More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2626 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_2258  phenylacetic acid degradation protein paaN  58.94 
 
 
681 aa  739    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1474  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  59.23 
 
 
681 aa  744    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1925  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  53.18 
 
 
679 aa  639    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0838003  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3270  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  97.95 
 
 
684 aa  1308    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.289293  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0031  phenylacetic acid degradation protein paaN  53.59 
 
 
678 aa  654    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.300256  normal  0.45539 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0748  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  53.04 
 
 
675 aa  658    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2268  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  59.23 
 
 
681 aa  744    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2489  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  97.8 
 
 
684 aa  1305    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.997274 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3568  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  75.63 
 
 
682 aa  1029    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.282162 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3090  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  72.73 
 
 
684 aa  1009    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.748677  hitchhiker  0.00334678 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1572  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  58.64 
 
 
681 aa  736    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1226  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  76.83 
 
 
686 aa  1007    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0226  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  55.24 
 
 
683 aa  721    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.577017 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4152  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  52.21 
 
 
686 aa  642    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.39195  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3827  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  52.44 
 
 
678 aa  656    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.145671  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26540  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  53.08 
 
 
681 aa  660    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.212629 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2639  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  94 
 
 
683 aa  1260    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.31992  normal  0.197677 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1556  phenylacetic acid degradation protein paaN  56.91 
 
 
690 aa  727    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2626  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
684 aa  1391    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.574883  normal  0.162198 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0907  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  52.89 
 
 
687 aa  635    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.338542  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1832  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  52.66 
 
 
678 aa  651    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0934  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  51.98 
 
 
691 aa  647    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1913  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  56.93 
 
 
695 aa  728    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0600585  normal  0.0559603 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0437  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  53.48 
 
 
676 aa  665    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.68112 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1850  phenylacetic acid degradation protein paaN  57.73 
 
 
679 aa  773    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.8142  normal  0.547776 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1515  phenylacetic acid degradation protein paaN  57.12 
 
 
686 aa  748    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629181  normal  0.465185 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3071  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  59.2 
 
 
690 aa  764    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.329771 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4804  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  52.63 
 
 
686 aa  682    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.27422 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0649  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  54.36 
 
 
683 aa  732    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.940422  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5320  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  52.06 
 
 
675 aa  634  1e-180  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.248137  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1910  phenylacetic acid degradation protein paaN  52.06 
 
 
686 aa  634  1e-180  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0302284  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3636  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  52.37 
 
 
678 aa  627  1e-178  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.387162 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0685  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  51.56 
 
 
674 aa  623  1e-177  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05275  aldehyde dehydrogenase  50.15 
 
 
836 aa  621  1e-176  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3359  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  52.15 
 
 
685 aa  616  1e-175  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.990834  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0658  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  50.52 
 
 
664 aa  617  1e-175  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3053  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  51.59 
 
 
702 aa  609  1e-173  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3255  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  50.72 
 
 
703 aa  602  1.0000000000000001e-171  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.607573  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2485  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  50.88 
 
 
683 aa  601  1e-170  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00712993  hitchhiker  0.00576818 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20290  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  49.86 
 
 
706 aa  593  1e-168  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0650346  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0094  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  48.45 
 
 
688 aa  551  1e-155  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0895  aldehyde dehydrogenase  42.61 
 
 
531 aa  362  1e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.335826 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4944  Aldehyde Dehydrogenase  44.51 
 
 
517 aa  359  8e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141691  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1625  aldehyde dehydrogenase  43.66 
 
 
518 aa  342  1e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0898756  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0090  aldehyde dehydrogenase  44.34 
 
 
516 aa  338  1.9999999999999998e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3656  aldehyde dehydrogenase  44.14 
 
 
519 aa  337  3.9999999999999995e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1420  aldehyde dehydrogenase  41.32 
 
 
531 aa  330  5.0000000000000004e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0677446  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2699  aldehyde dehydrogenase  40.5 
 
 
531 aa  329  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0217  aldehyde dehydrogenase  43.47 
 
 
520 aa  319  1e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.286269  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2947  aldehyde dehydrogenase  43.16 
 
 
523 aa  316  8e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.738502  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1607  dehydratase  40.74 
 
 
515 aa  130  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.244807  normal  0.332328 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0742  aldehyde dehydrogenase  28.34 
 
 
476 aa  120  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0948493  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1493  Aldehyde Dehydrogenase  27.83 
 
 
477 aa  117  5e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0589665  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0742  aldehyde dehydrogenase  28.14 
 
 
476 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2158  aldehyde dehydrogenase  28.57 
 
 
475 aa  116  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2196  aldehyde dehydrogenase  28.57 
 
 
475 aa  116  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0708  betaine-aldehyde dehydrogenase, putative  27.74 
 
 
476 aa  115  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1410  2-hydroxymuconic semialdehyde dehydrogenase  25.1 
 
 
488 aa  115  3e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1779  aldehyde dehydrogenase  28.68 
 
 
485 aa  114  5e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1856  aldehyde dehydrogenase  29.05 
 
 
488 aa  114  6e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0560  Aldehyde Dehydrogenase  26.74 
 
 
500 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4475  aldehyde dehydrogenase  27.89 
 
 
476 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1729  aldehyde dehydrogenase  26.47 
 
 
475 aa  110  1e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00132327  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4593  aldehyde dehydrogenase  32.03 
 
 
487 aa  108  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5405  Aldehyde Dehydrogenase  27.52 
 
 
529 aa  107  5e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.264091  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4860  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  28.66 
 
 
491 aa  107  8e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0955697 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2177  betaine aldehyde dehydrogenase  25 
 
 
496 aa  106  1e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3788  aldehyde dehydrogenase  26.07 
 
 
510 aa  106  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6113  Aldehyde Dehydrogenase  26.3 
 
 
466 aa  106  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.401659  normal  0.835317 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0272  aldehyde dehydrogenase  26.48 
 
 
517 aa  106  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4080  betaine aldehyde dehydrogenase  25.48 
 
 
485 aa  105  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1018  Aldehyde Dehydrogenase  26.3 
 
 
510 aa  105  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0158  aldehyde dehydrogenase  26.7 
 
 
495 aa  105  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0153  aldehyde dehydrogenase  26.7 
 
 
495 aa  105  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0853  aldehyde dehydrogenase  27.77 
 
 
486 aa  105  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.55655  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31700  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  26.37 
 
 
495 aa  105  3e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.465703  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2956  MaoC domain protein dehydratase  44.85 
 
 
148 aa  104  5e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0870  Aldehyde Dehydrogenase  27.95 
 
 
528 aa  104  6e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6720  betaine-aldehyde dehydrogenase  30.49 
 
 
490 aa  104  7e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3379  phenylacetaldehyde dehydrogenase  27.53 
 
 
494 aa  104  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2823  betaine aldehyde dehydrogenase  25.79 
 
 
491 aa  104  7e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2689  betaine aldehyde dehydrogenase  23.95 
 
 
496 aa  103  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4763  Aldehyde Dehydrogenase  25.44 
 
 
500 aa  103  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2635  betaine aldehyde dehydrogenase  23.95 
 
 
496 aa  103  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2689  aldehyde dehydrogenase  27.6 
 
 
798 aa  102  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.583529 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1104  aldehyde dehydrogenase  27.4 
 
 
474 aa  103  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.304588  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2695  aldehyde dehydrogenase  30.06 
 
 
477 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.152226  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5505  Aldehyde Dehydrogenase  29.33 
 
 
504 aa  102  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000574808 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3474  phenylacetaldehyde dehydrogenase  27.33 
 
 
494 aa  102  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2233  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  24.08 
 
 
788 aa  102  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.635265  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3794  aldehyde dehydrogenase  26.16 
 
 
783 aa  102  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3372  phenylacetaldehyde dehydrogenase  27.53 
 
 
494 aa  101  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2407  aldehyde dehydrogenase  27.62 
 
 
493 aa  101  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.830868  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4949  lactaldehyde dehydrogenase  25.71 
 
 
478 aa  101  4e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.206035 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3300  phenylacetaldehyde dehydrogenase  27.33 
 
 
494 aa  101  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4733  Aldehyde Dehydrogenase  25.11 
 
 
506 aa  101  5e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.29898  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8400  betaine aldehyde dehydrogenase  28.82 
 
 
489 aa  101  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.980623  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5537  dehydratase, MaoC-like domain-containing protein  40.76 
 
 
157 aa  100  6e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2499  betaine-aldehyde dehydrogenase  26.73 
 
 
496 aa  100  7e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00184375  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2012  2-hydroxymuconic semialdehyde dehydrogenase  24.6 
 
 
490 aa  100  8e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.19915  normal  0.981188 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>