14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1229 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1627  hypothetical protein  88.64 
 
 		 363 aa  639    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0587866  normal  0.197704 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4090  hypothetical protein  88.07 
 
 		 355 aa  639    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1229  hypothetical protein  100 
 
 		 352 aa  729    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000000235297 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1691  hypothetical protein  41.38 
 
 		 366 aa  286  5.999999999999999e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0956962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0529  hypothetical protein  33.55 
 
 		 356 aa  156  4e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05580  hypothetical protein  32.25 
 
 		 356 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5027  hypothetical protein  31.76 
 
 		 358 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4978  hypothetical protein  33.01 
 
 		 361 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4851  hypothetical protein  31.53 
 
 		 358 aa  143  4e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0599931 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0487  hypothetical protein  32.91 
 
 		 358 aa  142  7e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0560  hypothetical protein  37.33 
 
 		 289 aa  108  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.294179  normal  0.808138 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0606  hypothetical protein  23.24 
 
 		 301 aa  65.9  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4163  hypothetical protein  24.47 
 
 		 331 aa  53.1  0.000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.254475  normal  0.553916 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1972  hypothetical protein  35.14 
 
 		 327 aa  44.7  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000201886 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>