More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1870 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00550  iron-enterobactin outer membrane transporter  48.24 
 
 		 746 aa  643    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000104738  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3043  TonB-dependent siderophore receptor  48.24 
 
 		 746 aa  642    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0305175  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3496  outer membrane receptor FepA  97.04 
 
 		 744 aa  1486    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0638  outer membrane receptor FepA  48.21 
 
 		 751 aa  636    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0743  outer membrane receptor FepA  48.63 
 
 		 751 aa  638    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.100086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2972  outer membrane receptor FepA  52.16 
 
 		 724 aa  675    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0370731 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2242  outer membrane receptor FepA  97.58 
 
 		 744 aa  1495    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.620188 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0697  outer membrane receptor FepA  48.63 
 
 		 751 aa  637    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37020  outer membrane receptor FepA  51.54 
 
 		 746 aa  675    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145193  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3061  outer membrane receptor FepA  48.24 
 
 		 746 aa  643    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00912473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1839  outer membrane receptor FepA  56.03 
 
 		 703 aa  742    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.228059  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0602  outer membrane receptor FepA  48.24 
 
 		 746 aa  644    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0633  outer membrane receptor FepA  48.24 
 
 		 746 aa  642    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0680  outer membrane receptor FepA  49.45 
 
 		 783 aa  639    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0125648  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3743  outer membrane receptor FepA  49.32 
 
 		 766 aa  659    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.325826  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37010  outer membrane receptor FepA  49.67 
 
 		 757 aa  665    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0110447  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0681  outer membrane receptor FepA  48.63 
 
 		 751 aa  637    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.757968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1195  outer membrane receptor FepA  52.99 
 
 		 749 aa  668    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0821218  normal  0.246562 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0624  outer membrane receptor FepA  48.63 
 
 		 751 aa  637    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1716  outer membrane receptor FepA  89.28 
 
 		 746 aa  1382    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2953  outer membrane receptor FepA  52.31 
 
 		 724 aa  677    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.246738  hitchhiker  0.000000000736095 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00539  hypothetical protein  48.24 
 
 		 746 aa  643    Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000136629  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0603  outer membrane receptor FepA  48.24 
 
 		 746 aa  644    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2919  outer membrane receptor FepA  52.31 
 
 		 724 aa  677    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.91274  normal  0.0854265 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0485  outer membrane receptor FepA  47.9 
 
 		 746 aa  642    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29350  outer membrane receptor FepA  51.44 
 
 		 746 aa  720    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.93217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52230  outer membrane receptor FepA  55.23 
 
 		 742 aa  759    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.267722 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2889  outer membrane receptor FepA  52.31 
 
 		 724 aa  677    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1870  outer membrane receptor FepA  100 
 
 		 744 aa  1523    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3075  outer membrane receptor FepA  52.31 
 
 		 724 aa  676    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.203578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3430  outer membrane receptor FepA  47.86 
 
 		 759 aa  647    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101807 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1450  outer membrane receptor FepA  54.46 
 
 		 740 aa  725    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0667  outer membrane receptor FepA  48.24 
 
 		 746 aa  644    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3964  outer membrane receptor FepA  51.04 
 
 		 746 aa  716    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364367  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4579  outer membrane receptor FepA  54.89 
 
 		 742 aa  760    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1116  outer membrane receptor FepA  47.51 
 
 		 750 aa  606  9.999999999999999e-173  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1485  outer membrane receptor FepA  38.57 
 
 		 777 aa  473  1e-132  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0839984  normal  0.152216 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3738  TonB-dependent receptor  31.32 
 
 		 665 aa  295  3e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.430842  normal  0.0543439 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3535  TonB-dependent receptor  30.17 
 
 		 681 aa  290  8e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.243459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  33.19 
 
 		 650 aa  280  5e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  33.19 
 
 		 650 aa  280  7e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  33.19 
 
 		 650 aa  280  8e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  31.51 
 
 		 659 aa  280  9e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  33.19 
 
 		 650 aa  279  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  31.66 
 
 		 663 aa  278  2e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  31.66 
 
 		 663 aa  278  2e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  31.66 
 
 		 641 aa  278  2e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  31.66 
 
 		 663 aa  278  2e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  31.66 
 
 		 663 aa  278  2e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  31.66 
 
 		 663 aa  278  2e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  31.39 
 
 		 663 aa  278  3e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  32.91 
 
 		 650 aa  277  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  30 
 
 		 656 aa  270  5e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  30.07 
 
 		 653 aa  254  6e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  30.88 
 
 		 635 aa  248  4e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0460  TonB-dependent receptor  29.12 
 
 		 648 aa  242  2e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0934  putative outer membrane receptor  29.36 
 
 		 655 aa  238  4e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2678  enterobactin receptor protein  29.65 
 
 		 653 aa  236  1.0000000000000001e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0558  TonB-dependent receptor  28.29 
 
 		 657 aa  233  1e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1513  TonB-dependent receptor  28.04 
 
 		 649 aa  228  3e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000309269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2412  TonB-dependent receptor  29.64 
 
 		 662 aa  227  5.0000000000000005e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.115111  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1806  TonB-dependent receptor  28.15 
 
 		 649 aa  227  7e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2423  TonB-dependent receptor  29.49 
 
 		 662 aa  225  2e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.075703  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0028  enterobactin receptor protein  28.14 
 
 		 652 aa  225  2e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000507235  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2171  TonB-dependent receptor  28.11 
 
 		 649 aa  225  2e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1861  TonB-dependent receptor  27.99 
 
 		 653 aa  225  3e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0473101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1935  TonB-dependent receptor  29.19 
 
 		 662 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00717608  normal  0.914131 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2531  TonB-dependent receptor  29.34 
 
 		 680 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.276329 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0784  TonB-dependent siderophore receptor, putative  28.4 
 
 		 656 aa  221  5e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1826  TonB-dependent receptor  28.87 
 
 		 661 aa  220  7.999999999999999e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0922924  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1930  TonB-dependent receptor  28.86 
 
 		 702 aa  220  8.999999999999998e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3220  putative outer membrane receptor  28.1 
 
 		 665 aa  217  8e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190191 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3929  enterobactin receptor protein  29 
 
 		 663 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.881798 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3795  TonB-dependent receptor  28.53 
 
 		 740 aa  215  1.9999999999999998e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.837422  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4523  enterobactin receptor protein  28.81 
 
 		 663 aa  213  1e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3503  enterobactin receptor protein  29.09 
 
 		 666 aa  213  1e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00217636  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3962  TonB-dependent receptor  28.14 
 
 		 698 aa  213  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4120  enterobactin receptor protein  29.08 
 
 		 666 aa  213  1e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000897059  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4241  enterobactin receptor protein  28.93 
 
 		 666 aa  213  1e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112255  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0219  enterobactin receptor protein  28.93 
 
 		 666 aa  213  1e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0246836  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0217  enterobactin receptor protein  28.65 
 
 		 666 aa  211  3e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000171736  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3128  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  30.32 
 
 		 695 aa  211  6e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002470  TonB-dependent receptor  29.56 
 
 		 652 aa  206  9e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.337593  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2748  putative outer membrane receptor  26.75 
 
 		 665 aa  205  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01404  hypothetical protein  27.93 
 
 		 640 aa  206  2e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1541  putative outer membrane receptor  26.75 
 
 		 665 aa  204  4e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2666  putative outer membrane receptor  26.75 
 
 		 665 aa  204  4e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2686  TonB-dependent receptor plug  29.32 
 
 		 650 aa  204  5e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.262602  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4281  hypothetical protein  28.08 
 
 		 700 aa  201  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3815  TonB-dependent receptor  27.9 
 
 		 658 aa  201  3.9999999999999996e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0899  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  29.48 
 
 		 696 aa  197  7e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1357  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  29.48 
 
 		 696 aa  196  9e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0456407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2046  TonB-dependent receptor  27.96 
 
 		 713 aa  196  1e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183904 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3276  TonB-dependent receptor  27.07 
 
 		 698 aa  192  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0938  TonB-dependent receptor  27.07 
 
 		 698 aa  192  1e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00410623  normal  0.440689 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3409  TonB-dependent receptor  27.07 
 
 		 698 aa  192  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.19526  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1691  TonB-dependent receptor, plug  26.37 
 
 		 732 aa  192  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.524758  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1628  TonB-dependent receptor, plug  28.3 
 
 		 680 aa  191  2.9999999999999997e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0806  TonB-dependent receptor  27.31 
 
 		 743 aa  188  3e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1659  TonB-dependent receptor  28.86 
 
 		 714 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000365717  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>