More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1762 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_1762  acyltransferase 3  100 
 
 		 662 aa  1358    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.127648 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4447  acyltransferase 3  32.29 
 
 		 695 aa  298  2e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0974085  normal  0.0718898 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0846  hypothetical protein  31.21 
 
 		 660 aa  286  1.0000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0821  hypothetical protein  30.95 
 
 		 660 aa  281  3e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1946  acyltransferase 3  32.92 
 
 		 632 aa  279  1e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.63132 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1349  acyltransferase 3  31.76 
 
 		 629 aa  272  1e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0292256 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0870  acyltransferase 3  31.25 
 
 		 695 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1117  acyltransferase 3  30.96 
 
 		 645 aa  269  1e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1981  acyltransferase 3  30.33 
 
 		 671 aa  269  1e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.158164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1084  acyltransferase 3  31.47 
 
 		 635 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.87667  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4448  acyltransferase 3  31.4 
 
 		 679 aa  267  5.999999999999999e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00871902  normal  0.076246 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1265  putative membrane-located cell surface saccharide acetylase  33.18 
 
 		 660 aa  264  4.999999999999999e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2692  acyltransferase domain-containing protein  31.07 
 
 		 647 aa  262  1e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5014  acyltransferase 3  31.85 
 
 		 695 aa  261  3e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.21213 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2505  acyltransferase 3  31.21 
 
 		 665 aa  261  4e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.354964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2751  acyltransferase family protein  30.7 
 
 		 640 aa  259  8e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0222973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1947  acyltransferase 3  30.91 
 
 		 642 aa  258  2e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1772  acyltransferase 3  31.37 
 
 		 683 aa  259  2e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.415848  normal  0.0191672 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1872  acyltransferase 3  31.25 
 
 		 629 aa  257  5e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.642585 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2523  hypothetical protein  29.36 
 
 		 657 aa  256  8e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2653  hypothetical protein  29.21 
 
 		 657 aa  255  2.0000000000000002e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5645  putative acyltransferase, group 3  31.45 
 
 		 634 aa  254  4.0000000000000004e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1909  acyltransferase 3  31.63 
 
 		 675 aa  253  1e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1561  acyltransferase 3  31.85 
 
 		 643 aa  251  3e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000263  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  31.64 
 
 		 616 aa  251  4e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3871  acyltransferase 3  30.83 
 
 		 690 aa  250  5e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.127096 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1138  acyltransferase 3  30.45 
 
 		 629 aa  249  1e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.725287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4615  acyltransferase 3  33.02 
 
 		 630 aa  248  2e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0173701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2428  acyltransferase 3  31.29 
 
 		 637 aa  248  3e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000222239  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5009  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  30.36 
 
 		 656 aa  247  4.9999999999999997e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131159  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2714  hypothetical protein  27.8 
 
 		 658 aa  246  6.999999999999999e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0265  acyltransferase 3  32.54 
 
 		 645 aa  246  8e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.796474  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2845  hypothetical protein  28.02 
 
 		 658 aa  245  1.9999999999999999e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5455  acyltransferase 3  31.92 
 
 		 665 aa  243  7e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1233  acyltransferase 3  29.7 
 
 		 656 aa  242  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00523739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3556  putative O-antigen acetylase  31.78 
 
 		 658 aa  241  2.9999999999999997e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000981917  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5132  putative acyltransferase  31.04 
 
 		 638 aa  238  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0874375 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02452  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  28.77 
 
 		 639 aa  237  4e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.102125  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5981  putative O-antigen acetylase  31.72 
 
 		 662 aa  237  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0770  acyltransferase 3  32.23 
 
 		 684 aa  237  5.0000000000000005e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011315  VSAL_p54_03  acyltransferase  28.34 
 
 		 642 aa  236  9e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.362945  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0040  acyltransferase 3  31.87 
 
 		 635 aa  236  1.0000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.578182  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4228  acyltransferase 3  35.28 
 
 		 651 aa  236  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0660245  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0862  acyltransferase 3  31.03 
 
 		 673 aa  234  3e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5130  putative acyltransferase 3  32.6 
 
 		 647 aa  234  4.0000000000000004e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.13544  normal  0.266288 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69170  putative O-antigen acetylase  31.03 
 
 		 662 aa  233  6e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1701  hypothetical protein  29.33 
 
 		 690 aa  233  7.000000000000001e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.205815  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0997  acyltransferase family protein  35.34 
 
 		 667 aa  232  2e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.378364  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0464  acyltransferase 3  30.13 
 
 		 660 aa  229  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.804151  normal  0.342656 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05637  acyltransferase  31.88 
 
 		 615 aa  228  2e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5647  putative acyltransferase, group 3  31.49 
 
 		 654 aa  224  3e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0638  acyltransferase family protein  29.1 
 
 		 647 aa  220  7.999999999999999e-56  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.482151 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0963  acyltransferase family protein  31.17 
 
 		 759 aa  219  1e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.284523  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4561  acyltransferase 3  29.28 
 
 		 626 aa  218  2e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.064478  normal  0.244827 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5281  hypothetical protein  30.48 
 
 		 644 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.458254  normal  0.151011 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0302  acyltransferase 3  33.81 
 
 		 660 aa  218  4e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.183552 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0337  acyltransferase 3  29.06 
 
 		 690 aa  216  9.999999999999999e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08830  predicted acyltransferase  28.82 
 
 		 711 aa  215  1.9999999999999998e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.63777 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2606  acyltransferase 3  37.92 
 
 		 603 aa  213  9e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00250155  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6545  acyltransferase 3  31.15 
 
 		 675 aa  213  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000351967 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0485  acyltransferase 3  27.09 
 
 		 777 aa  212  2e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.712131  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0435  acyltransferase 3  30.61 
 
 		 679 aa  211  3e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.81712 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5547  acyltransferase family protein  34.22 
 
 		 628 aa  211  4e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1096  acyltransferase 3  29.72 
 
 		 614 aa  208  3e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27650  predicted acyltransferase  30.2 
 
 		 682 aa  206  9e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5087  acyltransferase 3  28.28 
 
 		 627 aa  206  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26820  predicted acyltransferase  27.34 
 
 		 720 aa  204  4e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2824  acyltransferase 3  38.54 
 
 		 598 aa  204  5e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0525  acyltransferase 3  37.21 
 
 		 583 aa  202  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0373578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0443  acyltransferase 3  26.91 
 
 		 625 aa  202  1.9999999999999998e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0119902 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26510  predicted acyltransferase  28.07 
 
 		 681 aa  200  6e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2396  acyltransferase 3  28.53 
 
 		 716 aa  200  6e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0132066 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0544  acyltransferase 3  28.36 
 
 		 675 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1858  acyltransferase family protein  29.86 
 
 		 636 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.772864  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5131  putative acyltransferase  28.59 
 
 		 632 aa  196  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0498038  normal  0.0856851 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2758  O-antigen acetylase  28.72 
 
 		 691 aa  193  1e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3904  putative acyltransferase  29.21 
 
 		 678 aa  192  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0121  acyltransferase 3  38.87 
 
 		 726 aa  192  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.695544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0131  acyltransferase 3  38.87 
 
 		 726 aa  192  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.971187  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0140  acyltransferase 3  38.87 
 
 		 726 aa  192  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.939637 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0069  acyltransferase 3  27.38 
 
 		 652 aa  191  5e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000569017 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1241  hypothetical protein  25.45 
 
 		 675 aa  187  4e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0685  acyltransferase 3  27.65 
 
 		 658 aa  187  5e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2132  O-antigen acetylase, putative  28.47 
 
 		 760 aa  184  3e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0938  acyltransferase 3  37.25 
 
 		 710 aa  184  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0213168  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0955  acyltransferase 3  37.25 
 
 		 710 aa  184  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.41733  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1409  acyltransferase 3  25.47 
 
 		 695 aa  184  6e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000344331  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1310  acyltransferase 3  40.99 
 
 		 621 aa  182  2e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.502976  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0472  putative acyltransferase  28.55 
 
 		 702 aa  182  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00401  acyltransferase  27.22 
 
 		 696 aa  182  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.8971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1805  O-antigen acetylase  28.69 
 
 		 728 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2108  putative O-antigen acetylase  28.69 
 
 		 727 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.665251  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2690  acyltransferase 3  27.31 
 
 		 715 aa  181  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.208976  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0375  putative acyltransferase  28.84 
 
 		 702 aa  181  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.020751  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01286  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  35.1 
 
 		 344 aa  180  8e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.591708  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0761  acyltransferase 3  29.68 
 
 		 690 aa  180  8e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1498  putative O-antigen acetylase  28.55 
 
 		 699 aa  179  2e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.411684  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1922  acyltransferase 3  33.47 
 
 		 685 aa  178  3e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2521  acyltransferase 3  36.72 
 
 		 641 aa  177  4e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.191199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1054  acyltransferase 3  27.21 
 
 		 671 aa  176  9.999999999999999e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>