More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1401 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_1401  GTP cyclohydrolase I  100 
 
 		 181 aa  374  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.154537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3888  GTP cyclohydrolase I  99.45 
 
 		 181 aa  373  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.299741 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1823  GTP cyclohydrolase I  99.45 
 
 		 190 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00310183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1431  GTP cyclohydrolase I  95.03 
 
 		 181 aa  359  1e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.33903  normal  0.426591 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1715  GTP cyclohydrolase I  91.71 
 
 		 181 aa  351  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1845  GTP cyclohydrolase I  90.06 
 
 		 181 aa  346  1e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.350099 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2035  GTP cyclohydrolase I  90.06 
 
 		 181 aa  345  2e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.31903  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3598  GTP cyclohydrolase I  87.29 
 
 		 181 aa  341  4e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.812952  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42850  GTP cyclohydrolase I  86.74 
 
 		 181 aa  340  8e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23690  GTP cyclohydrolase I  85.64 
 
 		 181 aa  334  3.9999999999999995e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0310829  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2744  GTP cyclohydrolase I  85.64 
 
 		 181 aa  332  1e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0752455  normal  0.719118 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1690  GTP cyclohydrolase I  79.89 
 
 		 186 aa  304  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19630  GTP cyclohydrolase I  79.33 
 
 		 186 aa  303  9.000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1182  GTP cyclohydrolase I  75.98 
 
 		 187 aa  298  2e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1020  GTP cyclohydrolase I  75.42 
 
 		 187 aa  296  7e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0891  GTP cyclohydrolase I  76.54 
 
 		 186 aa  296  1e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2021  GTP cyclohydrolase I  77.09 
 
 		 186 aa  296  2e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.780834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3207  GTP cyclohydrolase I  77.09 
 
 		 186 aa  293  1e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.574177  normal  0.0542023 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2512  GTP cyclohydrolase I  76.54 
 
 		 186 aa  291  3e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3289  GTP cyclohydrolase  76.4 
 
 		 186 aa  291  3e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2469  GTP cyclohydrolase I  70.17 
 
 		 181 aa  284  4e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1299  GTP cyclohydrolase  72.63 
 
 		 185 aa  282  2.0000000000000002e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2093  GTP cyclohydrolase  69.27 
 
 		 179 aa  280  5.000000000000001e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.101734  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2930  GTP cyclohydrolase I  67.96 
 
 		 182 aa  280  9e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.128546  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2294  GTP cyclohydrolase I  71.91 
 
 		 184 aa  278  4e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1799  GTP cyclohydrolase I  72.07 
 
 		 198 aa  277  8e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.982751  hitchhiker  0.00000626036 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3782  GTP cyclohydrolase I  71.51 
 
 		 189 aa  274  4e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0548  GTP cyclohydrolase I  67.6 
 
 		 184 aa  271  4.0000000000000004e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2814  GTP cyclohydrolase I  65.92 
 
 		 179 aa  265  2.9999999999999995e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1670  GTP cyclohydrolase I  66.29 
 
 		 185 aa  264  4e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2683  GTP cyclohydrolase I  65.92 
 
 		 179 aa  264  5.999999999999999e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2678  GTP cyclohydrolase I  67.6 
 
 		 180 aa  262  2e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.508198  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1393  GTP cyclohydrolase I  68.72 
 
 		 200 aa  256  2e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.367158  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0955  GTP cyclohydrolase I  63.43 
 
 		 201 aa  246  1e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000998174  hitchhiker  0.00336193 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0863  GTP cyclohydrolase I  64.53 
 
 		 188 aa  245  2e-64  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1153  GTP cyclohydrolase I  64.53 
 
 		 184 aa  246  2e-64  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3350  GTP cyclohydrolase I  63.37 
 
 		 247 aa  244  4.9999999999999997e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2117  GTP cyclohydrolase I  62.01 
 
 		 203 aa  236  1e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2537  GTP cyclohydrolase I  62.79 
 
 		 235 aa  235  3e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0402  GTP cyclohydrolase I  64.53 
 
 		 235 aa  235  3e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.160762  normal  0.817545 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1425  GTP cyclohydrolase I  60.23 
 
 		 203 aa  233  9e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.899017  normal  0.42931 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0859  GTP cyclohydrolase I  59.22 
 
 		 226 aa  233  1.0000000000000001e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.323599 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1044  GTP cyclohydrolase  59.32 
 
 		 203 aa  233  1.0000000000000001e-60  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.663333 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0939  GTP cyclohydrolase I  61.63 
 
 		 239 aa  233  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1390  GTP cyclohydrolase I  57.54 
 
 		 213 aa  233  1.0000000000000001e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0912  GTP cyclohydrolase I  61.63 
 
 		 239 aa  233  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4616  GTP cyclohydrolase I  62.79 
 
 		 212 aa  233  1.0000000000000001e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0762321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0859  GTP cyclohydrolase I  59.77 
 
 		 219 aa  232  2.0000000000000002e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.765891  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0206  GTP cyclohydrolase I  58.38 
 
 		 202 aa  230  7.000000000000001e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1597  GTP cyclohydrolase I  60.47 
 
 		 213 aa  230  1e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.874876  normal  0.473501 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3367  GTP cyclohydrolase I  61.05 
 
 		 235 aa  229  2e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501269  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0969  GTP cyclohydrolase  59.3 
 
 		 243 aa  229  2e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0257975  normal  0.517316 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1858  GTP cyclohydrolase I  60.47 
 
 		 218 aa  228  3e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0976  GTP cyclohydrolase I  59.65 
 
 		 219 aa  228  3e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.49412  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1496  GTP cyclohydrolase I  59.78 
 
 		 190 aa  227  5e-59  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3847  GTP cyclohydrolase I  59.32 
 
 		 218 aa  227  6e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1778  GTP cyclohydrolase I  59.22 
 
 		 190 aa  227  7e-59  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1949  GTP cyclohydrolase I  57.06 
 
 		 216 aa  227  8e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.414952 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0372  GTP cyclohydrolase I  57.22 
 
 		 223 aa  226  1e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.884596  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2208  GTP cyclohydrolase  56.11 
 
 		 199 aa  226  1e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0579312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0754  GTP cyclohydrolase I  56.67 
 
 		 216 aa  226  2e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0864  GTP cyclohydrolase I  57.54 
 
 		 214 aa  225  3e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0890  GTP cyclohydrolase I  57.54 
 
 		 214 aa  225  3e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.273347  normal  0.916518 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1588  GTP cyclohydrolase I  60.34 
 
 		 223 aa  224  4e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1694  GTP cyclohydrolase I  56.67 
 
 		 195 aa  222  2e-57  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4149  GTP cyclohydrolase I  54.75 
 
 		 210 aa  221  4e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0266568 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1481  GTP cyclohydrolase I  56.74 
 
 		 190 aa  221  4.9999999999999996e-57  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2932  GTP cyclohydrolase I  57.54 
 
 		 201 aa  221  4.9999999999999996e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0900198 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0193  GTP cyclohydrolase I  56.98 
 
 		 220 aa  220  9.999999999999999e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0187  GTP cyclohydrolase I  57.89 
 
 		 190 aa  219  1.9999999999999999e-56  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_34960  GTP cyclohydrolase I (GTP-CH-I)  56.14 
 
 		 270 aa  219  1.9999999999999999e-56  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0225  GTP cyclohydrolase I  57.89 
 
 		 190 aa  218  3.9999999999999997e-56  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08636  GTP cyclohydrolase I  54.49 
 
 		 199 aa  218  3.9999999999999997e-56  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6956  GTP cyclohydrolase I  55.31 
 
 		 195 aa  217  7.999999999999999e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.837765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0204  GTP cyclohydrolase I  57.31 
 
 		 190 aa  216  1e-55  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_21868  predicted protein  55.81 
 
 		 186 aa  216  2e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.213311  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2086  GTP cyclohydrolase I  57.14 
 
 		 179 aa  216  2e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2156  GTP cyclohydrolase I  58.48 
 
 		 193 aa  216  2e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0625  GTP cyclohydrolase I  55.62 
 
 		 193 aa  215  2.9999999999999998e-55  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.497078 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0041  GTP cyclohydrolase I  54.44 
 
 		 194 aa  212  1.9999999999999998e-54  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04920  GTP cyclohydrolase I, putative  54.65 
 
 		 435 aa  209  1e-53  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0131  GTP cyclohydrolase I  54.19 
 
 		 206 aa  204  7e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0705  GTP cyclohydrolase I  53.33 
 
 		 226 aa  201  5e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08188  hypothetical protein similar to GTP cyclohydrolase I (Broad)  52.05 
 
 		 329 aa  198  3e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1041  GTP cyclohydrolase I  52.02 
 
 		 213 aa  197  1.0000000000000001e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.25698  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1075  GTP cyclohydrolase I  52.02 
 
 		 213 aa  195  2.0000000000000003e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.76008  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0301  GTP cyclohydrolase I  52.22 
 
 		 225 aa  195  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000150261  normal  0.11188 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0017  GTP cyclohydrolase I  51.96 
 
 		 224 aa  194  5.000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4504  GTP cyclohydrolase I  52.22 
 
 		 210 aa  191  4e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2980  GTP cyclohydrolase I  54.1 
 
 		 185 aa  191  5e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000239263  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3446  GTP cyclohydrolase I  53.89 
 
 		 194 aa  190  1e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0793851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1233  GTP cyclohydrolase I  51.11 
 
 		 186 aa  186  1e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.520451  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9174  GTP cyclohydrolase I  51.11 
 
 		 193 aa  184  4e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2660  GTP cyclohydrolase I  50.87 
 
 		 212 aa  185  4e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00979899  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0594  GTP cyclohydrolase I  50 
 
 		 190 aa  184  6e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5183  GTP cyclohydrolase I  50 
 
 		 232 aa  184  6e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.58549  normal  0.532793 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2207  GTP cyclohydrolase I  51.45 
 
 		 201 aa  184  7e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.137028  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0553  GTP cyclohydrolase I  52.6 
 
 		 188 aa  184  8e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2894  GTP cyclohydrolase I  50 
 
 		 207 aa  183  1.0000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3114  GTP cyclohydrolase I  48.6 
 
 		 234 aa  183  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.942606  normal  0.532138 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>