19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2083 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2083  hypothetical protein  100 
 
 		 466 aa  954    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0646  hypothetical protein  71.65 
 
 		 466 aa  629  1e-179  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0217  hypothetical protein  50.21 
 
 		 465 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0368818  normal  0.392085 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2085  hypothetical protein  75.09 
 
 		 243 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5213  hypothetical protein  41.79 
 
 		 482 aa  237  4e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00995542 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0079  hypothetical protein  35.42 
 
 		 470 aa  165  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0771  hypothetical protein  32.68 
 
 		 324 aa  109  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2662  PAAR repeat-containing protein  35.26 
 
 		 323 aa  106  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4885  hypothetical protein  29.12 
 
 		 323 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0979241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0769  hypothetical protein  32.99 
 
 		 325 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.627989 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0243  hypothetical protein  27.19 
 
 		 342 aa  101  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0316  hypothetical protein  23.89 
 
 		 453 aa  99.4  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2659  hypothetical protein  38.35 
 
 		 199 aa  93.2  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0887965  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4662  hypothetical protein  29.17 
 
 		 325 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.209439  normal  0.393373 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0196  hypothetical protein  34.3 
 
 		 207 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.865592 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5089  hypothetical protein  39.74 
 
 		 152 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0441  hypothetical protein  43.24 
 
 		 131 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3540  hypothetical protein  34.83 
 
 		 89 aa  48.9  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.93294  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5197  hypothetical protein  38.46 
 
 		 178 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>