38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1682 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_1682  cell division inhibitor-related protein, SulA-like protein  100 
 
 		 158 aa  309  9e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292047  normal  0.171923 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3600  SOS-response cell division inhibitor blocks FtsZ ring formation-like protein  94.3 
 
 		 158 aa  289  9e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00249285  normal  0.513615 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2142  cell division inhibitor-related protein  93.67 
 
 		 158 aa  286  6e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0838821 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1658  cell division inhibitor-related protein, SulA-like protein  91.1 
 
 		 158 aa  261  4e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.271985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3873  SOS cell division inhibitor SulA  72.44 
 
 		 157 aa  214  4e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.752414  normal  0.900283 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3511  cell division inhibitor, putative  67.95 
 
 		 156 aa  197  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3284  cell division inhibitor, putative  68.59 
 
 		 156 aa  194  5.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.899997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25150  hypothetical protein  61.88 
 
 		 161 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1586  SOS cell division inhibitor SulA  64.67 
 
 		 156 aa  165  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.584866 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2151  hypothetical protein  59.76 
 
 		 165 aa  159  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.92102  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14500  cell division inhibitor  58.74 
 
 		 156 aa  155  3e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.578155  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2006  SOS-response cell division inhibitor blocks FtsZ ring formation-like  33.33 
 
 		 165 aa  53.5  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.368936  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1095  hypothetical protein  34.34 
 
 		 290 aa  50.4  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0221181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1742  hypothetical protein  34.34 
 
 		 278 aa  49.7  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1544  hypothetical protein  36.56 
 
 		 214 aa  48.9  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0034241 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1869  cell division inhibitor, putative  36.56 
 
 		 214 aa  48.9  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1786  hypothetical protein  31.3 
 
 		 139 aa  48.5  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3863  hypothetical protein  30.53 
 
 		 170 aa  45.1  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0155  hypothetical protein  30.12 
 
 		 170 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4179  hypothetical protein  30.12 
 
 		 170 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4111  hypothetical protein  30.12 
 
 		 170 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4310  hypothetical protein  30.53 
 
 		 170 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0199  hypothetical protein  29.07 
 
 		 170 aa  44.3  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3990  hypothetical protein  29.47 
 
 		 170 aa  44.3  0.0008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3790  hypothetical protein  29.47 
 
 		 170 aa  44.3  0.0008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3781  hypothetical protein  30.12 
 
 		 170 aa  43.5  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2235  hypothetical protein  26.67 
 
 		 136 aa  43.9  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.27179 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0259  hypothetical protein  30.59 
 
 		 168 aa  43.5  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.934238  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1755  SOS cell division inhibitor  29.07 
 
 		 168 aa  42.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000135467  hitchhiker  0.00000396208 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3998  hypothetical protein  29.41 
 
 		 182 aa  42.4  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4604  hypothetical protein  29.47 
 
 		 170 aa  42  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0126  hypothetical protein  31.33 
 
 		 169 aa  42  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3482  hypothetical protein  31.96 
 
 		 168 aa  42.4  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.214908 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2629  SOS cell division inhibitor  29.07 
 
 		 168 aa  41.2  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.00000000000371858  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3200  SOS cell division inhibitor  29.07 
 
 		 168 aa  41.2  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000242239  hitchhiker  0.00343609 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2540  SOS cell division inhibitor  29.07 
 
 		 168 aa  41.2  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  5.19438e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00040  RecA/RadA recombinase  31.65 
 
 		 234 aa  41.2  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.140421  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1210  SOS cell division inhibitor  30.23 
 
 		 164 aa  40.8  0.008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000104842  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>