123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1859 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010322  PputGB1_1859  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  100 
 
 
256 aa  527  1e-149  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.584887  normal  0.1667 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2236  prolyl oligopeptidase family protein  94.53 
 
 
270 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.99651  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3504  hypothetical protein  94.53 
 
 
256 aa  502  1e-141  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.705316  normal  0.144736 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3437  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  91.02 
 
 
256 aa  484  1e-136  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.431978 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2291  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  66.4 
 
 
256 aa  360  9e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.155063  hitchhiker  0.0000115938 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3136  hypothetical protein  65.48 
 
 
258 aa  344  8.999999999999999e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0718166  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36540  hypothetical protein  65.08 
 
 
258 aa  340  2e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0232099  normal  0.968112 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00330  hypothetical protein  64.9 
 
 
248 aa  339  2.9999999999999998e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5039  hypothetical protein  62.6 
 
 
252 aa  328  7e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00504479 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5068  hypothetical protein  55.51 
 
 
276 aa  286  2e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0775486  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0074  hypothetical protein  56.61 
 
 
244 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4571  PGAP1 family protein  55.88 
 
 
260 aa  285  5e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.644055  normal  0.28491 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2224  hypothetical protein  54.13 
 
 
267 aa  285  5.999999999999999e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2005  hypothetical protein  56.12 
 
 
259 aa  280  1e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.878418  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5051  PGAP1 family protein  55.1 
 
 
259 aa  278  8e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3196  PGAP1 family protein  55.1 
 
 
259 aa  278  8e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6153  hypothetical protein  53.25 
 
 
271 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.670149  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4297  prolyl oligopeptidase family protein  54.89 
 
 
242 aa  267  1e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  25.81 
 
 
259 aa  73.6  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1578  dienelactone hydrolase  23.69 
 
 
255 aa  64.3  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0212  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  22.58 
 
 
257 aa  63.5  0.000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0986  hypothetical protein  25.77 
 
 
218 aa  56.6  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.749741 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0358  cinnamoyl ester hydrolase  24.07 
 
 
281 aa  56.2  0.0000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0918  hypothetical protein  28.86 
 
 
271 aa  53.5  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2979  hypothetical protein  32.17 
 
 
300 aa  53.5  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2237  hypothetical protein  23.57 
 
 
269 aa  52.8  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166589  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0322  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  20.94 
 
 
274 aa  52  0.000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000337661  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3195  hypothetical protein  29.08 
 
 
451 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6185  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  27.18 
 
 
733 aa  51.6  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2536  dienelactone hydrolase family protein  30.48 
 
 
270 aa  50.8  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0425  dienelactone hydrolase  28.68 
 
 
268 aa  51.2  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.18094  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1399  dienelactone hydrolase  28.79 
 
 
250 aa  50.4  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1340  hypothetical protein  19.28 
 
 
259 aa  50.1  0.00004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2964  alpha/beta hydrolase fold  29.75 
 
 
295 aa  49.3  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3008  alpha/beta hydrolase fold  29.75 
 
 
295 aa  49.3  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.417001 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5227  hypothetical protein  29.69 
 
 
315 aa  48.9  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.335555 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2739  hypothetical protein  27.45 
 
 
238 aa  48.5  0.00009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2612  hypothetical protein  27.45 
 
 
238 aa  48.1  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3465  peptidase S15  29.2 
 
 
317 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2582  peptidase S15  22.46 
 
 
258 aa  48.5  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0798  hydrolase, putative  23.53 
 
 
246 aa  47.8  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4246  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like  22.8 
 
 
316 aa  47.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.760723  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1279  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  25.47 
 
 
261 aa  47.4  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000359236  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2350  dienelactone hydrolase  28.1 
 
 
259 aa  47.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.722074  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33270  Dienelactone hydrolase protein  28.43 
 
 
261 aa  47.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.669671  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1649  alpha/beta fold family hydrolase  30.16 
 
 
318 aa  47  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605923  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0169  hypothetical protein  38.81 
 
 
265 aa  47  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1306  hypothetical protein  25.13 
 
 
280 aa  47  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4797  hypothetical protein  24.64 
 
 
297 aa  46.6  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.252351  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3990  dipeptidyl peptidase IV  31.01 
 
 
763 aa  46.6  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3611  dienelactone hydrolase  27.69 
 
 
267 aa  46.6  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000690208  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1150  dienelactone hydrolase  21.88 
 
 
254 aa  46.6  0.0004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4518  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30 
 
 
652 aa  46.6  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.164406 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2759  Alpha/beta hydrolase fold-3  28.28 
 
 
336 aa  46.2  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0440  ABC transporter related protein  30.21 
 
 
868 aa  46.2  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.620247 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2537  alpha/beta hydrolase fold  24.07 
 
 
273 aa  45.8  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0582  E3 binding domain protein  28.07 
 
 
467 aa  45.8  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0347  dienelactone hydrolase  26.83 
 
 
262 aa  45.8  0.0008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.971139  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3511  prolyl oligopeptidase family protein  27.54 
 
 
638 aa  45.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2322  ABC transporter-like protein  27.69 
 
 
876 aa  45.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.255775 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2092  hypothetical protein  23.12 
 
 
275 aa  45.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6528  ABC transporter related  29.57 
 
 
897 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0392546  normal  0.0789085 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6851  ABC-type multidrug transport system ATPase component-like protein  28.57 
 
 
866 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1753  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase  27.27 
 
 
453 aa  44.7  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.45323  normal  0.582336 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1241  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  20.42 
 
 
721 aa  45.1  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.349009  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0754  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  24.73 
 
 
724 aa  43.9  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.125402  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1319  hypothetical protein  25.71 
 
 
316 aa  44.3  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.668778  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1754  alpha/beta hydrolase fold  31.37 
 
 
313 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1592  peptidase S15  28.24 
 
 
580 aa  43.9  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00000232254  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1801  alpha/beta hydrolase fold  31.37 
 
 
313 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.920716  normal  0.37834 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1735  alpha/beta hydrolase fold  31.37 
 
 
313 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.319321  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0677  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  30.23 
 
 
760 aa  43.9  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00440025  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1616  dienelactone hydrolase  22.58 
 
 
263 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.555158 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3027  ABC transporter related  28.81 
 
 
1010 aa  44.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0527794  hitchhiker  0.00388212 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4568  alpha/beta hydrolase fold protein  28.71 
 
 
311 aa  44.3  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.364074 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39340  AB-hydrolase-lipoprotein  28.49 
 
 
295 aa  44.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0963  alpha/beta hydrolase fold protein  28.06 
 
 
374 aa  44.3  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0623938  hitchhiker  0.00346396 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0787  dienelactone hydrolase family protein  28.91 
 
 
356 aa  43.5  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.307266  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4242  dienelactone hydrolase  28.43 
 
 
263 aa  43.5  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.194983  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0790  dienelactone hydrolase  28.03 
 
 
269 aa  43.9  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0208  alpha/beta hydrolase  27.6 
 
 
248 aa  43.9  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1826  hypothetical protein  28.27 
 
 
282 aa  43.9  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.542435  hitchhiker  0.00448531 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1419  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  22.98 
 
 
723 aa  43.9  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.383937  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  28.07 
 
 
276 aa  43.9  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0448  peptidase  28 
 
 
678 aa  43.5  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.547634 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3567  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.11 
 
 
695 aa  43.9  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.304997  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0163  dienelactone hydrolase  26.92 
 
 
318 aa  43.1  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2303  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  28.19 
 
 
615 aa  43.1  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49330  hypothetical protein  29.51 
 
 
262 aa  43.5  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.295044  normal  0.0937035 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1557  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  26.32 
 
 
557 aa  43.5  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.198824  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5026  hypothetical protein  31.03 
 
 
326 aa  43.1  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4116  hypothetical protein  30.95 
 
 
363 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.173783  normal  0.516746 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0650  dipeptidyl-peptidase IV  30.23 
 
 
763 aa  43.1  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00104928  normal  0.120893 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3711  dienelactone hydrolase  34.74 
 
 
262 aa  42.7  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00138504 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0457  Lysophospholipase-like protein  25.68 
 
 
274 aa  42.7  0.006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1243  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.53 
 
 
572 aa  42.4  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3085  peptidase S15  31.96 
 
 
287 aa  42.7  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.918573  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0649  dipeptidyl-peptidase IV  29.46 
 
 
763 aa  42.7  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000821828  hitchhiker  0.00018889 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2886  hypothetical protein  27.03 
 
 
301 aa  42.7  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4214  hypothetical protein  27.07 
 
 
262 aa  42.7  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>