		 339 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0748  aldo/keto reductase  24.44 
 
 		 329 aa  63.9  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.58635  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0108  aldo/keto reductase  26.87 
 
 		 345 aa  63.9  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0196191  hitchhiker  0.00894917 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0042  aldo/keto reductase  27.7 
 
 		 339 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00274786 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16590  predicted oxidoreductase of aldo/keto reductase family  26.57 
 
 		 370 aa  63.9  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.101314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3193  aldo/keto reductase  29.22 
 
 		 333 aa  63.5  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0849672  normal  0.13692 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>