More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1665 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2124  glycosyl transferase, putative  94.94 
 
 		 415 aa  805    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.20246 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1665  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 415 aa  846    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.534865  normal  0.53265 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1641  glycosyl transferase group 1  89.88 
 
 		 415 aa  766    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.353523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3617  glycosyl transferase, group 1  94.94 
 
 		 415 aa  806    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312002  normal  0.590963 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3535  glycosyl transferase, group 1 family protein PslH  59.6 
 
 		 405 aa  497  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.937729  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3307  glycosyl transferase, group 1  60 
 
 		 405 aa  497  1e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.143388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3003  hypothetical protein  54.73 
 
 		 402 aa  462  1e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157248  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4281  glycosyl transferase, group 1  56.57 
 
 		 405 aa  461  1e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.498177  hitchhiker  0.00385385 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35650  hypothetical protein  54.73 
 
 		 402 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.793748  hitchhiker  0.00000000053006 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0824  glycosyl transferase group 1  28.39 
 
 		 407 aa  154  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4233  glycosyl transferase, group 1  28.54 
 
 		 405 aa  137  4e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.968175  hitchhiker  0.000923088 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1626  glycosyl transferase group 1  28.91 
 
 		 434 aa  135  9e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.879586 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1627  glycosyl transferase group 1  29.33 
 
 		 432 aa  136  9e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.154338  normal  0.324472 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1339  glycosyl transferase, group 1  28.21 
 
 		 436 aa  135  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997916 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1340  glycosyl transferase, group 1  28.5 
 
 		 410 aa  131  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0300  glycosyl transferase group 1  26.29 
 
 		 399 aa  126  7e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0672  glycosyl transferase, group 1  25.62 
 
 		 404 aa  126  7e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.203842  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0300  glycosyl transferase group 1  26.29 
 
 		 399 aa  126  7e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3294  glycosyl transferase group 1  29.14 
 
 		 402 aa  125  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0512  glycosyl transferase group 1  33.19 
 
 		 274 aa  123  7e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0417  glycosyl transferase group 1  30.89 
 
 		 402 aa  122  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3594  glycosyl transferase, group 1  27.8 
 
 		 421 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0454071 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4281  glycosyl transferase group 1  27.68 
 
 		 418 aa  116  8.999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0930783  normal  0.115686 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0462  glycosyl transferase group 1  27.49 
 
 		 408 aa  114  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2482  group 1 glycosyl transferase  25.12 
 
 		 399 aa  111  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0288582  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0636  glycosyl transferase group 1  32.16 
 
 		 389 aa  111  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0521552  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2501  glycosyl transferase group 1  24.67 
 
 		 414 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2362  hypothetical protein  25.74 
 
 		 413 aa  110  5e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0146  glycosyl transferase, group 1  23.51 
 
 		 402 aa  109  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0724066 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4699  glycosyl transferase, group 1  25.06 
 
 		 409 aa  107  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.793347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0930  a-glycosyltransferase  23.23 
 
 		 396 aa  103  5e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0131712 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0823  glycosyl transferase group 1  26.15 
 
 		 411 aa  100  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2468  glycosyl transferase, group 1  24.4 
 
 		 413 aa  98.2  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3183  glycosyl transferase, group 1  23 
 
 		 404 aa  96.7  7e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0145  hypothetical protein  22.73 
 
 		 414 aa  96.3  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0408  glycosyl transferase group 1  25.43 
 
 		 410 aa  95.9  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  27.62 
 
 		 1340 aa  95.9  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2000  glycosyl transferase, group 1  23.3 
 
 		 403 aa  94  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0734  glycosyltransferase-like protein  29.51 
 
 		 442 aa  92.8  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2405  glycosyl transferase, group 1  25.8 
 
 		 406 aa  91.3  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2512  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  24.87 
 
 		 413 aa  90.5  6e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.191861 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0784  hypothetical protein  24.18 
 
 		 408 aa  89  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.246481 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0520  glycosyl transferase group 1  34.13 
 
 		 499 aa  89  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.22361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3274  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  26.7 
 
 		 429 aa  89.4  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.736757  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0157  glycosyltransferase-like protein  25 
 
 		 402 aa  89.4  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0929  a-glycosyltransferase  20.49 
 
 		 397 aa  89  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0122739 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3977  glycosyl transferase, group 1  25.74 
 
 		 412 aa  87.8  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.696397 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0141  glycosyl transferase, group 1  26.94 
 
 		 417 aa  87.8  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.154481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3796  glycosyl transferase, group 1  25.56 
 
 		 387 aa  87.4  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02591  Glycosyl transferase, group 1  26.82 
 
 		 360 aa  87.8  4e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.527866  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3182  glycosyl transferase, group 1  29.69 
 
 		 406 aa  86.3  9e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  26.04 
 
 		 703 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3252  glycosyl transferase group 1  24.29 
 
 		 409 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1515  glycosyl transferase, group 1  27.57 
 
 		 417 aa  85.9  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0777934  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0401  glycosyl transferase, group 1  24.75 
 
 		 397 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0289  glycosyl transferase group 1  24.42 
 
 		 406 aa  85.1  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0405  glycosyl transferase group 1  20.94 
 
 		 400 aa  84.7  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.302496 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3169  glycosyl transferase, group 1  24.71 
 
 		 456 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1921  glycosyl transferase, group 1  27.39 
 
 		 401 aa  82.8  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1800  glycosyltransferase  25.58 
 
 		 402 aa  81.6  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1178  glycosyl transferase, group 1  24.29 
 
 		 376 aa  82  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3661  glycosyl transferase group 1  30.22 
 
 		 388 aa  80.5  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0773  glycosyl transferase, group 1  25.12 
 
 		 396 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.784478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2970  glycosyltransferase-like protein  31.5 
 
 		 394 aa  80.1  0.00000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.360933  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3949  glycosyl transferase, group 1  29.38 
 
 		 371 aa  79.7  0.00000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4231  glycosyl transferase group 1  22.6 
 
 		 417 aa  79.7  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00915385 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4192  glycosyl transferase group 1  22.6 
 
 		 417 aa  79.7  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0296  glycosyltransferase  21.51 
 
 		 394 aa  78.6  0.0000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1964  sugar transferase  31.69 
 
 		 443 aa  78.6  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.23345  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2185  glycosyl transferase group 1  28.16 
 
 		 437 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3119  group 1 glycosyl transferase  32.03 
 
 		 400 aa  78.2  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1898  glycosyl transferase group 1  31.69 
 
 		 443 aa  77.4  0.0000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  26.69 
 
 		 1106 aa  77.4  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3986  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 		 535 aa  77  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.530691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3527  glycosyl transferase group 1  31.79 
 
 		 433 aa  76.6  0.0000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000428003  normal  0.043147 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0762  glycosyl transferase, group 1  28.25 
 
 		 422 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1684  glycosyl transferase, group 1  25.57 
 
 		 416 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2352  hypothetical protein  25.68 
 
 		 420 aa  75.5  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1866  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  25 
 
 		 396 aa  74.3  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3105  glycosyl transferases group 1  24.51 
 
 		 399 aa  73.6  0.000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.147313  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0118  glycosyl transferase family 2  29.7 
 
 		 1156 aa  71.6  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1588  glycosyl transferase group 1  26.04 
 
 		 374 aa  71.6  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.603686  normal  0.0564802 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1979  glycosyl transferase group 1  28.45 
 
 		 429 aa  70.9  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2599  glycosyl transferase group 1  25.52 
 
 		 956 aa  70.1  0.00000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00973  glycosyltransferase  22.16 
 
 		 860 aa  70.1  0.00000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  34.48 
 
 		 700 aa  69.7  0.00000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4038  glycosyl transferase, group 1  24.05 
 
 		 396 aa  69.3  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.277047  normal  0.431033 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2350  glycosyl transferase, group 1  29.39 
 
 		 422 aa  68.9  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.234853  normal  0.935785 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0590  glycosyl transferase, group 1  23.88 
 
 		 399 aa  68.2  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413906 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0509  glycosyl transferase family 2  32.52 
 
 		 1075 aa  68.2  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.253023  normal  0.0268717 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2522  glycosyl transferase, group 1  27.52 
 
 		 401 aa  67.8  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.165629  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0733  hypothetical protein  22.95 
 
 		 409 aa  67  0.0000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0568  glycosyl transferase group 1  27.98 
 
 		 394 aa  66.6  0.0000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1308  glycosyl transferase, group 1  22.56 
 
 		 399 aa  66.6  0.0000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.700718  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0351  glycosyl transferase family protein  24.31 
 
 		 994 aa  66.6  0.0000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.792541  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1481  glycosyltransferase-like protein  23.08 
 
 		 1119 aa  66.2  0.0000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0351  Glycosyltransferase-like protein  29.03 
 
 		 404 aa  65.9  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3731  glycosyl transferase group 1  28.24 
 
 		 394 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.607856  normal  0.812529 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2061  glycosyltransferase  30.63 
 
 		 537 aa  64.3  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2017  glycosyltransferase  28.97 
 
 		 389 aa  63.5  0.000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.641598  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>