182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1510 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_1510  hydrolase  100 
 
 		 277 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0758387  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1979  hydrolase, putative  97.05 
 
 		 293 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.708266  normal  0.0224758 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3781  hypothetical protein  97.03 
 
 		 292 aa  484  1e-136  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.447414 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1542  hydrolase  88.09 
 
 		 277 aa  457  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.884296  normal  0.124016 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1880  hydrolase, putative  73.29 
 
 		 277 aa  412  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2731  hypothetical protein  71.88 
 
 		 279 aa  372  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23610  putative hydrolase  64.2 
 
 		 285 aa  315  7e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0107656 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2000  putative hydrolase  64.2 
 
 		 285 aa  311  6.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445681  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3200  hypothetical protein  37.75 
 
 		 320 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.437465  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2741  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  27.71 
 
 		 288 aa  107  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.127946  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3295  hypothetical protein  37.11 
 
 		 320 aa  106  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.104823  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1019  hypothetical protein  41.59 
 
 		 326 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.237359  normal  0.123447 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0961  alpha/beta superfamily hydrolase/acyltransferase  27.97 
 
 		 277 aa  101  1e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0071  hypothetical protein  34.08 
 
 		 308 aa  100  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.603187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1908  hypothetical protein  32.63 
 
 		 300 aa  99.8  4e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.714341  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3920  hypothetical protein  33.64 
 
 		 322 aa  99  8e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2228  hypothetical protein  33.01 
 
 		 301 aa  95.5  9e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0093  hypothetical protein  31.97 
 
 		 333 aa  94.7  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1230  hypothetical protein  34.97 
 
 		 295 aa  95.1  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1578  hypothetical protein  32.22 
 
 		 305 aa  95.1  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.289717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4371  hypothetical protein  33.82 
 
 		 343 aa  94.4  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.287602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0235  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  27.7 
 
 		 287 aa  94.4  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0118  hypothetical protein  33.01 
 
 		 294 aa  93.2  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2954  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  28.94 
 
 		 285 aa  92.4  7e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6287  Protein of unknown function DUF829  25.36 
 
 		 308 aa  92  9e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000137217  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12443  hypothetical protein  27.82 
 
 		 288 aa  91.3  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.134258  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000946  predicted hydrolase or acyltransferase  25.49 
 
 		 285 aa  87  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2566  hypothetical protein  31.6 
 
 		 295 aa  84.3  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.767502  normal  0.0363066 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2857  alpha/beta superfamily hydrolase/acyltransferase  30.28 
 
 		 296 aa  84  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2720  hypothetical protein  25.7 
 
 		 288 aa  83.6  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0078  hypothetical protein  28.8 
 
 		 363 aa  83.6  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.682762  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0273  hypothetical protein  31.5 
 
 		 277 aa  83.2  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0089  alpha/beta hydrolase fold protein  33.95 
 
 		 311 aa  82.8  0.000000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.743714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06957  hypothetical protein  25.71 
 
 		 284 aa  82.4  0.000000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2593  hypothetical protein  25.58 
 
 		 288 aa  82.4  0.000000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5084  hypothetical protein  30.04 
 
 		 302 aa  82.4  0.000000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2021  hypothetical protein  32.49 
 
 		 326 aa  80.1  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0064  hypothetical protein  36.06 
 
 		 305 aa  77  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3100  hypothetical protein  37.4 
 
 		 323 aa  77  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00381116  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0719  hypothetical protein  25.59 
 
 		 283 aa  76.3  0.0000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.19261  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2243  hypothetical protein  29.86 
 
 		 326 aa  74.3  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.641786 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3537  hydrolase  24.91 
 
 		 287 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.297749  normal  0.0703626 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  29.3 
 
 		 350 aa  61.6  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  28.41 
 
 		 361 aa  59.3  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02180  hypothetical protein  21.56 
 
 		 285 aa  58.9  0.00000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.431162  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1150  dienelactone hydrolase  26.01 
 
 		 254 aa  58.2  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3047  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like protein  29.59 
 
 		 322 aa  57.8  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0033788  normal  0.0365868 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4246  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like  26.47 
 
 		 316 aa  56.2  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.760723  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5411  alpha/beta hydrolase fold  38.83 
 
 		 328 aa  52.8  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.173049  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  26.64 
 
 		 309 aa  51.6  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0415  alpha/beta fold family hydrolase  38.26 
 
 		 303 aa  51.6  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2981  alpha/beta fold family hydrolase  38.26 
 
 		 303 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2559  alpha/beta fold family hydrolase  38.26 
 
 		 280 aa  51.6  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0935  alpha/beta fold family hydrolase  38.26 
 
 		 303 aa  51.6  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0214  alpha/beta fold family hydrolase  38.26 
 
 		 280 aa  51.6  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2695  hypothetical protein  31.46 
 
 		 294 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4699  alpha/beta hydrolase fold  37.14 
 
 		 327 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3663  alpha/beta hydrolase fold  37.14 
 
 		 327 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.378837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2871  alpha/beta fold family hydrolase  42.22 
 
 		 303 aa  50.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.856592  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3858  alpha/beta hydrolase fold  37.14 
 
 		 327 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.387123 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0402  alpha/beta fold family hydrolase  34.91 
 
 		 324 aa  50.1  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2932  alpha/beta fold family hydrolase  42.22 
 
 		 303 aa  50.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1076  hypothetical protein  33.96 
 
 		 324 aa  49.7  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.773392  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2675  alpha/beta fold family hydrolase  33.96 
 
 		 324 aa  49.7  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.457884  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1479  alpha/beta hydrolase fold protein  21.78 
 
 		 257 aa  49.7  0.00005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2479  alpha/beta hydrolase fold  30.36 
 
 		 277 aa  49.7  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0099  alpha/beta fold family hydrolase  33.96 
 
 		 324 aa  49.7  0.00006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1260  alpha/beta fold family hydrolase  33.96 
 
 		 327 aa  49.7  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.809  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2822  alpha/beta fold family hydrolase  33.96 
 
 		 324 aa  49.7  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4013  bioH protein  29.08 
 
 		 255 aa  49.7  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2445  Alpha/beta hydrolase  36.19 
 
 		 327 aa  49.3  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1787  hypothetical protein  27.16 
 
 		 282 aa  49.3  0.00007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.568084  normal  0.505933 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4171  Alpha/beta hydrolase  27.34 
 
 		 306 aa  49.3  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.753522 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2887  hypothetical protein  30.85 
 
 		 294 aa  48.9  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.608912  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3394  hypothetical protein  29.89 
 
 		 251 aa  48.5  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.689408  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0492  alpha/beta hydrolase fold  30.71 
 
 		 286 aa  48.9  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.628855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0769  hydrolase, alpha/beta fold family  22.48 
 
 		 294 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000479635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0497  BAAT/Acyl-CoA thioester hydrolase  27.15 
 
 		 326 aa  48.5  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.702531  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1537  alpha/beta fold family hydrolase  35.96 
 
 		 326 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0118  alpha/beta fold family hydrolase  35.96 
 
 		 326 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.347516  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3630  bioH protein  28.57 
 
 		 259 aa  48.1  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1433  alpha/beta hydrolase fold  22.22 
 
 		 257 aa  48.5  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3567  alpha/beta hydrolase fold  36.89 
 
 		 328 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.253365  hitchhiker  0.00645223 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1649  alpha/beta fold family hydrolase  39.42 
 
 		 318 aa  47.4  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605923  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2273  alpha/beta hydrolase fold  37.5 
 
 		 259 aa  47.4  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000254072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03823  Alpha/beta hydrolase fold protein  34.31 
 
 		 310 aa  47.8  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23660  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  29.38 
 
 		 273 aa  47  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0523777 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0396  alpha/beta hydrolase fold protein  35.29 
 
 		 255 aa  47  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.075233 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4468  hydrolase, alpha/beta fold family  22.48 
 
 		 294 aa  47  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000249417  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  36.17 
 
 		 284 aa  47  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0304  lipase  37.35 
 
 		 308 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.107873 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0878  alpha/beta hydrolase fold protein  28.32 
 
 		 230 aa  47.4  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.692724 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4196  alpha/beta hydrolase fold  22.12 
 
 		 294 aa  47  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5552  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.99 
 
 		 370 aa  46.6  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.077135  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5045  alpha/beta hydrolase fold  35.85 
 
 		 325 aa  47  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.6879  normal  0.399471 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4430  alpha/beta fold family hydrolase  21.56 
 
 		 287 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.12561  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5127  alpha/beta hydrolase fold  28.17 
 
 		 249 aa  46.6  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2189  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 311 aa  46.6  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00113055  hitchhiker  0.000974583 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4179  alpha/beta hydrolase fold  32.38 
 
 		 271 aa  46.2  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2393  alpha/beta hydrolase fold  37.68 
 
 		 240 aa  45.8  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.507497 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>