173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1414 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_1414  zinc/iron permease  100 
 
 		 312 aa  607  1e-173  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3874  zinc/iron permease  97.44 
 
 		 312 aa  541  1e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0665498  normal  0.190441 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1445  zinc/iron permease  93.91 
 
 		 312 aa  542  1e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.67  normal  0.0542344 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1836  hypothetical protein  98.8 
 
 		 250 aa  478  1e-134  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.438488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1862  Zinc transporter ZIP  77.36 
 
 		 308 aa  413  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.697173 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2053  hypothetical protein  75.58 
 
 		 305 aa  407  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0183571  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2787  Zinc transporter ZIP  74.01 
 
 		 309 aa  389  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29340  Zinc/divalent heavy metal cation permease  69.61 
 
 		 317 aa  345  5e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2324  hypothetical protein  58.09 
 
 		 305 aa  259  3e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3615  zinc/iron permease  49.21 
 
 		 260 aa  217  2.9999999999999998e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.314729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3953  zinc/iron permease  49.21 
 
 		 260 aa  217  2.9999999999999998e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.210601  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2663  zinc/iron permease  48.95 
 
 		 300 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0744572  normal  0.129144 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0387  zinc/iron permease  50.87 
 
 		 300 aa  209  4e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.314049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3261  zinc/iron permease  47.72 
 
 		 304 aa  208  1e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.28457  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2969  zinc/iron permease  54.85 
 
 		 306 aa  207  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1721  zinc/iron permease  42.91 
 
 		 309 aa  202  8e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2417  ZIP zinc transporter family protein  48.95 
 
 		 279 aa  199  5e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1295  zinc/iron permease  50.66 
 
 		 258 aa  196  6e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.80159  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0781  zinc/iron permease  43.39 
 
 		 261 aa  192  5e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.910074  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5081  hypothetical protein  49.61 
 
 		 300 aa  192  7e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.53383  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1670  zinc/iron permease  43.39 
 
 		 255 aa  189  5e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57990  hypothetical protein  48.84 
 
 		 310 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00170  zinc/iron permease  40 
 
 		 261 aa  182  7e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172235  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0408  zinc/iron permease  46.22 
 
 		 278 aa  179  4.999999999999999e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.194102 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2194  zinc/iron permease  43.59 
 
 		 285 aa  176  3e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0954  zinc/iron permease  44.35 
 
 		 297 aa  176  5e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.55549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1051  zinc/iron permease  44.03 
 
 		 246 aa  176  6e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1163  zinc/iron permease  48.09 
 
 		 300 aa  175  7e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.436725  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4268  zinc/iron permease  44.8 
 
 		 297 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0947  zinc/iron permease  44.35 
 
 		 302 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0986  zinc/iron permease  43.95 
 
 		 297 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1033  zinc/iron permease  43.21 
 
 		 245 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0713  zinc/iron permease  40.47 
 
 		 258 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233647  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1087  zinc/iron permease  43.21 
 
 		 245 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2925  GufA protein  39.78 
 
 		 273 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0386986  hitchhiker  0.00221874 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0415  zinc/iron permease  38.55 
 
 		 264 aa  160  2e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0852  Zinc transporter ZIP  44.8 
 
 		 297 aa  159  4e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0510  zinc/iron permease  40.68 
 
 		 271 aa  159  5e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0830  zinc/iron permease  40.22 
 
 		 271 aa  159  6e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0208  zinc/iron permease  39.25 
 
 		 269 aa  159  7e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.478364  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3117  zinc/iron permease  37.14 
 
 		 251 aa  158  1e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0597  zinc/iron permease  41.22 
 
 		 246 aa  158  1e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000532722  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0414  zinc/iron permease  37.64 
 
 		 269 aa  157  2e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1497  zinc/iron permease  37.45 
 
 		 269 aa  157  2e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.265438  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0056  zinc/iron permease  40.54 
 
 		 271 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0715  zinc/iron permease  40.08 
 
 		 262 aa  156  5.0000000000000005e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169409 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1152  zinc/iron permease  40.74 
 
 		 271 aa  155  6e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.661251  normal  0.519901 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2509  zinc/iron permease  39.69 
 
 		 259 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0214  zinc/iron permease  38.55 
 
 		 268 aa  154  2e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000199646  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1977  hypothetical protein  42.07 
 
 		 270 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1916  zinc/iron permease  42.42 
 
 		 270 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3571  zinc/iron permease  41.04 
 
 		 270 aa  153  5e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.640289  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1761  zinc/iron permease  36.6 
 
 		 269 aa  152  7e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.209568  normal  0.0390334 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1616  zinc/iron permease  37.94 
 
 		 272 aa  150  4e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1427  zinc/iron permease  39.26 
 
 		 272 aa  149  8e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1781  zinc/iron permease  43.36 
 
 		 284 aa  146  3e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.080702 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0382  gufA protein, putative  36.74 
 
 		 271 aa  142  7e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2912  zinc/iron permease  39.45 
 
 		 264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1728  ZIP zinc transporter family protein  41.09 
 
 		 277 aa  138  1e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0265073  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2882  zinc/iron permease  43.56 
 
 		 267 aa  137  2e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0655  zinc/iron permease  42.26 
 
 		 270 aa  130  3e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0529529  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0224  metal cation transporter, zinc (Zn2+)-iron (Fe2+) permease (ZIP) family protein  35.06 
 
 		 273 aa  128  1.0000000000000001e-28  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0186331  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1749  zinc/iron permease  34.69 
 
 		 244 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0854  zinc/iron permease  34.17 
 
 		 243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2148  zinc/iron permease  37.69 
 
 		 276 aa  125  7e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1779  zinc/iron permease  39.56 
 
 		 258 aa  125  1e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0305  zinc/iron permease  38.17 
 
 		 244 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0694906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0036  zinc/iron permease  36.55 
 
 		 247 aa  117  3e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1038  zinc/iron permease  39.56 
 
 		 254 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.350201  normal  0.90903 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0870  zinc/iron permease  32.35 
 
 		 290 aa  115  1.0000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5198  zinc/iron permease  32.71 
 
 		 286 aa  113  5e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3077  zinc/iron permease  36.03 
 
 		 265 aa  106  4e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2670  zinc transporter ZupT  31.09 
 
 		 258 aa  106  6e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000324662  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0908  zinc transporter ZupT  32.65 
 
 		 266 aa  103  5e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.855869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0568  zinc transporter ZupT  32.49 
 
 		 252 aa  102  1e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.181834  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07430  zinc/iron permease  30.68 
 
 		 272 aa  99.4  8e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0130  zinc/iron permease  33.47 
 
 		 265 aa  96.3  6e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1236  zinc/iron permease  32.26 
 
 		 267 aa  96.3  6e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.216123  normal  0.828913 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1456  zinc transporter ZupT  30.89 
 
 		 267 aa  96.3  7e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.556549  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1152  zinc transporter ZupT  32.26 
 
 		 266 aa  95.5  9e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1001  zinc/iron permease  31.27 
 
 		 267 aa  95.1  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2676  zinc transporter ZupT  33.85 
 
 		 269 aa  93.6  4e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.264874 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0256  zinc/iron permease  35.27 
 
 		 247 aa  93.2  6e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.015628  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0009  zinc/iron permease  36.77 
 
 		 248 aa  92.4  8e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.288224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4292  zinc/iron permease  31.82 
 
 		 310 aa  89.4  7e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0157  zinc transporter ZupT  29.89 
 
 		 268 aa  87.8  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3555  zinc transporter ZupT  31.58 
 
 		 271 aa  87.4  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000223536  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1320  zinc transporter ZupT  30.94 
 
 		 298 aa  88.2  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00680166  hitchhiker  0.00681091 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3472  zinc transporter ZupT  35.54 
 
 		 253 aa  87.8  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000026596  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1174  zinc/iron permease  32.13 
 
 		 281 aa  87  4e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.371558  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4285  zinc transporter ZupT  33.33 
 
 		 255 aa  85.9  8e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22030  predicted divalent heavy-metal cations transporter  34.87 
 
 		 275 aa  85.9  9e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.895881  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1074  zinc/iron permease  30.96 
 
 		 255 aa  84.7  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1483  zinc/iron permease  29.32 
 
 		 270 aa  84.3  0.000000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.287328  normal  0.134401 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49400  predicted protein  32.61 
 
 		 334 aa  83.2  0.000000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.396172  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0563  zinc/iron permease  30.45 
 
 		 239 aa  83.2  0.000000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2825  zinc transporter ZupT  30.43 
 
 		 298 aa  83.2  0.000000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2971  zinc transporter ZupT  29.92 
 
 		 277 aa  83.2  0.000000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_52343  iron permease 1  30.77 
 
 		 265 aa  81.3  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0298528  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3064  zinc/iron permease  34.74 
 
 		 248 aa  80.9  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>