9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1103 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



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Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_1103  lipoprotein  100 
 
 		 182 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4224  hypothetical protein  96.7 
 
 		 182 aa  340  5e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.98466  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1498  putative lipoprotein  96.7 
 
 		 182 aa  340  7e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00314767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4119  lipoprotein  95.05 
 
 		 182 aa  336  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1062  putative lipoprotein  60.87 
 
 		 184 aa  233  9e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3368  hypothetical protein  54.3 
 
 		 183 aa  204  7e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0179513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1440  putative lipoprotein  56.28 
 
 		 183 aa  203  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.681326  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16560  putative lipoprotein  55.74 
 
 		 183 aa  201  3e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39370  hypothetical protein  48.63 
 
 		 180 aa  153  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.154997  n/a   
 
 
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