33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1650 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010322  PputGB1_1650  peptidase M15A  100 
 
 
143 aa  293  4e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.309643  normal  0.633092 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3631  peptidase M15A  88.81 
 
 
143 aa  263  4e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.935739  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2108  peptidase M15A  88.11 
 
 
143 aa  261  2e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0272473 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1627  peptidase M15A  62.94 
 
 
143 aa  189  8e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.696702  normal  0.174828 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1066  hypothetical protein  44.93 
 
 
149 aa  105  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2481  peptidase M15A  41.61 
 
 
146 aa  103  7e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.307729  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3367  hypothetical protein  43.48 
 
 
165 aa  87.8  5e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2260  peptidase M15A  39.22 
 
 
162 aa  87  9e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4060  peptidase M15A  39.68 
 
 
236 aa  84.7  4e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000018588 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1672  peptidase M15A  38.41 
 
 
146 aa  84.3  4e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.261869  normal  0.0407517 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2171  peptidase M15A  38.26 
 
 
184 aa  65.1  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0551853 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1075  peptidase M15A  30.71 
 
 
157 aa  63.9  0.0000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0936  peptidase M15A  28.57 
 
 
151 aa  58.9  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000598155  hitchhiker  0.00000362871 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0765  Zinc D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  41.67 
 
 
263 aa  54.7  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.510522  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0511  peptidase M15A  44.62 
 
 
124 aa  53.9  0.0000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000425085  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3619  hypothetical protein  30.49 
 
 
221 aa  53.1  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.015549 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0235  hypothetical protein  40 
 
 
255 aa  53.5  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0241  hypothetical protein  46.15 
 
 
129 aa  52  0.000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.676098  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1443  Zinc D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  39.76 
 
 
242 aa  50.8  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2321  glycoside hydrolase family protein  40 
 
 
341 aa  49.3  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0467  Peptidase M15A  31.71 
 
 
110 aa  48.5  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.383433  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6567  Peptidase M15A  32.2 
 
 
513 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30050  putative peptidoglycan-binding domain-containing protein  30.56 
 
 
246 aa  48.5  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.0031896  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3823  peptidase M15A  32.95 
 
 
124 aa  48.1  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0939  hypothetical protein  32.95 
 
 
124 aa  47  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.02091  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1882  hypothetical protein  32.95 
 
 
124 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000965477  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1548  Peptidase M15A  44.9 
 
 
347 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2254  peptidase M15A  39.29 
 
 
80 aa  44.7  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1742  Peptidase M15A  44.9 
 
 
356 aa  43.9  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000376247  normal  0.422133 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1851  peptidase M15A  40.32 
 
 
224 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0969935  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01180  hypothetical protein  31.46 
 
 
355 aa  42.7  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.137096  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1914  peptidase M15A  38.98 
 
 
421 aa  40.4  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0141502  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1277  hypothetical protein  38.98 
 
 
426 aa  40  0.01  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.174616  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>