More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2149 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_2009  beta-ketothiolase  98.22 
 
 		 394 aa  776    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0651285  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3754  beta-ketothiolase  97.72 
 
 		 394 aa  751    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.414029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2196  beta-ketothiolase  91.62 
 
 		 394 aa  708    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.858736 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2149  beta-ketothiolase  100 
 
 		 394 aa  792    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00811795 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1536  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  73.54 
 
 		 396 aa  596  1e-169  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.567648 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1841  beta-ketothiolase  71.83 
 
 		 394 aa  579  1e-164  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0332  beta-ketothiolase  70.08 
 
 		 421 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000471879  hitchhiker  0.00997806 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0031  beta-ketothiolase  69.85 
 
 		 398 aa  551  1e-155  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0032  beta-ketothiolase  69.37 
 
 		 395 aa  544  1e-153  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0014  beta-ketothiolase  68.86 
 
 		 395 aa  541  9.999999999999999e-153  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.962279 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1637  beta-ketothiolase  65.73 
 
 		 394 aa  538  9.999999999999999e-153  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.363472 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1910  beta-ketothiolase  65.73 
 
 		 394 aa  539  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.614831  normal  0.0602088 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1581  beta-ketothiolase  65.73 
 
 		 394 aa  540  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.328438  normal  0.0356466 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0025  beta-ketothiolase  68.86 
 
 		 395 aa  537  1e-151  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0975  beta-ketothiolase  63.43 
 
 		 394 aa  521  1e-147  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1353  beta-ketothiolase  63.94 
 
 		 394 aa  518  1e-146  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1362  beta-ketothiolase  63.94 
 
 		 394 aa  518  1e-146  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2335  beta-ketothiolase  62.66 
 
 		 394 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.268919  normal  0.101585 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6768  beta-ketothiolase  63.73 
 
 		 397 aa  511  1e-144  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1850  beta-ketothiolase  62.4 
 
 		 394 aa  511  1e-144  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.373704  normal  0.0696668 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6874  beta-ketothiolase  63.73 
 
 		 397 aa  511  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000797473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2261  beta-ketothiolase  62.92 
 
 		 394 aa  514  1e-144  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.955375  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2160  beta-ketothiolase  63.17 
 
 		 427 aa  511  1e-144  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.473084  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5365  beta-ketothiolase  63.98 
 
 		 409 aa  514  1e-144  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199368  normal  0.275852 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0091  beta-ketothiolase  62.66 
 
 		 394 aa  509  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.383998  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1316  beta-ketothiolase  62.66 
 
 		 394 aa  509  1e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0933153  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2325  beta-ketothiolase  62.66 
 
 		 394 aa  508  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2197  beta-ketothiolase  62.92 
 
 		 427 aa  509  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.112905  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1805  beta-ketothiolase  62.66 
 
 		 427 aa  508  1e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.815366  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1076  beta-ketothiolase  62.66 
 
 		 394 aa  509  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1553  beta-ketothiolase  63.48 
 
 		 397 aa  509  1e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5771  beta-ketothiolase  63.48 
 
 		 397 aa  510  1e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6276  beta-ketothiolase  63.48 
 
 		 397 aa  509  1e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.115814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5531  beta-ketothiolase  63.48 
 
 		 397 aa  511  1e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.649531  normal  0.870894 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0012  beta-ketothiolase  65.47 
 
 		 389 aa  505  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0216237 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1931  beta-ketothiolase  64.38 
 
 		 394 aa  504  1e-141  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.488777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1950  acetyl-CoA acetyltransferase  63.08 
 
 		 395 aa  501  1e-141  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273343 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1734  beta-ketothiolase  64.38 
 
 		 394 aa  504  1e-141  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.6798  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5080  beta-ketothiolase  61.83 
 
 		 396 aa  498  1e-140  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0809  beta-ketothiolase  63.08 
 
 		 392 aa  499  1e-140  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1577  beta-ketothiolase  63.61 
 
 		 394 aa  499  1e-140  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1159  beta-ketothiolase  63.43 
 
 		 394 aa  495  1e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0060  beta-ketothiolase  63.17 
 
 		 394 aa  493  9.999999999999999e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.629911 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2893  beta-ketothiolase  63.75 
 
 		 393 aa  492  9.999999999999999e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.229185 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1871  beta-ketothiolase  62.85 
 
 		 395 aa  491  1e-137  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1951  acetyl-CoA acetyltransferase  61.54 
 
 		 393 aa  487  1e-136  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0022  beta-ketothiolase  65.73 
 
 		 400 aa  484  1e-135  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1354  beta-ketothiolase  65.22 
 
 		 389 aa  481  1e-135  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2663  beta-ketothiolase  62.94 
 
 		 393 aa  483  1e-135  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.574059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5309  acetyl-CoA acetyltransferase  60.87 
 
 		 398 aa  480  1e-134  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.330072 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0377  beta-ketothiolase  62.92 
 
 		 395 aa  479  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4451  acetyl-CoA acetyltransferase  61.28 
 
 		 392 aa  481  1e-134  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0702  acetyl-CoA acetyltransferase  59.23 
 
 		 396 aa  475  1e-133  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000219092 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3026  beta-ketothiolase  59.74 
 
 		 391 aa  473  1e-132  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.345239  normal  0.537231 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2273  beta-ketothiolase  60.51 
 
 		 393 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6830  acetyl-CoA acetyltransferase  61.73 
 
 		 393 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.369067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2659  beta-ketothiolase  60.91 
 
 		 393 aa  463  1e-129  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.738973  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3331  beta-ketothiolase  61.86 
 
 		 394 aa  463  1e-129  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0305  acetyl-CoA acetyltransferase  57.69 
 
 		 393 aa  458  9.999999999999999e-129  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.372663 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4348  acetyl-CoA acetyltransferase  58.97 
 
 		 396 aa  455  1e-127  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.430233  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3022  beta-ketothiolase  58.82 
 
 		 393 aa  451  1.0000000000000001e-126  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00935658  normal  0.736627 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0914  beta-ketothiolase  58.02 
 
 		 394 aa  448  1e-125  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.579266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0927  beta-ketothiolase  57.76 
 
 		 394 aa  446  1.0000000000000001e-124  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0480332  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0262  beta-ketothiolase  56.67 
 
 		 391 aa  439  9.999999999999999e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3854  beta-ketothiolase  60.25 
 
 		 395 aa  436  1e-121  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0688  beta-ketothiolase  57.72 
 
 		 395 aa  434  1e-120  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.494591  normal  0.737365 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16380  acetoacetyl-CoA thiolase  58.21 
 
 		 397 aa  426  1e-118  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.506905  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2389  acetyl-CoA acetyltransferase  52.02 
 
 		 402 aa  398  9.999999999999999e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.166385  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1351  acetyl-CoA acetyltransferase  49.11 
 
 		 393 aa  391  1e-107  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.428024  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2460  acetyl-CoA acetyltransferase  50.38 
 
 		 392 aa  388  1e-107  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2170  acetyl-CoA acetyltransferase  50.63 
 
 		 392 aa  391  1e-107  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3601  acetyl-CoA acetyltransferase  49.75 
 
 		 393 aa  385  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0916866  normal  0.155307 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4076  acetyl-CoA acetyltransferase  50.65 
 
 		 391 aa  382  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0498749  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1701  acetyl-CoA acetyltransferase  49.1 
 
 		 393 aa  384  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.689247  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3932  acetyl-CoA acetyltransferase  50.65 
 
 		 391 aa  382  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.650395  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3765  acetyl-CoA acetyltransferase  50.65 
 
 		 391 aa  382  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4043  acetyl-CoA acetyltransferase  50.65 
 
 		 391 aa  382  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4240  acetyl-CoA acetyltransferase  50.65 
 
 		 391 aa  382  1e-105  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.749727  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2256  acetyl-CoA acetyltransferase  48.59 
 
 		 393 aa  382  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0160796  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1130  acetyl-CoA acetyltransferase  49.61 
 
 		 394 aa  383  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2342  acetyl-CoA acetyltransferase  48.34 
 
 		 393 aa  382  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0411622 
 
 
-
 
NC_004310  BR1772  acetyl-CoA acetyltransferase  50.77 
 
 		 394 aa  379  1e-104  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.499723  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4129  acetyl-CoA acetyltransferase  50.39 
 
 		 391 aa  380  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00256645  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2165  acetyl-CoA acetyltransferase  48.59 
 
 		 393 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.810092  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4150  acetyl-CoA acetyltransferase  50.65 
 
 		 391 aa  381  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0127373  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0970  acetyl-CoA acetyltransferase  48.08 
 
 		 393 aa  379  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1844  acetyl-CoA acetyltransferase  48.08 
 
 		 393 aa  381  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.980991  normal  0.0817271 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1109  acetyl-CoA acetyltransferase  50.39 
 
 		 391 aa  381  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.228356  normal  0.198631 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2051  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  49.87 
 
 		 396 aa  379  1e-104  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2783  acetyl-CoA acetyltransferase  48.21 
 
 		 393 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2330  acetyl-CoA acetyltransferase  48.34 
 
 		 393 aa  378  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.2487  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1138  acetyl-CoA acetyltransferase  49.36 
 
 		 393 aa  377  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.495494 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2202  acetyl-CoA acetyltransferase  48.34 
 
 		 393 aa  378  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0577057  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2140  acetyl-CoA acetyltransferase  48.35 
 
 		 392 aa  377  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1707  acetyl-CoA acetyltransferase  50.51 
 
 		 394 aa  377  1e-103  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0221511  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1484  acetyl-CoA acetyltransferase  48.34 
 
 		 393 aa  375  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.226113  normal  0.0550721 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1784  acetyl-CoA acetyltransferase  48.86 
 
 		 394 aa  375  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2158  acetyl-CoA acetyltransferase  48.47 
 
 		 393 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1934  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  49.37 
 
 		 396 aa  376  1e-103  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.519061  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2772  acetyl-CoA acetyltransferase  48.47 
 
 		 393 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>