More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2540 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2540  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
159 aa  325  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00777279 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2356  GCN5-related N-acetyltransferase  93.71 
 
 
159 aa  312  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3406  acetyltransferase  93.71 
 
 
159 aa  310  4.999999999999999e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.344947 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2450  GCN5-related N-acetyltransferase  88.05 
 
 
159 aa  293  5e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4130  GCN5-related N-acetyltransferase  69.18 
 
 
170 aa  241  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0584  putative N-acetyltransferase  74.05 
 
 
158 aa  238  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06250  GNAT family acetyltransferase  73.42 
 
 
158 aa  238  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.129837  normal  0.1254 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2444  acetyltransferase, GNAT family  70.25 
 
 
161 aa  232  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1031  GCN5-related N-acetyltransferase  61.01 
 
 
159 aa  211  3.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.781756  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2318  GCN5-related N-acetyltransferase  65.41 
 
 
165 aa  209  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.253918  normal  0.89546 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2453  GCN5-related N-acetyltransferase  65.41 
 
 
165 aa  209  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00150599  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0937  GCN5-related N-acetyltransferase  60.9 
 
 
160 aa  207  3e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.158897  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0437  GCN5-related N-acetyltransferase  60.65 
 
 
157 aa  206  7e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.195322  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7133  GCN5-related N-acetyltransferase  64.78 
 
 
161 aa  206  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0882  GCN5-related N-acetyltransferase  64.97 
 
 
165 aa  206  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.922841 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5735  GCN5-related N-acetyltransferase  63.69 
 
 
165 aa  205  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.77189  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0250  GNAT family acetyltransferase  62.89 
 
 
163 aa  204  4e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.863666  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0703  GCN5-related N-acetyltransferase  59.62 
 
 
160 aa  203  7e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4231  GCN5-related N-acetyltransferase  62.03 
 
 
159 aa  202  2e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2412  GCN5-related N-acetyltransferase  62.89 
 
 
165 aa  202  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00700134 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4022  GCN5-related N-acetyltransferase  61.39 
 
 
159 aa  200  7e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02661  putative N-acetyltransferase  59.24 
 
 
162 aa  200  9e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.967011  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2408  GCN5-related N-acetyltransferase  62.26 
 
 
165 aa  199  9e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0178488  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1796  GCN5-related N-acetyltransferase  63.23 
 
 
195 aa  198  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3724  GCN5-related N-acetyltransferase  61.78 
 
 
160 aa  196  7.999999999999999e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2677  GCN5-related N-acetyltransferase  57.32 
 
 
161 aa  196  7.999999999999999e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.245575  normal  0.057406 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04197  N-acetyltransferase  61.29 
 
 
163 aa  196  9e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0005  GCN5-related N-acetyltransferase  58.71 
 
 
173 aa  193  6e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4148  GCN5-related N-acetyltransferase  58.71 
 
 
173 aa  193  6e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.674163 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0414  GCN5-related N-acetyltransferase  57.96 
 
 
159 aa  190  6e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.808997 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5609  GCN5-related N-acetyltransferase  55.41 
 
 
163 aa  181  3e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.460517 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0886  acetyltransferase  64.44 
 
 
165 aa  181  5.0000000000000004e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5816  acetyltransferase  53.46 
 
 
160 aa  179  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.294644  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1241  GCN5-related N-acetyltransferase  57.05 
 
 
162 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.595226 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2822  GCN5-related N-acetyltransferase  54.25 
 
 
169 aa  170  7.999999999999999e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3689  GCN5-related N-acetyltransferase  55.33 
 
 
156 aa  165  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.950669  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0985  GCN5-related N-acetyltransferase  49.35 
 
 
161 aa  158  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.622918 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0981  GCN5-related N-acetyltransferase  49.35 
 
 
161 aa  159  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1850  GCN5-related N-acetyltransferase  49.37 
 
 
160 aa  158  3e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0408298  normal  0.531787 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0626  GCN5-related N-acetyltransferase  49.35 
 
 
161 aa  158  3e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1105  GCN5-related N-acetyltransferase  49.35 
 
 
161 aa  158  3e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.913321  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1064  GCN5-related N-acetyltransferase  49.35 
 
 
161 aa  158  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0141441  normal  0.157101 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0690  GCN5-related N-acetyltransferase  50.32 
 
 
159 aa  157  4e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.823935 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6099  putative acetyltransferase family protein  50.63 
 
 
161 aa  157  5e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.29421  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0548  acetyltransferase  46.75 
 
 
157 aa  157  5e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.995158  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0813  GCN5-related N-acetyltransferase  49.01 
 
 
162 aa  157  5e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0694531  normal  0.447849 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2073  GCN5-related N-acetyltransferase  51.95 
 
 
166 aa  156  1e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.30754  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1702  acetyltransferase  46.45 
 
 
160 aa  154  4e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0061142  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4218  GCN5-related N-acetyltransferase  48.05 
 
 
161 aa  153  8e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2124  GCN5-related N-acetyltransferase  48.39 
 
 
159 aa  151  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.160054  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2198  GCN5-related N-acetyltransferase  48.05 
 
 
161 aa  151  4e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.069585 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2807  acetyltransferase  46.62 
 
 
167 aa  149  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.189234  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2496  acetyltransferase  46.62 
 
 
167 aa  149  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0177281  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2786  acetyltransferase  46.62 
 
 
167 aa  149  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.113285  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0515  acetyltransferase  46.62 
 
 
167 aa  149  1e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2868  acetyltransferase  46.62 
 
 
167 aa  149  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.278494  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2923  acetyltransferase  46.62 
 
 
167 aa  149  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00907256  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1819  acetyltransferase  46.62 
 
 
167 aa  149  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.025804  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4576  GCN5-related N-acetyltransferase  50.65 
 
 
163 aa  149  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0649129  normal  0.528305 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0602  GCN5-related N-acetyltransferase  47.74 
 
 
168 aa  147  4e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.047799 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1814  GCN5-related N-acetyltransferase  48.72 
 
 
166 aa  147  7e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000670024 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1051  GCN5-related N-acetyltransferase  45.16 
 
 
169 aa  147  7e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0453046 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1688  GCN5-related N-acetyltransferase  49.67 
 
 
166 aa  147  8e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7546  putative acetyltransferase protein  50.97 
 
 
160 aa  145  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4425  GCN5-related N-acetyltransferase  43.29 
 
 
173 aa  144  4.0000000000000006e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2432  GCN5-related N-acetyltransferase  44.44 
 
 
176 aa  144  6e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1393  GCN5-related N-acetyltransferase  42.14 
 
 
168 aa  144  6e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.232677  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2838  GCN5-related N-acetyltransferase  44.44 
 
 
176 aa  144  6e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0561  putative acetyltransferase  48.75 
 
 
161 aa  144  7.0000000000000006e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0526  GCN5-related N-acetyltransferase  42.41 
 
 
170 aa  142  2e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3690  GCN5-related N-acetyltransferase  47.13 
 
 
160 aa  141  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.337101 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1728  GCN5-related N-acetyltransferase  46.15 
 
 
188 aa  142  3e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000677629 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2131  diamine acetyltransferase 2  45.16 
 
 
156 aa  140  7e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000287953  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0709  GCN5-related N-acetyltransferase  50.65 
 
 
159 aa  139  9.999999999999999e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1199  GCN5-related N-acetyltransferase  43.31 
 
 
164 aa  139  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0312  GCN5-related N-acetyltransferase  41.14 
 
 
168 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.648752  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30670  sortase-like acyltransferase  45.68 
 
 
161 aa  138  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479101  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2565  putative acetyltransferase protein  42.95 
 
 
177 aa  136  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2927  GCN5-related N-acetyltransferase  45.28 
 
 
162 aa  136  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.782337  normal  0.494453 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0600  argininosuccinate synthase (citrulline--aspartateligase)  43.51 
 
 
159 aa  136  1e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.170062  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0429  GCN5-related N-acetyltransferase  48.7 
 
 
167 aa  136  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0682285  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1057  putative acetyltransferase  43.4 
 
 
174 aa  136  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281003  normal  0.387575 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02479  acetyltransferase, GNAT family, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G02980)  44.31 
 
 
175 aa  135  3.0000000000000003e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0591  GCN5-related N-acetyltransferase  40.65 
 
 
171 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2843  GCN5-related N-acetyltransferase  43.95 
 
 
164 aa  134  4e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0405338  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2681  GCN5-related N-acetyltransferase  46.79 
 
 
173 aa  134  4e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4180  GCN5-related N-acetyltransferase  42.95 
 
 
163 aa  134  7.000000000000001e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1415  GCN5-related N-acetyltransferase  44 
 
 
164 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.669908  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1015  GCN5-related N-acetyltransferase  42.68 
 
 
165 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000526806 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1386  GCN5-related N-acetyltransferase  43.31 
 
 
159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1404  GCN5-related N-acetyltransferase  43.31 
 
 
159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3984  GCN5-like N-acetyltransferase  41.03 
 
 
163 aa  130  6e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0163  GCN5-related N-acetyltransferase  42.11 
 
 
162 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0159  GCN5-related N-acetyltransferase  42.11 
 
 
162 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0205255  normal  0.0268459 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0976  GCN5-related N-acetyltransferase  41.88 
 
 
170 aa  129  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.416223 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2132  diamine acetyltransferase  40.4 
 
 
178 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.105649  normal  0.341096 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1584  GCN5-related N-acetyltransferase  45.51 
 
 
157 aa  128  3e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0515771 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0086  GCN5-related N-acetyltransferase  41.25 
 
 
165 aa  128  4.0000000000000003e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1420  GCN5-related N-acetyltransferase  42.04 
 
 
159 aa  126  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1786  GCN5-related N-acetyltransferase  42.04 
 
 
162 aa  125  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.823554 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>