More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2253 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2253  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 150 aa  301  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.41621 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3654  AsnC family transcriptional regulator  98 
 
 		 150 aa  296  8e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.652565  normal  0.0825689 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2249  AsnC family transcriptional regulator  96.67 
 
 		 150 aa  294  2e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.17304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2076  AsnC family transcriptional regulator  97.33 
 
 		 150 aa  294  3e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46460  Transcriptional regulator, AsnC-fanily  74.67 
 
 		 151 aa  235  2e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3514  AsnC family transcriptional regulator  72.19 
 
 		 153 aa  229  1e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0500665  normal  0.428471 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0181  putative transcriptional regulator, AsnC family  67.33 
 
 		 150 aa  210  7e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0427  transcriptional regulator, AsnC family  66.67 
 
 		 150 aa  208  2e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3737  transcriptional regulator, AsnC family  64.43 
 
 		 150 aa  195  1.0000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.659957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7984  transcriptional regulator, AsnC family  60.4 
 
 		 150 aa  186  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3989  AsnC family transcriptional regulator  59.15 
 
 		 151 aa  177  4.999999999999999e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3768  transcriptional regulator, AsnC family  58.45 
 
 		 151 aa  175  2e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3658  AsnC family transcriptional regulator  45.77 
 
 		 149 aa  130  5e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1307  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 159 aa  128  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4417  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 159 aa  128  3e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.60947 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3355  putative transcriptional regulator, AsnC family  45.33 
 
 		 150 aa  128  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.417846  normal  0.0189646 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0512  AsnC family transcriptional regulator  44.37 
 
 		 158 aa  127  7.000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.981269 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0914  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 159 aa  126  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.222083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4542  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 		 159 aa  126  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0571  transcriptional regulator, AsnC family  42.67 
 
 		 154 aa  124  3e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0193  transcriptional regulator, AsnC family  45.7 
 
 		 161 aa  124  3e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.740343  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0071  AsnC family transcriptional regulator  45.77 
 
 		 155 aa  124  3e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1429  AsnC family transcriptional regulator  40.56 
 
 		 157 aa  124  5e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1569  AsnC family transcriptional regulator  46.31 
 
 		 172 aa  124  6e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.194361  normal  0.155211 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4567  AsnC family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 158 aa  123  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.328768 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1361  AsnC family transcriptional regulator  46.04 
 
 		 167 aa  122  1e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.658235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7861  putative transcriptional regulator, AsnC family  43.66 
 
 		 150 aa  122  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0789573  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0165  transcriptional regulator, AsnC family  43.05 
 
 		 155 aa  121  4e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00375326  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2209  AsnC family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 166 aa  120  4e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 153 aa  120  7e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1351  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 155 aa  120  8e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0328  transcriptional regulator, AsnC family protein  39.33 
 
 		 156 aa  120  8e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0403986  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2383  transcriptional regulator, AsnC family  47.14 
 
 		 152 aa  119  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000319505  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3973  AsnC family transcriptional regulator  42.96 
 
 		 154 aa  118  3e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.918788  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 153 aa  118  3e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2720  transcriptional regulator, AsnC family  43.66 
 
 		 155 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.380031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4773  transcriptional regulator, AsnC family  42.67 
 
 		 155 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213128  hitchhiker  0.0021999 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3924  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 		 150 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1999  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 155 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.267629  normal  0.0117406 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0301  AsnC family transcriptional regulator  42.95 
 
 		 160 aa  117  6e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0951908  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1319  AsnC family transcriptional regulator  42.95 
 
 		 160 aa  117  6e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2510  AsnC family transcriptional regulator  42.95 
 
 		 160 aa  117  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161372  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0991  AsnC family transcriptional regulator  42.95 
 
 		 160 aa  117  6e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1253  AsnC family transcriptional regulator  42.95 
 
 		 160 aa  117  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0576  AsnC family transcriptional regulator  42.95 
 
 		 160 aa  117  6e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1325  AsnC family transcriptional regulator  42.95 
 
 		 160 aa  117  6e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1485  AsnC family transcriptional regulator  42.95 
 
 		 159 aa  117  7e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.457516  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0655  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 196 aa  116  7.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6457  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 158 aa  117  7.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.545436 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1369  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 153 aa  116  9e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.362978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2896  AsnC family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 164 aa  115  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1059  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 159 aa  116  9.999999999999999e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0704538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0244  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 162 aa  115  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5049  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 		 154 aa  115  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.778931 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2497  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 156 aa  115  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.38008  normal  0.590435 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4321  AsnC family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.468859  normal  0.287831 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2311  AsnC family transcriptional regulator  42.28 
 
 		 161 aa  115  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  hitchhiker  0.00316329 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0257  AsnC family transcriptional regulator  42.14 
 
 		 166 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1877  AsnC family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 157 aa  115  3e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2981  transcriptional regulator, AsnC family  42.96 
 
 		 175 aa  115  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.033192 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3144  AsnC family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 152 aa  114  3e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.18277  normal  0.966672 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3438  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 		 154 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.950868 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1942  AsnC family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 155 aa  114  3.9999999999999997e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0292999  normal  0.532082 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1577  AsnC family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 166 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3419  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 154 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.729086 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0229  AsnC family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 166 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1745  transcriptional regulator, AsnC family  45.71 
 
 		 155 aa  114  3.9999999999999997e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2022  AsnC family transcriptional regulator  42.36 
 
 		 157 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3648  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 156 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1288  AsnC family transcriptional regulator  40.97 
 
 		 157 aa  114  3.9999999999999997e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5122  transcriptional regulator, AsnC family  40.67 
 
 		 158 aa  114  5e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.499071  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0368  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 154 aa  114  6e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.937008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2113  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 157 aa  114  6e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.264729  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6217  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 158 aa  113  6.9999999999999995e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.662862  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2309  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 157 aa  113  6.9999999999999995e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3138  transcriptional regulator AsnC family  39.44 
 
 		 155 aa  113  6.9999999999999995e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3558  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 153 aa  113  6.9999999999999995e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3337  AsnC family transcriptional regulator  39.49 
 
 		 166 aa  114  6.9999999999999995e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.993463 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0704  transcriptional regulator, AsnC family  42.57 
 
 		 158 aa  113  7.999999999999999e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0580  AsnC family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 178 aa  113  7.999999999999999e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015391  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 153 aa  113  7.999999999999999e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  38.67 
 
 		 153 aa  113  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1609  transcriptional regulator, AsnC family  38.46 
 
 		 153 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.177256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4446  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 155 aa  112  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.386761 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2653  putative leucine-responsive regulatory protein  42.86 
 
 		 166 aa  112  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.326874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1393  AsnC family transcriptional regulator  41.55 
 
 		 159 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00371319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2050  AsnC family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 150 aa  112  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2098  transcriptional regulator, AsnC family  40 
 
 		 155 aa  112  1.0000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2901  transcriptional regulator, AsnC family  38.67 
 
 		 154 aa  113  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.225499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2037  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 158 aa  112  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0190388 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2299  AsnC family transcriptional regulator  41.72 
 
 		 156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073028 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_7362  AsnC family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 169 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0360859  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1158  AsnC family transcriptional regulator  43.26 
 
 		 159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.15264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2390  transcriptional regulator, AsnC family  40.13 
 
 		 166 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5150  transcriptional regulator, AsnC family  40 
 
 		 154 aa  111  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4183  AsnC family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 195 aa  111  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.467753 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2461  leucine-responsive transcriptional regulator  42.25 
 
 		 161 aa  111  3e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000018296  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2996  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 156 aa  111  3e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0252668  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4642  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 		 154 aa  111  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4647  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 158 aa  111  3e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>