More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1531 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1997  FolC bifunctional protein  92.64 
 
 		 436 aa  789    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.708043 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3764  FolC bifunctional protein  93.1 
 
 		 435 aa  789    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1558  FolC bifunctional protein  89.02 
 
 		 428 aa  718    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.330747  normal  0.124911 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1531  FolC bifunctional protein  100 
 
 		 435 aa  866    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.468548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1899  folylpolyglutamate synthetase  76.32 
 
 		 435 aa  619  1e-176  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2714  FolC bifunctional protein  73.41 
 
 		 425 aa  618  1e-176  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.20841  normal  0.0950332 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3814  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  69.43 
 
 		 434 aa  587  1e-166  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1665  folylpolyglutamate synthetase  69.43 
 
 		 434 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.157637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23880  folylpolyglutamate synthetase  70.33 
 
 		 429 aa  578  1e-164  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.351749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2022  folylpolyglutamate synthetase  70.09 
 
 		 429 aa  551  1e-156  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34180  Folylpolyglutamate synthetase protein  65.52 
 
 		 433 aa  513  1e-144  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1468  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  48.23 
 
 		 422 aa  366  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2693  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  47.72 
 
 		 422 aa  355  8.999999999999999e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1337  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  47.72 
 
 		 422 aa  355  8.999999999999999e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.887259 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2471  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  47.72 
 
 		 422 aa  355  8.999999999999999e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2797  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  47.99 
 
 		 422 aa  355  1e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1911  folylpolyglutamate synthetase  48.58 
 
 		 422 aa  353  2e-96  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.553938 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02240  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  47.72 
 
 		 422 aa  352  5.9999999999999994e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1341  FolC bifunctional protein  47.72 
 
 		 422 aa  352  5.9999999999999994e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.420522  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02200  hypothetical protein  47.72 
 
 		 422 aa  352  5.9999999999999994e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2466  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  47.72 
 
 		 422 aa  352  5.9999999999999994e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2609  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  47.96 
 
 		 422 aa  352  5.9999999999999994e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2573  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  47.75 
 
 		 422 aa  350  3e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2864  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  47.84 
 
 		 422 aa  349  4e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.713895 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3455  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  47.72 
 
 		 422 aa  349  6e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0880  folylpolyglutamate synthase  43.19 
 
 		 443 aa  344  2e-93  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0202612  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1653  dihydrofolate synthase  46.78 
 
 		 421 aa  340  2e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0133997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1480  FolC bifunctional protein  46.84 
 
 		 432 aa  341  2e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.293616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2440  FolC bifunctional protein  47.22 
 
 		 423 aa  340  4e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.715138  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1423  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  44.55 
 
 		 434 aa  338  8e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0358  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  44.55 
 
 		 434 aa  338  8e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1532  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  44.55 
 
 		 434 aa  338  9e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.182883  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2507  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  45.69 
 
 		 422 aa  338  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1264  FolC bifunctional protein  47.79 
 
 		 437 aa  338  1.9999999999999998e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1618  FolC bifunctional protein  46.73 
 
 		 421 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0841806  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3331  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  47.62 
 
 		 420 aa  336  5e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0040495  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3067  FolC bifunctional protein  46.36 
 
 		 431 aa  336  5.999999999999999e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1492  FolC bifunctional protein  46.12 
 
 		 432 aa  336  5.999999999999999e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.744207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1396  FolC bifunctional protein  45.97 
 
 		 425 aa  335  1e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2607  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  45.45 
 
 		 422 aa  334  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0948083  normal  0.269404 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2716  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  45.45 
 
 		 422 aa  334  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0522  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  44.29 
 
 		 421 aa  333  3e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.250389  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2553  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  45.45 
 
 		 422 aa  333  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002876  dihydrofolate synthase/folylpolyglutamate synthase  44.58 
 
 		 420 aa  333  5e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.394624  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1077  FolC bifunctional protein (tetrahydrofolate synthase) (folylpolyglutamate synthase)  43.1 
 
 		 426 aa  333  5e-90  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1427  FolC bifunctional protein  45.87 
 
 		 432 aa  332  5e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.361934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2595  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  45.22 
 
 		 422 aa  332  7.000000000000001e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.538955 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2305  FolC bifunctional protein  43.68 
 
 		 430 aa  331  2e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.639794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03098  folylpolyglutamate synthase  44.77 
 
 		 406 aa  330  3e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0809  FolC bifunctional protein  46.56 
 
 		 423 aa  330  3e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0844236 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2835  FolC bifunctional protein  45.52 
 
 		 423 aa  329  6e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.353544  hitchhiker  0.00994834 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1618  FolC bifunctional protein  45.52 
 
 		 423 aa  329  7e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.029027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2758  FolC bifunctional protein  45.28 
 
 		 423 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.273906  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2741  FolC bifunctional protein  45.28 
 
 		 423 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.778738  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2877  folylpolyglutamate synthetase  44.52 
 
 		 436 aa  327  3e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.971694 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1909  FolC bifunctional protein  44.95 
 
 		 442 aa  325  9e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0873  folylpolyglutamate synthetase  45.79 
 
 		 436 aa  325  1e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0218133 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3265  cytoplasmic peptidoglycan synthetase C-terminal domain  48.27 
 
 		 448 aa  325  1e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.165848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0683  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  46.77 
 
 		 437 aa  325  1e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.944672  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1717  FolC bifunctional protein  46.54 
 
 		 437 aa  324  2e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2441  FolC bifunctional protein  46.54 
 
 		 437 aa  324  2e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.189653  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0765  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  46.54 
 
 		 447 aa  324  2e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2303  FolC bifunctional protein  46.54 
 
 		 455 aa  324  2e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.966782  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1371  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  48.92 
 
 		 422 aa  323  2e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.968541  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1862  FolC bifunctional protein  46.54 
 
 		 461 aa  324  2e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.59484  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0533  FolC bifunctional protein  46.54 
 
 		 461 aa  324  2e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1653  FolC bifunctional protein  46.54 
 
 		 461 aa  324  2e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1695  FolC bifunctional protein  43.02 
 
 		 432 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.382044 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6838  FolC bifunctional protein  44.75 
 
 		 436 aa  317  2e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.81174 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4618  FolC bifunctional protein  45.21 
 
 		 436 aa  318  2e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.653087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0775  FolC bifunctional protein  42.99 
 
 		 441 aa  317  2e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00183365  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2121  folylpolyglutamate synthetase  44.06 
 
 		 436 aa  317  3e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.700041  normal  0.055566 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3566  FolC bifunctional protein  44.32 
 
 		 436 aa  317  3e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.960741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4405  FolC bifunctional protein  44.32 
 
 		 436 aa  317  3e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.137077  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3962  FolC bifunctional protein  44.32 
 
 		 436 aa  317  3e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2983  FolC bifunctional protein  46.75 
 
 		 421 aa  316  5e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00108921  normal  0.642049 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2492  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  43.75 
 
 		 431 aa  316  6e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02507  folylpolyglutamate synthase; dihydrofolate synthase  45.73 
 
 		 432 aa  316  6e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3059  FolC bifunctional protein  45.18 
 
 		 437 aa  316  6e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.310579  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1487  FolC bifunctional protein  43.16 
 
 		 448 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00152366  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1968  FolC bifunctional protein  39.58 
 
 		 428 aa  314  1.9999999999999998e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.843796 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2045  FolC bifunctional protein  41.75 
 
 		 418 aa  313  2.9999999999999996e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0860305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1606  FolC bifunctional protein  42.22 
 
 		 426 aa  312  7.999999999999999e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1979  bifunctional folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  44.52 
 
 		 432 aa  312  9e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.119264 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4378  FolC bifunctional protein  44.06 
 
 		 436 aa  311  1e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0806  FolC bifunctional protein  41.29 
 
 		 425 aa  311  2e-83  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1023  folylpolyglutamate synthetase  43.88 
 
 		 432 aa  310  2.9999999999999997e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3857  FolC bifunctional protein  44.08 
 
 		 436 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3352  FolC bifunctional protein  44.08 
 
 		 436 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.269104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1026  dihydrofolate synthase  44.13 
 
 		 432 aa  309  8e-83  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.170834  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0902  FolC bifunctional protein  44.37 
 
 		 432 aa  308  2.0000000000000002e-82  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2302  folylpolyglutamate synthetase  43.48 
 
 		 436 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1331  FolC bifunctional protein  45.9 
 
 		 443 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.529889 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2149  FolC bifunctional protein  43.24 
 
 		 421 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.341709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1046  FolC bifunctional protein  42.93 
 
 		 411 aa  302  7.000000000000001e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.777875 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3801  folC bifunctional protein  38.21 
 
 		 437 aa  302  1e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.129032  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2463  FolC bifunctional protein  42.33 
 
 		 436 aa  297  2e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.399069 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1555  FolC bifunctional protein  44.55 
 
 		 438 aa  294  2e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.282101  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2133  FolC bifunctional protein  42.96 
 
 		 432 aa  292  1e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.197533  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1809  FolC bifunctional protein  42.17 
 
 		 432 aa  291  2e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>