132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2093 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2093  hypothetical protein  100 
 
 		 97 aa  200  5e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.302469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1957  hypothetical protein  95.88 
 
 		 97 aa  193  6e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0569002  normal  0.325909 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1937  hypothetical protein  94.85 
 
 		 97 aa  170  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0325431 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2669  hypothetical protein  79.79 
 
 		 96 aa  163  9e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0199077  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2403  hypothetical protein  76.6 
 
 		 96 aa  159  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.79558  normal  0.741886 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3239  hypothetical protein  77.32 
 
 		 97 aa  159  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0371902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3445  hypothetical protein  77.89 
 
 		 110 aa  158  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0684  hypothetical protein  56.84 
 
 		 97 aa  102  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1110  hypothetical protein  55.79 
 
 		 96 aa  100  7e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2129  hypothetical protein  51.06 
 
 		 95 aa  99.4  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.140278  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2045  hypothetical protein  51.06 
 
 		 95 aa  99.4  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0164673  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3708  hypothetical protein  53.68 
 
 		 98 aa  96.3  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.738458 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6118  hypothetical protein  51.04 
 
 		 96 aa  95.9  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1754  hypothetical protein  49.47 
 
 		 114 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0345  hypothetical protein  52.69 
 
 		 96 aa  95.1  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0272597  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4815  protein of unknown function DUF1330  48.42 
 
 		 114 aa  94.7  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.353052  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2483  hypothetical protein  45.83 
 
 		 97 aa  93.6  7e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0599  hypothetical protein  52.69 
 
 		 96 aa  93.2  9e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.543167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0785  hypothetical protein  49.46 
 
 		 95 aa  93.2  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.560924  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2630  hypothetical protein  47.37 
 
 		 114 aa  92.8  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.152361 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3539  hypothetical protein  49.46 
 
 		 95 aa  91.3  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4324  protein of unknown function DUF1330  52.69 
 
 		 95 aa  90.9  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4587  protein of unknown function DUF1330  50.54 
 
 		 95 aa  88.2  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.226521 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1707  hypothetical protein  46.32 
 
 		 97 aa  87.8  4e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1359  hypothetical protein  46.32 
 
 		 103 aa  87  7e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.102563  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0196  hypothetical protein  44.21 
 
 		 100 aa  87  8e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1641  hypothetical protein  45.36 
 
 		 97 aa  86.3  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.825876  hitchhiker  0.000000345307 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1988  hypothetical protein  48.91 
 
 		 95 aa  85.5  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.332704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2371  hypothetical protein  50 
 
 		 96 aa  85.5  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.762767  normal  0.447407 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1233  hypothetical protein  47.31 
 
 		 95 aa  85.1  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.346444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1519  protein of unknown function DUF1330  48.42 
 
 		 114 aa  83.6  7e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.407227 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0450  hypothetical protein  49.45 
 
 		 96 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1054  hypothetical protein  47.83 
 
 		 96 aa  83.2  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2103  hypothetical protein  49.45 
 
 		 96 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.40869  normal  0.72885 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1800  protein of unknown function DUF1330  46.32 
 
 		 114 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0472957  normal  0.250055 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0358  hypothetical protein  43.62 
 
 		 214 aa  82  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0495198  normal  0.391408 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1521  hypothetical protein  46.32 
 
 		 114 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.997326  normal  0.585973 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0334  hypothetical protein  41.05 
 
 		 100 aa  81.6  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.255499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1268  hypothetical protein  40.86 
 
 		 95 aa  80.1  0.000000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.253243  normal  0.411304 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0386  hypothetical protein  43.75 
 
 		 103 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0341  protein of unknown function DUF1330  41.67 
 
 		 102 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00521106  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3703  hypothetical protein  44.21 
 
 		 96 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.12428 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0434  hypothetical protein  42.71 
 
 		 103 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3445  protein of unknown function DUF1330  42.39 
 
 		 96 aa  77  0.00000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6432  hypothetical protein  43.16 
 
 		 97 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.386875 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1090  hypothetical protein  41.76 
 
 		 97 aa  76.3  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1067  protein of unknown function DUF1330  44.57 
 
 		 96 aa  76.3  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.108805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0971  protein of unknown function DUF1330  44.57 
 
 		 96 aa  76.3  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0127294  normal  0.0142522 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3229  hypothetical protein  42.55 
 
 		 95 aa  75.1  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6409  protein of unknown function DUF1330  44.21 
 
 		 97 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1325  hypothetical protein  44.57 
 
 		 96 aa  75.1  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1128  hypothetical protein  45.05 
 
 		 96 aa  74.3  0.0000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.380909 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4723  hypothetical protein  40.21 
 
 		 102 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.153219  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2667  protein of unknown function DUF1330  41.67 
 
 		 97 aa  73.9  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0338  hypothetical protein  38.54 
 
 		 98 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.418889  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3183  hypothetical protein  40.86 
 
 		 96 aa  73.6  0.0000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.614337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1874  hypothetical protein  38.54 
 
 		 98 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.446386  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1789  hypothetical protein  38.54 
 
 		 98 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.35863  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2304  hypothetical protein  42.71 
 
 		 97 aa  72.4  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2076  hypothetical protein  41.49 
 
 		 95 aa  72  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0008  hypothetical protein  43.01 
 
 		 94 aa  72.4  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00922624  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2337  protein of unknown function DUF1330  42.11 
 
 		 100 aa  71.6  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0913  protein of unknown function DUF1330  41.3 
 
 		 96 aa  72  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0958  hypothetical protein  38.54 
 
 		 96 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0421  hypothetical protein  38.54 
 
 		 96 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0223  hypothetical protein  38.54 
 
 		 96 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0195535  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1378  hypothetical protein  38.54 
 
 		 96 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0182872  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2285  hypothetical protein  41.67 
 
 		 96 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0613201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5107  hypothetical protein  38.04 
 
 		 96 aa  68.2  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.496431 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4724  hypothetical protein  41.67 
 
 		 97 aa  65.5  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1504  hypothetical protein  34.74 
 
 		 127 aa  64.3  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1007  protein of unknown function DUF1330  43.62 
 
 		 96 aa  62.8  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7205  protein of unknown function DUF1330  39.58 
 
 		 97 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2189  protein of unknown function DUF1330  40.43 
 
 		 96 aa  60.5  0.000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.321653  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0722  protein of unknown function DUF1330  30.85 
 
 		 102 aa  60.1  0.000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2905  hypothetical protein  36.08 
 
 		 100 aa  58.9  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0092  protein of unknown function DUF1330  31.91 
 
 		 96 aa  57.4  0.00000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.273128  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3616  hypothetical protein  45.83 
 
 		 107 aa  57.4  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0727  hypothetical protein  36.46 
 
 		 98 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1076  hypothetical protein  32.98 
 
 		 99 aa  56.2  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262747  normal  0.355591 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1655  protein of unknown function DUF1330  31.91 
 
 		 96 aa  56.6  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3241  protein of unknown function DUF1330  36.46 
 
 		 98 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.386279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5022  protein of unknown function DUF1330  37.89 
 
 		 112 aa  54.3  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0320092  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4093  hypothetical protein  39.58 
 
 		 97 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1844  hypothetical protein  34 
 
 		 101 aa  53.9  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4055  hypothetical protein  33.68 
 
 		 112 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.150808 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6612  hypothetical protein  34.02 
 
 		 104 aa  52.8  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0310  hypothetical protein  40 
 
 		 97 aa  52.4  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.105649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6641  protein of unknown function DUF1330  31.91 
 
 		 95 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4644  protein of unknown function DUF1330  34.02 
 
 		 106 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0263146  normal  0.598238 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0458  hypothetical protein  38.96 
 
 		 105 aa  50.8  0.000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.42868  normal  0.619242 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1042  hypothetical protein  34.74 
 
 		 97 aa  50.8  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.797208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12241  hypothetical protein  27.66 
 
 		 115 aa  50.4  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0823  hypothetical protein  32.58 
 
 		 105 aa  50.1  0.000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.636113  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2987  protein of unknown function DUF1330  38.14 
 
 		 98 aa  50.1  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.55888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3743  hypothetical protein  29.47 
 
 		 98 aa  48.9  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.679918 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06041  hypothetical protein  29.79 
 
 		 99 aa  48.5  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.497862 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1194  hypothetical protein  31.91 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1905  hypothetical protein  34.74 
 
 		 98 aa  47.8  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.682108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0417  hypothetical protein  38.54 
 
 		 97 aa  47.8  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>