11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2132 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2132  hypothetical protein  100 
 
 		 104 aa  209  1e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  unclonable  4.71874e-16  hitchhiker  0.000000146213 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3771  hypothetical protein  88.12 
 
 		 128 aa  177  4e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  0.000000396878  unclonable  0.000000439837 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1992  hypothetical protein  87.13 
 
 		 104 aa  174  3e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.00000000000239023  decreased coverage  0.00000882432 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1328  hypothetical protein  66 
 
 		 123 aa  141  3e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.273701 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4599  hypothetical protein  73.2 
 
 		 129 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2803  hypothetical protein  73.2 
 
 		 123 aa  130  5e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0308938  normal  0.111053 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0573  hypothetical protein  71.13 
 
 		 156 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2358  hypothetical protein  44 
 
 		 126 aa  67.4  0.00000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.255904  unclonable  0.0000000160936 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0897  hypothetical protein  38 
 
 		 116 aa  57  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.867827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1634  hypothetical protein  37.5 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.793016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1788  hypothetical protein  37.5 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.108627  normal  0.611433 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>