204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1854 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010322  PputGB1_1854  hypothetical protein  100 
 
 
316 aa  615  1e-175  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.135486 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2231  hypothetical protein  94.94 
 
 
358 aa  583  1e-166  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3509  hypothetical protein  94.3 
 
 
316 aa  580  1e-164  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0160994 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3442  hypothetical protein  86.39 
 
 
314 aa  520  1e-146  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.996427  normal  0.320096 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3470  hypothetical protein  78.2 
 
 
312 aa  442  1e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.461647  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3251  hypothetical protein  74.84 
 
 
311 aa  443  1e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0184302  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3309  hypothetical protein  72.99 
 
 
316 aa  409  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249061  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1817  hypothetical protein  64.59 
 
 
305 aa  379  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0149863  hitchhiker  0.000661803 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1518  hypothetical protein  63.07 
 
 
307 aa  363  2e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.372898 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3187  hypothetical protein  61.21 
 
 
300 aa  334  1e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.589109 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0643  protein of unknown function DUF6 transmembrane  57.39 
 
 
297 aa  293  3e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.598507  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1325  integral membrane protein  58.99 
 
 
308 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0145  hypothetical protein  43.14 
 
 
299 aa  209  5e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1134  hypothetical protein  32.67 
 
 
319 aa  135  9.999999999999999e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.159672  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0726  hypothetical protein  33.22 
 
 
298 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00203734  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1658  transporter, EamA family  31.8 
 
 
303 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1478  drug/metabolite exporter family protein  32.45 
 
 
303 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.187087  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1125  hypothetical protein  32.63 
 
 
294 aa  128  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1320  hypothetical protein  31.13 
 
 
301 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00383072  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1506  EamA family protein  31.79 
 
 
303 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116622  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1468  drug/metabolite exporter family protein  31.79 
 
 
303 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.855355  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1622  eama family protein  31.79 
 
 
303 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1690  transporter, EamA family  31.79 
 
 
303 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1713  EamA family protein  32.89 
 
 
303 aa  127  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.461189  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1763  transporter, EamA family  31.79 
 
 
303 aa  126  5e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1510  hypothetical protein  31.46 
 
 
301 aa  125  7e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2142  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.88 
 
 
308 aa  125  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3687  transporter, EamA family  30.13 
 
 
301 aa  123  4e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2039  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.69 
 
 
301 aa  122  9e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000102698  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1939  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.15 
 
 
343 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0893718  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1260  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.62 
 
 
312 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000194009  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3544  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.04 
 
 
293 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.340303  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1122  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.63 
 
 
313 aa  117  3.9999999999999997e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2297  hypothetical protein  32.28 
 
 
286 aa  116  5e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0201  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.14 
 
 
283 aa  115  7.999999999999999e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000909393  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05950  permease of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  31.47 
 
 
293 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0313  hypothetical protein  34.42 
 
 
317 aa  114  2.0000000000000002e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00423345 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6006  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.57 
 
 
315 aa  113  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.509599  normal  0.86931 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3447  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.48 
 
 
308 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000182923 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1436  DMT family permease  31.62 
 
 
301 aa  110  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.529495 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1018  hypothetical protein  28.48 
 
 
288 aa  109  5e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.735408  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1656  permeases of the drug/metabolite transporter  26.37 
 
 
307 aa  109  6e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1112  hypothetical protein  28.04 
 
 
288 aa  109  7.000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1712  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.28 
 
 
290 aa  107  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3407  hypothetical protein  31.91 
 
 
292 aa  107  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.263015  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1560  hypothetical protein  33.21 
 
 
304 aa  107  4e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.590181  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1424  transporter, drug/metabolite exporter family  30.82 
 
 
305 aa  106  5e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3023  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.59 
 
 
312 aa  105  8e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.66818  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0163  hypothetical protein  26.06 
 
 
288 aa  105  9e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.532161  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0814  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.9 
 
 
308 aa  104  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1605  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.86 
 
 
296 aa  103  5e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.97109  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2288  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.48 
 
 
302 aa  101  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000440436 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0457  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.89 
 
 
313 aa  100  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0960  drug/metabolite transporter family permease  31.85 
 
 
296 aa  98.2  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000594198  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4151  hypothetical protein  29.77 
 
 
299 aa  98.6  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0322  putative permease of the drug/metabolite transporter  30.17 
 
 
311 aa  98.2  2e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.806921  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0128  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.95 
 
 
301 aa  97.8  2e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2977  hypothetical protein  31.91 
 
 
309 aa  96.3  6e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1481  hypothetical protein  27.87 
 
 
294 aa  95.1  1e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000470662  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1480  permeases of the drug/metabolite transporter  27.81 
 
 
306 aa  94.7  2e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000101724  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0835  hypothetical protein  25.76 
 
 
295 aa  94  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1311  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.84 
 
 
302 aa  94  3e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0220544 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0417  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.32 
 
 
292 aa  93.6  4e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0401  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.36 
 
 
300 aa  93.6  4e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.217733  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24860  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  33.51 
 
 
290 aa  92.8  8e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1883  hypothetical protein  27.31 
 
 
310 aa  92  1e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00906285  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0024  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.27 
 
 
297 aa  92  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48145  predicted protein  28.53 
 
 
462 aa  91.7  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.196185  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0720  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.66 
 
 
289 aa  91.7  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000349572  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0349  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.95 
 
 
294 aa  90.9  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.19753  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1308  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.53 
 
 
308 aa  90.5  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.461902  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0545  hypothetical protein  31.58 
 
 
308 aa  89  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2929  DMT family permease  28.43 
 
 
298 aa  88.6  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0171282  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0138  hypothetical protein  33.67 
 
 
292 aa  88.6  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5197  hypothetical protein  28.76 
 
 
288 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5662  hypothetical protein  28.76 
 
 
288 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.318352 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1123  hypothetical protein  26.15 
 
 
277 aa  88.2  2e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2881  hypothetical protein  28.7 
 
 
336 aa  87.4  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0923868  hitchhiker  0.00000000000229015 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1536  hypothetical protein  29.5 
 
 
297 aa  87  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1322  hypothetical protein  29.15 
 
 
293 aa  86.7  5e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.908663 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17660  hypothetical protein  27.92 
 
 
308 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0350  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.09 
 
 
290 aa  86.3  7e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0094  membrane protein  26.79 
 
 
322 aa  86.3  7e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3212  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  29.47 
 
 
289 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0266  hypothetical protein  30.59 
 
 
310 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000402657 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2332  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.93 
 
 
291 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.364061  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1796  permeases of the drug/metabolite transporter  26.15 
 
 
292 aa  84.7  0.000000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.463066  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0994  hypothetical protein  29.43 
 
 
296 aa  84.3  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.912564  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0944  hypothetical protein  26.99 
 
 
279 aa  84.3  0.000000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0056  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.08 
 
 
304 aa  83.2  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0068  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.58 
 
 
304 aa  83.2  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1728  permeases of the drug/metabolite transporter  25.34 
 
 
302 aa  82.8  0.000000000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0053  hypothetical protein  32.98 
 
 
300 aa  82.4  0.000000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.261978 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2742  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.55 
 
 
296 aa  82  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.651085  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1929  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.28 
 
 
252 aa  82  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00124524  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3690  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.74 
 
 
296 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0058387  hitchhiker  0.0000000000902258 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4403  hypothetical protein  30.54 
 
 
305 aa  82  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0375849  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3091  hypothetical protein  28.21 
 
 
294 aa  81.3  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0986  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  23.99 
 
 
295 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0052  hypothetical protein  30.54 
 
 
304 aa  80.5  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>