More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1447 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02215  aspartate aminotransferase  74.44 
 
 		 405 aa  647    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1366  aminotransferase class I and II  74.44 
 
 		 405 aa  647    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.465492  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02175  hypothetical protein  74.44 
 
 		 405 aa  647    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1872  aminotransferase AlaT  99.5 
 
 		 403 aa  827    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.866522  normal  0.490058 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1481  aminotransferase AlaT  99.5 
 
 		 403 aa  828    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3310  aminotransferase AlaT  76.31 
 
 		 404 aa  657    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000424805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2559  aminotransferase AlaT  75.31 
 
 		 404 aa  653    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2516  aminotransferase AlaT  75.31 
 
 		 404 aa  653    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0408382  normal  0.443228 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1779  aminotransferase, classes I and II  92.56 
 
 		 403 aa  761    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3429  aminotransferase AlaT  74.44 
 
 		 405 aa  646    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.412347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3615  aminotransferase AlaT  92.8 
 
 		 403 aa  762    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.222479 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2445  aminotransferase AlaT  74.44 
 
 		 405 aa  647    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3983  aminotransferase AlaT  92.8 
 
 		 403 aa  757    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2522  aminotransferase AlaT  91.81 
 
 		 403 aa  753    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0098496  normal  0.421504 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3843  aminotransferase AlaT  99.75 
 
 		 403 aa  828    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0237926  normal  0.409513 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1362  aminotransferase AlaT  74.44 
 
 		 405 aa  647    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.594502 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1447  aminotransferase AlaT  100 
 
 		 403 aa  831    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0541953  normal  0.418968 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2439  aminotransferase AlaT  74.44 
 
 		 405 aa  647    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2666  aminotransferase AlaT  74.44 
 
 		 405 aa  647    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.180875  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27500  aminotransferase AlaT  92.06 
 
 		 403 aa  751    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0223  normal  0.0677346 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2583  aminotransferase AlaT  74.44 
 
 		 405 aa  647    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.45985  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2471  aminotransferase AlaT  75.31 
 
 		 404 aa  653    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00191502  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2327  aminotransferase AlaT  92.56 
 
 		 403 aa  754    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218058  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01427  aminotransferase AlaT  72.86 
 
 		 404 aa  634    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15420  aminotransferase AlaT  87.84 
 
 		 403 aa  725    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.169298  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2834  aminotransferase AlaT  74.06 
 
 		 405 aa  644    Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0052694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2571  aminotransferase AlaT  75.31 
 
 		 404 aa  653    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.853927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1097  aminotransferase AlaT  71.57 
 
 		 404 aa  633  1e-180  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.832418  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1558  aminotransferase AlaT  72.57 
 
 		 404 aa  631  1e-180  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.302938  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1450  aminotransferase AlaT  72.57 
 
 		 404 aa  631  1e-180  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1391  aminotransferase AlaT  73.07 
 
 		 404 aa  634  1e-180  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0476582  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2774  aminotransferase AlaT  72.57 
 
 		 404 aa  631  1e-180  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.363004  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2553  aminotransferase AlaT  73.32 
 
 		 404 aa  631  1e-180  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1563  aminotransferase AlaT  71.36 
 
 		 404 aa  630  1e-179  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1819  aminotransferase AlaT  72.32 
 
 		 404 aa  630  1e-179  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1490  aminotransferase AlaT  72.57 
 
 		 404 aa  630  1e-179  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1565  aminotransferase class I and II  73.62 
 
 		 404 aa  624  1e-178  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.114117  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3601  aminotransferase AlaT  71.25 
 
 		 405 aa  622  1e-177  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.217038  normal  0.16413 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0619  aminotransferase AlaT  72.32 
 
 		 404 aa  619  1e-176  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1348  aminotransferase AlaT  72.89 
 
 		 410 aa  605  9.999999999999999e-173  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.613177  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1772  aminotransferase AlaT  71.82 
 
 		 404 aa  603  1.0000000000000001e-171  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0842  aminotransferase AlaT  70.96 
 
 		 426 aa  599  1e-170  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.387526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1907  aminotransferase AlaT  70.93 
 
 		 404 aa  595  1e-169  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0371562  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1697  aminotransferase AlaT  70.43 
 
 		 404 aa  594  1e-169  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00135773  normal  0.0103936 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1475  aminotransferase AlaT  68.83 
 
 		 404 aa  597  1e-169  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.714124 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2197  aminotransferase AlaT  67.16 
 
 		 412 aa  592  1e-168  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000000141545  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1914  aminotransferase AlaT  69.92 
 
 		 404 aa  591  1e-168  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000233272  unclonable  0.00000266484 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004034  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  71.35 
 
 		 377 aa  593  1e-168  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2483  aminotransferase AlaT  69.67 
 
 		 404 aa  588  1e-167  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0279  aminotransferase AlaT  69.63 
 
 		 422 aa  590  1e-167  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.306917  normal  0.798305 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2040  aminotransferase AlaT  69.42 
 
 		 404 aa  588  1e-167  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00341686  hitchhiker  0.00762729 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2145  aminotransferase AlaT  69.17 
 
 		 404 aa  588  1e-167  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0123768  normal  0.013049 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0618  aminotransferase AlaT  68.89 
 
 		 426 aa  588  1e-167  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.647931  normal  0.109803 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2553  aminotransferase AlaT  68.33 
 
 		 406 aa  585  1e-166  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000352326 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2026  aminotransferase AlaT  65.75 
 
 		 409 aa  582  1.0000000000000001e-165  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2387  aminotransferase AlaT  65.42 
 
 		 414 aa  582  1.0000000000000001e-165  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0064  aminotransferase AlaT  67 
 
 		 415 aa  581  1.0000000000000001e-165  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1164  aminotransferase AlaT  68.51 
 
 		 423 aa  583  1.0000000000000001e-165  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000136093 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2136  aminotransferase AlaT  68.67 
 
 		 404 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000003299  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1540  aminotransferase AlaT  67.58 
 
 		 409 aa  584  1.0000000000000001e-165  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.790745 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10342  aminotransferase AlaT  69.15 
 
 		 429 aa  583  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.535364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1935  aminotransferase AlaT  69.17 
 
 		 404 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00236574  normal  0.0314212 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1872  aminotransferase AlaT  68.92 
 
 		 404 aa  581  1.0000000000000001e-165  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4521  aminotransferase AlaT  68.67 
 
 		 404 aa  580  1e-164  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2267  aminotransferase AlaT  68.92 
 
 		 403 aa  579  1e-164  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0850565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7259  aminotransferase AlaT  67.99 
 
 		 404 aa  581  1e-164  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.106863 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0903  aminotransferase AlaT  68.91 
 
 		 429 aa  580  1e-164  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1047  aminotransferase AlaT  68.91 
 
 		 429 aa  580  1e-164  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2382  aminotransferase AlaT  68.56 
 
 		 416 aa  580  1e-164  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.378637  normal  0.475117 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1993  aminotransferase AlaT  68.42 
 
 		 404 aa  580  1e-164  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000340923  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2340  aminotransferase AlaT  68.67 
 
 		 404 aa  578  1e-164  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.599264  hitchhiker  0.0000284015 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2186  aminotransferase AlaT  68.67 
 
 		 404 aa  579  1e-164  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0116007  hitchhiker  0.0000796171 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1805  aminotransferase AlaT  68.32 
 
 		 416 aa  578  1e-164  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.605572  hitchhiker  0.00221354 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2248  aminotransferase AlaT  68.67 
 
 		 404 aa  580  1e-164  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000013752  hitchhiker  0.00000000752949 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2838  aminotransferase AlaT  67.58 
 
 		 406 aa  579  1e-164  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00546919  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2235  aminotransferase AlaT  68.67 
 
 		 404 aa  580  1e-164  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000654312  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2048  aminotransferase AlaT  68.42 
 
 		 404 aa  579  1e-164  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000163504  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1552  aminotransferase AlaT  67.92 
 
 		 409 aa  577  1.0000000000000001e-163  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0930  aminotransferase AlaT  67.99 
 
 		 415 aa  571  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.703873  normal  0.497759 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1765  aminotransferase AlaT  67.74 
 
 		 412 aa  570  1e-161  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.436136  normal  0.213535 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3232  aminotransferase AlaT  65.59 
 
 		 411 aa  567  1e-160  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00114602  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1994  aminotransferase AlaT  65.09 
 
 		 427 aa  565  1e-160  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2397  aminotransferase AlaT  66.5 
 
 		 415 aa  566  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2271  aminotransferase AlaT  66.5 
 
 		 412 aa  566  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1830  aminotransferase AlaT  65.5 
 
 		 409 aa  565  1e-160  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01072  aminotransferase AlaT  66.25 
 
 		 406 aa  565  1e-160  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0437  aminotransferase AlaT  64.66 
 
 		 418 aa  565  1e-160  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2233  aminotransferase AlaT  66.5 
 
 		 412 aa  566  1e-160  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1326  aminotransferase AlaT  65.09 
 
 		 413 aa  564  1.0000000000000001e-159  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0763036  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0461  aminotransferase class I and II  66.67 
 
 		 418 aa  563  1.0000000000000001e-159  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1967  aminotransferase AlaT  63.84 
 
 		 409 aa  561  1.0000000000000001e-159  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000390932  normal  0.209887 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2034  aminotransferase AlaT  65.59 
 
 		 409 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1418  aminotransferase AlaT  67.99 
 
 		 412 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00886152  normal  0.0522162 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1879  aminotransferase AlaT  67.99 
 
 		 412 aa  560  1e-158  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123534  hitchhiker  0.0000142896 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1911  aminotransferase AlaT  63.91 
 
 		 426 aa  558  1e-158  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6224  aminotransferase AlaT  67.74 
 
 		 412 aa  558  1e-158  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0441  aminotransferase AlaT  68.32 
 
 		 428 aa  558  1e-158  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.283674  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0428  aminotransferase AlaT  68.32 
 
 		 428 aa  558  1e-158  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1855  aminotransferase AlaT  67.74 
 
 		 412 aa  558  1e-158  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.300188  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0451  aminotransferase AlaT  68.32 
 
 		 428 aa  558  1e-158  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.343085  normal  0.024281 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>