More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2355 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2355  major facilitator transporter  100 
 
 		 399 aa  758    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.235883  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3566  major facilitator family transporter  95.73 
 
 		 399 aa  624  1e-178  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2208  major facilitator transporter  95.98 
 
 		 399 aa  626  1e-178  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2479  major facilitator transporter  87 
 
 		 402 aa  525  1e-148  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.469359 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1589  major facilitator transporter  67.01 
 
 		 395 aa  483  1e-135  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.24766  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3304  major facilitator family transporter  67.02 
 
 		 398 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3138  major facilitator transporter  66.49 
 
 		 398 aa  462  1e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.82105 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2393  major facilitator superfamily drug efflux transporter  61.3 
 
 		 404 aa  429  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.988182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5605  major facilitator transporter  59.85 
 
 		 405 aa  428  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.919705 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5762  major facilitator transporter  60.61 
 
 		 404 aa  427  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5822  major facilitator transporter  59.65 
 
 		 405 aa  428  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7020  major facilitator transporter  60.36 
 
 		 405 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303658  normal  0.0738208 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1474  major facilitator transporter  60.36 
 
 		 405 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00116593  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6354  major facilitator transporter  60.36 
 
 		 405 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.623556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1982  major facilitator family transporter  60.21 
 
 		 400 aa  418  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.21038  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4954  major facilitator transporter  60.86 
 
 		 405 aa  421  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.960972  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0591  major facilitator family transporter  60.21 
 
 		 400 aa  419  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0684  major facilitator family transporter  59.95 
 
 		 400 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.837842  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5502  major facilitator superfamily MFS_1  63.01 
 
 		 388 aa  409  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0812471  normal  0.0619637 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03770  major facilitator family (MFS) transporter  65.28 
 
 		 401 aa  406  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5649  major facilitator transporter  60.87 
 
 		 400 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2449  major facilitator transporter  65.37 
 
 		 399 aa  381  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1223  major facilitator transporter  49.87 
 
 		 393 aa  345  6e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38000  MFS permease  52.5 
 
 		 401 aa  317  2e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3546  major facilitator transporter  50.13 
 
 		 398 aa  311  2e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3062  transporter  45.34 
 
 		 389 aa  309  4e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534836  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3302  transporter  45.34 
 
 		 389 aa  309  4e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3754  major facilitator transporter  47.64 
 
 		 407 aa  309  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.503769  normal  0.0279175 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7383  major facilitator superfamily (MSF) transporter  46.34 
 
 		 396 aa  295  8e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2790  MFS permease  47.34 
 
 		 406 aa  282  6.000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.68726  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0912  major facilitator transporter  46.56 
 
 		 405 aa  282  7.000000000000001e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.973164  normal  0.300944 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2763  major facilitator superfamily MFS_1  47.13 
 
 		 402 aa  275  7e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.689815  normal  0.779689 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1033  major facilitator superfamily transporter  47.53 
 
 		 413 aa  274  2.0000000000000002e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.854206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2509  major facilitator superfamily MFS_1  45.14 
 
 		 402 aa  272  6e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1438  major facilitator superfamily MFS_1  44.84 
 
 		 447 aa  267  2e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0949  transporter  39.07 
 
 		 406 aa  266  4e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.800881  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1014  transporter  39.07 
 
 		 406 aa  266  4e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.32709  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5771  major facilitator superfamily MFS_1  49.45 
 
 		 413 aa  265  8e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.926843 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1182  putative transporter  39.07 
 
 		 403 aa  265  1e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000458101  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0610  major facilitator transporter  42.23 
 
 		 399 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0971506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3805  major facilitator transporter  50.51 
 
 		 408 aa  262  6e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0160  major facilitator transporter  41.97 
 
 		 399 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0630  major facilitator transporter  52.74 
 
 		 409 aa  261  1e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0823424  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3344  bicyclomycin resistance protein  37.96 
 
 		 392 aa  260  3e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2743  major facilitator transporter  41.96 
 
 		 399 aa  259  4e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0608632  normal  0.943249 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0643  major facilitator transporter  41.88 
 
 		 385 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3729  major facilitator transporter  41.25 
 
 		 399 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487409  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2190  major facilitator transporter  38.86 
 
 		 394 aa  250  4e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.637684  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0871  major facilitator transporter  41.58 
 
 		 416 aa  244  3e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3334  major facilitator transporter  41.65 
 
 		 399 aa  234  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3197  major facilitator transporter  41.65 
 
 		 399 aa  234  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3455  major facilitator transporter  41.65 
 
 		 399 aa  234  2.0000000000000002e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0970  major facilitator transporter  43.03 
 
 		 395 aa  230  3e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.586357 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1860  major facilitator transporter  36.59 
 
 		 403 aa  228  1e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000002484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3162  major facilitator superfamily MFS_1  42.96 
 
 		 397 aa  224  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2274  major facilitator superfamily transporter  41.22 
 
 		 411 aa  224  2e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.670451  hitchhiker  0.000000383306 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4478  major facilitator transporter  38.28 
 
 		 407 aa  219  6e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.414241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2036  major facilitator transporter  39.59 
 
 		 402 aa  219  7e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.296988  normal  0.627164 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0257  major facilitator superfamily MFS_1  41.79 
 
 		 403 aa  217  2e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.209561  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2956  major facilitator superfamily MFS_1  43.21 
 
 		 419 aa  218  2e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.127266  hitchhiker  0.000719262 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3477  major facilitator transporter  42.37 
 
 		 405 aa  218  2e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222248  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3326  major facilitator superfamily MFS_1  40.86 
 
 		 406 aa  218  2e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3161  major facilitator transporter  41.62 
 
 		 394 aa  216  4e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4137  major facilitator superfamily MFS_1  41.3 
 
 		 389 aa  216  7e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3925  major facilitator family transporter  42.42 
 
 		 394 aa  216  8e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.51646 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1026  major facilitator transporter  42.42 
 
 		 394 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.164339 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02536  predicted transporter  42.42 
 
 		 394 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3482  major facilitator superfamily MFS_1  40.84 
 
 		 406 aa  215  9.999999999999999e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2817  major facilitator family transporter  42.42 
 
 		 394 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2964  major facilitator family transporter  42.56 
 
 		 394 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2654  major facilitator superfamily MFS_1  38.7 
 
 		 399 aa  213  7e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.400382  normal  0.458588 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2803  major facilitator family transporter  42.82 
 
 		 394 aa  211  1e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.188499  normal  0.0180883 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0024  major facilitator transporter  38.44 
 
 		 383 aa  212  1e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0151304 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3120  major facilitator family transporter  42.28 
 
 		 422 aa  211  1e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00127728  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0638  major facilitator superfamily MFS_1  38.3 
 
 		 387 aa  211  2e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1704  major facilitator transporter  36.18 
 
 		 426 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.136946  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1242  major facilitator transporter  40.05 
 
 		 433 aa  210  3e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2415  major facilitator transporter  41.98 
 
 		 415 aa  210  4e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0245324  normal  0.166892 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0212  major facilitator transporter  43.42 
 
 		 427 aa  208  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000448649  unclonable  0.0000000000115228 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2698  major facilitator transporter  42.22 
 
 		 391 aa  208  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.746968  normal  0.820419 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2960  major facilitator family transporter  42.01 
 
 		 394 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0152929 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3408  major facilitator transporter  43 
 
 		 431 aa  207  3e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000015695  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1909  major facilitator superfamily MFS_1  40.72 
 
 		 408 aa  207  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.765785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3465  MFS transporter  42.27 
 
 		 405 aa  207  4e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3428  major facilitator family transporter  42.27 
 
 		 399 aa  206  4e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0548  major facilitator transporter  38.78 
 
 		 401 aa  207  4e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3303  major facilitator superfamily MFS_1  42.54 
 
 		 419 aa  207  4e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00459923  normal  0.0115406 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0862  major facilitator superfamily MFS_1  41.38 
 
 		 399 aa  206  4e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1462  major facilitator transporter  39.06 
 
 		 400 aa  206  5e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.22661 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4533  major facilitator transporter  40.05 
 
 		 411 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.229762  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6027  major facilitator transporter  41.4 
 
 		 403 aa  206  5e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11639  normal  0.400144 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3830  major facilitator transporter  40.05 
 
 		 411 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.237049  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0894  major facilitator superfamily MFS_1  41.73 
 
 		 399 aa  206  6e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0703604  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5265  major facilitator superfamily MFS_1  39.12 
 
 		 394 aa  206  8e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2929  major facilitator family transporter  42.04 
 
 		 394 aa  206  9e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2995  major facilitator family transporter  42.15 
 
 		 394 aa  205  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244716 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3118  major facilitator family protein  42.15 
 
 		 394 aa  205  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.126701 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3465  major facilitator family transporter  42.01 
 
 		 399 aa  205  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1246  putative transporter  42.01 
 
 		 399 aa  205  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.580202  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0386  putative transporter  42.01 
 
 		 399 aa  205  1e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>