196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2504 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2504  ThiJ/PfpI domain-containing protein  100 
 
 		 228 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3431  ThiJ/PfpI domain protein  88.55 
 
 		 228 aa  421  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2331  ThiJ/PfpI domain-containing protein  88.55 
 
 		 228 aa  418  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2442  ThiJ/PfpI domain-containing protein  80.53 
 
 		 227 aa  387  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.197595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4606  thiJ/pfpI family protein  64.16 
 
 		 227 aa  311  4.999999999999999e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.62662  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4591  thiJ/pfpI family protein  63.72 
 
 		 229 aa  309  2e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.526162  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4381  thiJ/pfpI family protein  64.86 
 
 		 227 aa  310  2e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.154289  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4720  thiJ/pfpI family protein  64.86 
 
 		 227 aa  310  2e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.122837  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4576  thiJ/pfpI family protein  64.86 
 
 		 227 aa  309  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4625  thiJ/pfpI family protein  64.16 
 
 		 229 aa  309  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.904253  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4222  thiJ/PfpI family protein  64.16 
 
 		 229 aa  308  4e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0433  ThiJ/PfpI domain protein  45.78 
 
 		 230 aa  217  1e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.781813  normal  0.897613 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0629  thiJ/pfpI family protein  58.18 
 
 		 166 aa  209  2e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.2762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2964  ThiJ/PfpI domain protein  44.44 
 
 		 226 aa  210  2e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1134  ThiJ/PfpI  45.73 
 
 		 250 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0227  ThiJ/PfpI family protein  45.02 
 
 		 235 aa  197  7.999999999999999e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3087  ThiJ/PfpI domain protein  44.54 
 
 		 230 aa  197  9e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00619766  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0419  ThiJ/PfpI  45.81 
 
 		 234 aa  197  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220711  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2992  hypothetical protein  41.88 
 
 		 273 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.152511  normal  0.155125 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3475  ThiJ/PfpI domain-containing protein  45.65 
 
 		 232 aa  196  4.0000000000000005e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2821  ThiJ/PfpI domain protein  44.74 
 
 		 227 aa  194  9e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29000  hypothetical protein  44.74 
 
 		 228 aa  191  6e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000723683 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl402  putative PFPI-like cystiene protease  42.34 
 
 		 226 aa  191  9e-48  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2700  ThiJ/PfpI domain-containing protein  41.82 
 
 		 249 aa  190  1e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4305  ThiJ/PfpI domain-containing protein  43.04 
 
 		 231 aa  189  4e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.377734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5679  ThiJ/PfpI  43.86 
 
 		 260 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6043  ThiJ/PfpI domain-containing protein  43.86 
 
 		 260 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0569087 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5530  ThiJ/PfpI domain-containing protein  46.7 
 
 		 227 aa  185  4e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.383076 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0152  ThiJ/PfpI domain protein  43.42 
 
 		 230 aa  184  1.0000000000000001e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0311  ThiJ/PfpI domain protein  40.97 
 
 		 232 aa  182  3e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.254099  normal  0.0186546 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7474  ThiJ/PfpI family protein  43.17 
 
 		 227 aa  181  6e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4674  ThiJ/PfpI domain protein  41.96 
 
 		 227 aa  181  7e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3997  hypothetical protein  43.35 
 
 		 228 aa  180  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6314  ThiJ/PfpI domain protein  41.78 
 
 		 230 aa  175  5e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2424  ThiJ/PfpI domain-containing protein  42.15 
 
 		 232 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0116  ThiJ/PfpI domain protein  38.86 
 
 		 228 aa  168  6e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5032  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.62 
 
 		 237 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.848966 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0683  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.35 
 
 		 229 aa  162  3e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3190  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.25 
 
 		 237 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.687105  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2067  ThiJ/PfpI domain protein  40.09 
 
 		 261 aa  160  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0425757  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0627  ThiJ/PfpI domain protein  41.15 
 
 		 223 aa  159  2e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0774  ThiJ/PfpI domain protein  42.22 
 
 		 254 aa  159  4e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.561024  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0933  ThiJ/PfpI family protein  37.72 
 
 		 229 aa  159  5e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1995  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.8 
 
 		 234 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3360  ThiJ/PfpI domain protein  42.41 
 
 		 226 aa  156  3e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00683077  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1577  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.11 
 
 		 235 aa  155  5.0000000000000005e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2637  ThiJ/PfpI domain protein  40.17 
 
 		 221 aa  154  1e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4361  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.53 
 
 		 228 aa  154  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2975  ThiJ/PfpI domain protein  38.86 
 
 		 230 aa  153  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.420811 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1174  ThiJ/PfpI domain protein  38.67 
 
 		 227 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3911  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40 
 
 		 224 aa  152  2.9999999999999998e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1700  DJ-1/PfpI family protein  40.89 
 
 		 227 aa  152  4e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.600879  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3144  ThiJ/PfpI domain protein  38.86 
 
 		 230 aa  152  4e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1011  ThiJ/PfpI  40.09 
 
 		 225 aa  152  4e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0431  ThiJ/PfpI domain protein  40.89 
 
 		 227 aa  152  5e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3106  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.67 
 
 		 223 aa  151  7e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.424885 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3350  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.05 
 
 		 231 aa  150  1e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.097714  normal  0.411486 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0266  ThiJ/PfpI domain protein  37.07 
 
 		 230 aa  151  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2247  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.84 
 
 		 227 aa  150  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.369253 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0479  NonF-related protein  37.17 
 
 		 229 aa  150  2e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0270  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.64 
 
 		 232 aa  149  3e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1094  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.91 
 
 		 225 aa  149  3e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.226669  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10123  ThiJ/PfpI  37.05 
 
 		 267 aa  149  3e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.882112  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0262  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.64 
 
 		 230 aa  149  4e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0270  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.64 
 
 		 230 aa  149  4e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1406  DJ-1/PfpI family protein  40.44 
 
 		 226 aa  149  5e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2826  intracellular protease/amidase, putative  37.78 
 
 		 227 aa  149  5e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.410637  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2295  peptidase  40.44 
 
 		 226 aa  149  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0524  DJ-1/PfpI family protein  40.44 
 
 		 226 aa  149  5e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0124  DJ-1/PfpI family protein  40.44 
 
 		 226 aa  149  5e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1062  DJ-1/PfpI family protein  40.44 
 
 		 226 aa  149  5e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0976  DJ-1/PfpI family protein  40.44 
 
 		 226 aa  149  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1490  DJ-1/PfpI family protein  40.44 
 
 		 226 aa  149  5e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1353  ThiJ/PfpI family protein  39.65 
 
 		 225 aa  148  6e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0376  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.5 
 
 		 230 aa  148  6e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1352  ThiJ/PfpI domain protein  38.39 
 
 		 225 aa  148  7e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0324  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.78 
 
 		 227 aa  148  9e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0093  ThiJ/PfpI  39.38 
 
 		 231 aa  147  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3509  DJ-1/PfpI family protein  37.33 
 
 		 270 aa  146  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.962862  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0819  ThiJ/PfpI domain protein  40.53 
 
 		 221 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0026  ThiJ/PfpI  39.65 
 
 		 245 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.389773  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0854  ThiJ/PfpI domain protein  36.8 
 
 		 224 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0285  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.96 
 
 		 225 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000246139 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6748  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.73 
 
 		 230 aa  146  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0805  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.78 
 
 		 225 aa  146  3e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3383  ThiJ/PfpI domain protein  37.5 
 
 		 225 aa  146  3e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0019  ThiJ/PfpI  39.38 
 
 		 230 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1370  ThiJ/PfpI  39.91 
 
 		 229 aa  145  5e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0349  ThiJ/PfpI domain protein  37.61 
 
 		 225 aa  145  6e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3319  ThiJ/PfpI  40.26 
 
 		 227 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.262803  normal  0.267473 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5801  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.09 
 
 		 227 aa  144  9e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.716355  normal  0.558329 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4837  ThiJ/PfpI domain protein  40.53 
 
 		 227 aa  144  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2650  ThiJ/PfpI  36.16 
 
 		 224 aa  144  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1380  ThiJ/PfpI domain protein  37.07 
 
 		 257 aa  142  4e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0791  ThiJ/PfpI domain-containing protein  41.2 
 
 		 229 aa  142  4e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.196046 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2230  ThiJ/PfpI  39.82 
 
 		 225 aa  142  6e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.346275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4294  ThiJ/PfpI domain protein  37.05 
 
 		 224 aa  142  6e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3926  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.4 
 
 		 225 aa  141  8e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1296  putative intracellular protease/amidase  37.95 
 
 		 175 aa  141  9e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0819  ThiJ/PfpI domain protein  38.91 
 
 		 230 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>