More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1771 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_1771  major facilitator transporter  100 
 
 		 412 aa  822    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.156898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3798  major facilitator transporter  71.28 
 
 		 412 aa  583  1.0000000000000001e-165  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000146089 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7578  major facilitator transporter  64.11 
 
 		 415 aa  518  1e-146  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6043  major facilitator transporter  62.47 
 
 		 415 aa  508  1e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.100748 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1524  major facilitator transporter  65.4 
 
 		 491 aa  499  1e-140  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.400505  normal  0.0396773 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0282  major facilitator transporter  65.85 
 
 		 410 aa  497  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00202623 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2870  major facilitator transporter  66.5 
 
 		 410 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000255107 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5683  major facilitator transporter  64.45 
 
 		 415 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.660955  normal  0.0309673 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5906  major facilitator transporter  64.45 
 
 		 415 aa  491  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.544672  hitchhiker  0.0068458 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6588  major facilitator transporter  63.37 
 
 		 415 aa  476  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0439245 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5742  major facilitator transporter  63.37 
 
 		 415 aa  477  1e-133  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6106  major facilitator transporter  63.37 
 
 		 415 aa  477  1e-133  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3675  major facilitator superfamily MFS_1  65.6 
 
 		 410 aa  473  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0256962  hitchhiker  0.000000000790745 
 
 
-
 
NC_003296  RS01910  transport transmembrane protein  63.59 
 
 		 418 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0394187 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3013  major facilitator transporter  62.24 
 
 		 408 aa  432  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0393248 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0265  major facilitator superfamily permease  42.93 
 
 		 418 aa  341  1e-92  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0214342  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5576  major facilitator family transporter  36.58 
 
 		 432 aa  306  3e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5624  major facilitator family transporter  36.26 
 
 		 433 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5139  major facilitator transporter  35.88 
 
 		 432 aa  302  7.000000000000001e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5568  transporter, MFS superfamily  36.19 
 
 		 432 aa  302  9e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5236  major facilitator transporter  36.26 
 
 		 433 aa  301  1e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5538  major facilitator family transporter  36.49 
 
 		 433 aa  301  2e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5297  major facilitator family transporter  36.11 
 
 		 432 aa  301  2e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5124  major facilitator transporter  36.8 
 
 		 432 aa  300  2e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5693  major facilitator family transporter  36.49 
 
 		 433 aa  301  2e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3960  major facilitator transporter  36.41 
 
 		 425 aa  298  2e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5381  transporter, MFS superfamily  36.19 
 
 		 432 aa  279  8e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.269188  normal  0.117501 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2058  major facilitator family protein  35.91 
 
 		 415 aa  251  1e-65  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0107331  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5124  major facilitator transporter  36.86 
 
 		 432 aa  243  7e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0473861 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1920  major facilitator superfamily permease  34.27 
 
 		 423 aa  240  4e-62  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000507154  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3460  major facilitator transporter  34.88 
 
 		 434 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.42938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5283  major facilitator transporter  34.88 
 
 		 434 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0529847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3968  major facilitator transporter  35.94 
 
 		 432 aa  233  6e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0624321 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2363  major facilitator transporter  34.64 
 
 		 435 aa  231  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3551  major facilitator transporter  35.94 
 
 		 432 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.629931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2575  major facilitator transporter  35.85 
 
 		 432 aa  229  6e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.491999 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4578  major facilitator family transporter  34.07 
 
 		 428 aa  224  3e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1311  major facilitator transporter  34.07 
 
 		 428 aa  224  3e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00188583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1404  general substrate transporter  33.58 
 
 		 428 aa  219  7e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4099  major facilitator transporter  33.66 
 
 		 428 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.594069  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3291  major facilitator superfamily MFS_1  32.09 
 
 		 430 aa  216  5.9999999999999996e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3878  major facilitator transporter  35.52 
 
 		 428 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.957409 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3197  MFS family transporter  34.48 
 
 		 423 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37250  major facilitator transporter  34.48 
 
 		 423 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0386  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 420 aa  213  7e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3505  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 420 aa  212  9e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1269  major facilitator superfamily MFS_1  34.47 
 
 		 428 aa  212  1e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2700  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 420 aa  212  1e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0407  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 420 aa  212  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0462175  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4743  major facilitator transporter  33.42 
 
 		 411 aa  210  4e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.524316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0310  major facilitator transporter  32.86 
 
 		 420 aa  210  4e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3351  major facilitator transporter  32.85 
 
 		 423 aa  207  2e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.233758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0496  major facilitator transporter  34.84 
 
 		 441 aa  206  6e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2152  major facilitator transporter  32.85 
 
 		 409 aa  203  3e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.291  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5734  major facilitator superfamily MFS_1  35.36 
 
 		 423 aa  203  5e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3134  major facilitator transporter  33.82 
 
 		 428 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.352378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2122  major facilitator transporter  32.6 
 
 		 409 aa  202  9.999999999999999e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3514  major facilitator superfamily transporter  31.81 
 
 		 429 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.522107  normal  0.962202 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2448  major facilitator transporter  31.23 
 
 		 429 aa  199  9e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7149  major facilitator superfamily MFS_1  33.5 
 
 		 434 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.321926 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1962  major facilitator transporter  32.02 
 
 		 427 aa  196  6e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0235717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3588  major facilitator superfamily MFS_1  32.37 
 
 		 419 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0470623  hitchhiker  0.00000294686 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2798  general substrate transporter  33.25 
 
 		 429 aa  193  6e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.564516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0370  major facilitator transporter  32.3 
 
 		 419 aa  193  6e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4022  major facilitator transporter  33.82 
 
 		 424 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3769  major facilitator transporter  32.94 
 
 		 433 aa  190  4e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308958  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5191  major facilitator transporter  33.17 
 
 		 430 aa  189  5e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.297572  normal  0.097808 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4975  major facilitator transporter  34.57 
 
 		 429 aa  190  5e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1295  major facilitator transporter  33.58 
 
 		 424 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0174718  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1698  major facilitator family transporter  33.33 
 
 		 424 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.88641  normal  0.154444 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2408  major facilitator transporter  32.09 
 
 		 436 aa  188  1e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1281  major facilitator superfamily MFS_1  32.33 
 
 		 436 aa  188  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.901209  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1072  major facilitator transporter  31.43 
 
 		 434 aa  186  9e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5519  major facilitator transporter  32.41 
 
 		 425 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.524338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5752  major facilitator transporter  32.57 
 
 		 425 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.968797 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1504  major facilitator transporter  33.7 
 
 		 428 aa  184  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0043837  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1694  major facilitator transporter  30.3 
 
 		 409 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1030  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 437 aa  182  9.000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0545376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1625  major facilitator family transporter  30.05 
 
 		 445 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1786  major facilitator family transporter  30.05 
 
 		 428 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2684  major facilitator family transporter  29.22 
 
 		 429 aa  181  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1604  major facilitator family transporter  30.05 
 
 		 445 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.797909  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1095  major facilitator family transporter  32.5 
 
 		 435 aa  180  4e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.140636  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4812  major facilitator superfamily MFS_1  31.46 
 
 		 433 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.405857  hitchhiker  0.00118748 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0774  major facilitator transporter  31.77 
 
 		 421 aa  178  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1616  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 432 aa  178  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00456978  normal  0.253258 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1801  major facilitator family transporter  31.65 
 
 		 474 aa  178  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.193044  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3932  major facilitator superfamily MFS_1  30.05 
 
 		 415 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.643989 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4045  major facilitator superfamily MFS_1  30.05 
 
 		 415 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0350  major facilitator family transporter  31.65 
 
 		 474 aa  176  5e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05189  metabolite transporter  29.98 
 
 		 416 aa  176  9e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.448327  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0948  major facilitator family transporter  31.41 
 
 		 457 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1886  major facilitator family transporter  31.41 
 
 		 474 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0213  major facilitator family transporter  31.41 
 
 		 457 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1391  major facilitator family transporter  31.41 
 
 		 474 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0432  major facilitator family transporter  31.41 
 
 		 474 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2632  major facilitator transporter  32.21 
 
 		 402 aa  171  3e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127081  normal  0.954997 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4147  major facilitator transporter  31.68 
 
 		 423 aa  166  5e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.517871 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1388  major facilitator family transporter  30.15 
 
 		 398 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0487  major facilitator family transporter  30.15 
 
 		 398 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>