More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2339 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3575  TonB-dependent siderophore receptor  94.88 
 
 		 801 aa  1554    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2582  TonB-dependent siderophore receptor  77.33 
 
 		 802 aa  1277    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.431715  normal  0.0101305 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2196  TonB-dependent siderophore receptor  94.26 
 
 		 801 aa  1546    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2339  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 800 aa  1630    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2781  TonB-dependent siderophore receptor  43.68 
 
 		 805 aa  592  1e-167  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150566  normal  0.217763 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3084  TonB-dependent siderophore receptor  41.39 
 
 		 819 aa  575  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39820  putative tonB-dependent receptor protein  42.05 
 
 		 804 aa  575  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3374  putative tonB-dependent receptor protein  41.2 
 
 		 804 aa  570  1e-161  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.128787  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3798  TonB-dependent siderophore receptor  39.23 
 
 		 809 aa  553  1e-156  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3358  TonB-dependent siderophore receptor  40.64 
 
 		 808 aa  552  1e-155  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.260724  normal  0.726447 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3462  TonB-dependent siderophore receptor  40.48 
 
 		 728 aa  509  1e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2064  TonB-dependent siderophore receptor  40.52 
 
 		 734 aa  505  1e-141  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000430928 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2237  TonB-dependent siderophore receptor  41.34 
 
 		 777 aa  505  1e-141  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2590  outer membrane ferric siderophore receptor  41.59 
 
 		 771 aa  501  1e-140  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.238925 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3243  TonB-dependent siderophore receptor  40.83 
 
 		 728 aa  498  1e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.181533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0972  TonB-dependent siderophore receptor  42.25 
 
 		 762 aa  498  1e-139  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.804591  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2123  TonB-dependent siderophore receptor  42.61 
 
 		 725 aa  495  9.999999999999999e-139  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1110  TonB-dependent siderophore receptor  40.8 
 
 		 768 aa  495  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5451  TonB-dependent siderophore receptor  37.98 
 
 		 823 aa  489  1e-137  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.877438 
 
 
-
 
NC_003296  RS00871  ferric siderophore receptor protein  39.94 
 
 		 746 aa  486  1e-136  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.619675  normal  0.877748 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5515  TonB-dependent siderophore receptor  41.43 
 
 		 726 aa  488  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1714  TonB-dependent siderophore receptor  37.96 
 
 		 729 aa  488  1e-136  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.666149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3327  TonB-dependent siderophore receptor  37.39 
 
 		 804 aa  480  1e-134  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218834 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3719  TonB-dependent siderophore receptor  39.85 
 
 		 753 aa  482  1e-134  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.525992  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4497  ferric siderophore receptor protein (TonB-dependent siderophore receptor)  38.3 
 
 		 744 aa  480  1e-134  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00504252  normal  0.0702404 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5891  TonB-dependent siderophore receptor  40.54 
 
 		 772 aa  478  1e-133  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2186  TonB-dependent siderophore receptor  40.54 
 
 		 772 aa  478  1e-133  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6957  TonB-dependent siderophore receptor  41.65 
 
 		 749 aa  473  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1088  TonB-dependent siderophore receptor  39.61 
 
 		 737 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2620  TonB-dependent siderophore receptor  40.84 
 
 		 770 aa  463  1e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.526793  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1108  TonB-dependent siderophore receptor  38.52 
 
 		 761 aa  464  1e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.441045 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3686  TonB-dependent siderophore receptor  38.66 
 
 		 754 aa  462  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0434  TonB-dependent siderophore receptor  40.37 
 
 		 753 aa  461  9.999999999999999e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2129  TonB-dependent siderophore receptor  39.76 
 
 		 722 aa  457  1e-127  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.759874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4013  TonB-dependent siderophore receptor  37.36 
 
 		 879 aa  457  1e-127  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.302904 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4403  TonB-dependent siderophore receptor  40.61 
 
 		 773 aa  459  1e-127  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.109366 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1736  TonB-dependent receptor protein  37.73 
 
 		 737 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00567556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2294  TonB-dependent siderophore receptor  40.03 
 
 		 773 aa  456  1.0000000000000001e-126  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3757  TonB-dependent siderophore receptor  37.05 
 
 		 851 aa  450  1e-125  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0566087 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4052  TonB-dependent siderophore receptor  36.18 
 
 		 839 aa  449  1e-125  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1625  TonB-dependent siderophore receptor  37.32 
 
 		 746 aa  442  1e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.930758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2068  TonB-dependent siderophore receptor  39.22 
 
 		 729 aa  445  1e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.839532  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3084  TonB-dependent siderophore receptor  39.38 
 
 		 764 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.159276  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1878  TonB-dependent siderophore receptor  39.71 
 
 		 722 aa  439  9.999999999999999e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3007  TonB-dependent siderophore receptor  38.98 
 
 		 730 aa  441  9.999999999999999e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796938 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4406  TonB-dependent siderophore receptor  37.92 
 
 		 709 aa  432  1e-119  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.684267  normal  0.0387925 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1656  ferrichrome receptor FcuA  36.43 
 
 		 720 aa  432  1e-119  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000210688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2373  ferrichrome receptor FcuA  36.02 
 
 		 763 aa  430  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000216306  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1500  TonB-dependent siderophore receptor  37.28 
 
 		 755 aa  432  1e-119  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000356406  normal  0.318798 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2469  TonB-dependent siderophore receptor  36.02 
 
 		 768 aa  429  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000279609  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2266  TonB-dependent siderophore receptor  37.32 
 
 		 724 aa  421  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.238084  normal  0.145177 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2858  TonB-dependent siderophore receptor  35.9 
 
 		 756 aa  420  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.578501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2049  TonB-dependent siderophore receptor  36.14 
 
 		 764 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.379645  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3527  TonB-dependent siderophore receptor  36.83 
 
 		 761 aa  419  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.650234 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2669  putative ferric siderophore receptor protein precursor  38.33 
 
 		 742 aa  414  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.765579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4079  TonB-dependent siderophore receptor  37.25 
 
 		 729 aa  415  1e-114  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.502501  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0629  putative ferric siderophore receptor protein  38.02 
 
 		 700 aa  410  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.466758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02105  hypothetical protein  35.39 
 
 		 730 aa  411  1e-113  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1058  TonB-dependent siderophore receptor  35.8 
 
 		 728 aa  407  1.0000000000000001e-112  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0962342  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3905  TonB-dependent siderophore receptor  37.32 
 
 		 731 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4496  ferric siderophore receptor protein  33.29 
 
 		 804 aa  398  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.131724 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3800  TonB-dependent siderophore receptor  35.94 
 
 		 712 aa  393  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.647138 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0825  TonB-dependent siderophore receptor  34.4 
 
 		 759 aa  392  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000404003  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1003  TonB-dependent siderophore receptor  36.96 
 
 		 758 aa  392  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3864  TonB-dependent siderophore receptor  27.02 
 
 		 811 aa  232  2e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.952597 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0531  TonB-dependent siderophore receptor  29.28 
 
 		 727 aa  229  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.45334 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4128  TonB-dependent siderophore receptor  26.93 
 
 		 811 aa  227  8e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1104  TonB-dependent siderophore receptor  28.05 
 
 		 728 aa  224  6e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0413225  normal  0.151659 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0715  TonB-dependent siderophore receptor  28.29 
 
 		 698 aa  223  9e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4079  TonB-dependent siderophore receptor  28.38 
 
 		 727 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3864  TonB-dependent siderophore receptor  29.93 
 
 		 710 aa  217  5e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0182976  normal  0.0196444 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1847  TonB-dependent siderophore receptor  29.83 
 
 		 729 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.343723  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1610  TonB-dependent siderophore receptor, putative  28.88 
 
 		 724 aa  215  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.317263  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3769  TonB-dependent siderophore receptor  29.34 
 
 		 724 aa  213  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.503702  normal  0.128914 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0800  putative ferrisiderophore receptor signal peptide protein  28.1 
 
 		 705 aa  211  3e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1424  TonB-dependent siderophore receptor  29.29 
 
 		 710 aa  209  1e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.550485 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26410  TonB-dependent siderophore receptor  26.88 
 
 		 742 aa  208  4e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6693  TonB-dependent siderophore receptor  27.35 
 
 		 726 aa  206  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.907714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0747  TonB-dependent siderophore receptor  26.52 
 
 		 702 aa  204  6e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.429786 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0746  TonB-dependent siderophore receptor  28.38 
 
 		 774 aa  202  9.999999999999999e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.612883  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4689  TonB-dependent siderophore receptor  28.61 
 
 		 743 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.141202  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3674  TonB-dependent siderophore receptor  28.61 
 
 		 743 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5036  TonB-dependent siderophore receptor  28.88 
 
 		 751 aa  201  3.9999999999999996e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.549683 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5420  TonB-dependent siderophore receptor  28.67 
 
 		 743 aa  201  5e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00589363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3848  TonB-dependent siderophore receptor  28.61 
 
 		 743 aa  200  7e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.617009 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1460  TonB-dependent siderophore receptor  28.11 
 
 		 712 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0192209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2436  TonB-dependent siderophore receptor  28.94 
 
 		 743 aa  198  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.849974  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0817  TonB-dependent siderophore receptor  26.32 
 
 		 702 aa  196  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.682704 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3576  TonB-dependent siderophore receptor  28.35 
 
 		 743 aa  196  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0391438 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0859  TonB-dependent siderophore receptor  26.79 
 
 		 716 aa  192  2e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.308459  normal  0.654986 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3471  TonB-dependent siderophore receptor  28.15 
 
 		 728 aa  192  2e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30860  TonB-dependent siderophore receptor  26.24 
 
 		 710 aa  187  5e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.950998  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3544  TonB-dependent siderophore receptor  25.96 
 
 		 727 aa  181  4e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3322  TonB-dependent siderophore receptor  27.19 
 
 		 828 aa  181  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4499  TonB-dependent siderophore receptor  26.99 
 
 		 706 aa  177  9e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.883355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  28.36 
 
 		 778 aa  175  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3692  TonB-dependent siderophore receptor  27.49 
 
 		 685 aa  175  3.9999999999999995e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.235893  normal  0.294422 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5029  TonB-dependent siderophore receptor  26.38 
 
 		 708 aa  174  5e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02690  TonB-dependent outer membrane Receptor  27.38 
 
 		 704 aa  173  1e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3666  TonB-dependent siderophore receptor  26 
 
 		 828 aa  169  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.476594 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>