More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1082 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



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Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02724  ssDNA exonuclease, 5' -> 3'-specific  57.17 
 
 
577 aa  649    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0329903  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0800  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  56.99 
 
 
577 aa  647    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000133644  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4244  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  98.24 
 
 
569 aa  1125    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3218  ssDNA exonuclease RecJ  57.17 
 
 
577 aa  649    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1477  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  98.24 
 
 
569 aa  1129    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.221142  normal  0.152861 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0817  ssDNA exonuclease RecJ  56.99 
 
 
577 aa  646    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0564  ssDNA exonuclease RecJ  56.2 
 
 
579 aa  652    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.755584  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4094  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  55.4 
 
 
584 aa  638    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0895  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  57.37 
 
 
574 aa  665    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00647081 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3890  ssDNA exonuclease RecJ  60.5 
 
 
577 aa  667    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.874306  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0952  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  60.5 
 
 
574 aa  694    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1488  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  87.87 
 
 
569 aa  1012    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1298  RecJ exonuclease  87.92 
 
 
571 aa  1018    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.882929  normal  0.617769 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4183  ssDNA exonuclease RecJ  56.99 
 
 
577 aa  647    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3849  ssDNA exonuclease RecJ  60.9 
 
 
577 aa  665    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.333614 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3641  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  58.77 
 
 
577 aa  682    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1035  exonuclease RecJ  87.35 
 
 
569 aa  1022    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3378  ssDNA exonuclease RecJ  58.99 
 
 
577 aa  652    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3312  ssDNA exonuclease RecJ  56.99 
 
 
577 aa  647    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02687  hypothetical protein  57.17 
 
 
577 aa  649    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0479122  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3302  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  54.34 
 
 
572 aa  645    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0912686  normal  0.117483 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1082  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  100 
 
 
569 aa  1143    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0845  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  58.6 
 
 
577 aa  682    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00958  ssDNA exonuclease RecJ  56.23 
 
 
579 aa  664    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0892  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  60.54 
 
 
584 aa  691    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.488933  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3376  exonuclease RecJ  84.71 
 
 
569 aa  963    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.593595 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0772  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  57.87 
 
 
574 aa  688    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.167693  hitchhiker  0.00446395 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0807  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  57.87 
 
 
574 aa  692    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39440  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  81.55 
 
 
569 aa  922    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.31407  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1213  exonuclease RecJ  57.77 
 
 
581 aa  645    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1395  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  82.31 
 
 
571 aa  950    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0749  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  57.77 
 
 
574 aa  671    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0015193  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3273  ssDNA exonuclease RecJ  58.99 
 
 
577 aa  652    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3198  ssDNA exonuclease RecJ  58.99 
 
 
577 aa  654    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.697919  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3210  ssDNA exonuclease RecJ  58.99 
 
 
577 aa  653    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.398907 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0897  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  57.02 
 
 
574 aa  673    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2737  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  56.73 
 
 
574 aa  647    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4142  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  97.89 
 
 
569 aa  1118    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.810057 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1993  ssDNA exonuclease RecJ  57.44 
 
 
584 aa  669    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3424  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  59.53 
 
 
576 aa  637    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.297966  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3760  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  56.79 
 
 
610 aa  650    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.671236 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3447  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  58.77 
 
 
574 aa  682    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0797  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  59.62 
 
 
574 aa  693    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3226  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  59.37 
 
 
574 aa  693    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0665  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  57.97 
 
 
574 aa  678    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0729862  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3051  ssDNA exonuclease RecJ  56.99 
 
 
577 aa  646    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16220  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  82.14 
 
 
571 aa  946    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3025  ssDNA exonuclease RecJ  56.99 
 
 
577 aa  645    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0881  ssDNA exonuclease RecJ  60.9 
 
 
577 aa  665    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.796775  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3522  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  58.77 
 
 
577 aa  682    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3276  ssDNA exonuclease RecJ  58.99 
 
 
577 aa  653    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004439  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  56.75 
 
 
579 aa  673    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3329  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  59.79 
 
 
574 aa  697    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0922  ssDNA exonuclease RecJ  60.72 
 
 
577 aa  663    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0863  ssDNA exonuclease RecJ  56.67 
 
 
584 aa  631  1e-180  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3310  ssDNA exonuclease RecJ  58.63 
 
 
577 aa  630  1e-179  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.24828  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3298  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  57.42 
 
 
580 aa  625  1e-178  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.746333  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1474  single-strand DNA-specific exonuclease  55.54 
 
 
573 aa  626  1e-178  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1417  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  53.91 
 
 
579 aa  623  1e-177  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0647  ssDNA exonuclease RecJ  56.33 
 
 
584 aa  624  1e-177  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.252802  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2272  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  55.83 
 
 
577 aa  622  1e-177  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1567  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  53.39 
 
 
579 aa  619  1e-176  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3712  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  53.42 
 
 
572 aa  619  1e-176  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1460  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  61.34 
 
 
574 aa  617  1e-175  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0618  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  55.25 
 
 
574 aa  613  9.999999999999999e-175  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1569  single-stranded-DNA-specific exonuclease  55.25 
 
 
574 aa  612  9.999999999999999e-175  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.160712  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03407  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  53.51 
 
 
573 aa  596  1e-169  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1819  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  56.81 
 
 
577 aa  578  1.0000000000000001e-163  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0649366  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1189  RecJ exonuclease  55.94 
 
 
574 aa  573  1.0000000000000001e-162  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1771  exonuclease RecJ  55.09 
 
 
565 aa  570  1e-161  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.495895  normal  0.722264 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1969  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  53.6 
 
 
563 aa  568  1e-161  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00305659  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2065  exonuclease RecJ  56.2 
 
 
564 aa  564  1.0000000000000001e-159  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0628  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  55.6 
 
 
599 aa  559  1e-158  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2838  RecJ exonuclease  52.53 
 
 
566 aa  557  1e-157  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.934115  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1074  exonuclease RecJ  53.53 
 
 
565 aa  548  1e-155  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0444947  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1038  exonuclease RecJ  53.25 
 
 
566 aa  550  1e-155  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.329478 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1154  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  53.67 
 
 
565 aa  545  1e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0447096 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2758  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  52.42 
 
 
574 aa  542  1e-153  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2026  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  53.67 
 
 
565 aa  545  1e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.698536 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2153  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  53.67 
 
 
565 aa  545  1e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000147893  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1448  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  52.08 
 
 
577 aa  535  1e-151  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5422  RecJ exonuclease  53.94 
 
 
565 aa  536  1e-151  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3424  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  52.42 
 
 
574 aa  534  1e-150  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2134  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  54.37 
 
 
565 aa  533  1e-150  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0640  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  49.32 
 
 
613 aa  533  1e-150  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5961  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  54.2 
 
 
565 aa  531  1e-150  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.987838  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1817  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  52.79 
 
 
585 aa  531  1e-149  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.123849  normal  0.0771206 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1698  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  53.8 
 
 
564 aa  530  1e-149  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2721  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  53.8 
 
 
564 aa  530  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1885  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  53.24 
 
 
564 aa  530  1e-149  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.214774  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1478  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  53.8 
 
 
564 aa  530  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2642  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  53.8 
 
 
564 aa  530  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
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NC_012791  Vapar_1208  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  50.86 
 
 
573 aa  531  1e-149  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2588  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  53.62 
 
 
564 aa  530  1e-149  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2205  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  53.8 
 
 
564 aa  530  1e-149  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008836  BMA10229_A3113  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  53.8 
 
 
564 aa  530  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008542  Bcen2424_2116  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  54.2 
 
 
565 aa  531  1e-149  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.457344  n/a   
 
 
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NC_003295  RSc1115  single-stranded-DNA-specific exonuclease protein  53.99 
 
 
565 aa  528  1e-148  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00151931  normal  0.274168 
 
 
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NC_010002  Daci_5406  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  50.35 
 
 
572 aa  527  1e-148  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_010717  PXO_00083  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  51.26 
 
 
558 aa  522  1e-147  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.491155  n/a   
 
 
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