256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1076 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1384  threonine synthase  89.55 
 
 		 469 aa  872    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.0019152  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1471  threonine synthase  99.57 
 
 		 469 aa  967    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.466033  normal  0.368442 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3393  threonine synthase  91.04 
 
 		 469 aa  874    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.955662  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1481  threonine synthase  91.47 
 
 		 469 aa  907    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.77093  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1291  threonine synthase  91.47 
 
 		 469 aa  906    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0226346  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1028  threonine synthase  91.9 
 
 		 469 aa  900    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65049 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1076  threonine synthase  100 
 
 		 469 aa  969    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.184051  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39480  threonine synthase  85.07 
 
 		 469 aa  830    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.104033  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1210  threonine synthase  66.02 
 
 		 465 aa  642    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16090  threonine synthase  89.55 
 
 		 469 aa  873    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3764  threonine synthase  66.3 
 
 		 461 aa  647    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.106362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4148  threonine synthase  98.08 
 
 		 469 aa  955    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.707815  normal  0.707599 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4250  threonine synthase  99.36 
 
 		 469 aa  966    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.941259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2273  threonine synthase  71.71 
 
 		 466 aa  701    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.593832  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3009  threonine synthase  62.99 
 
 		 462 aa  601  1.0000000000000001e-171  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.923826  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0677  threonine synthase  58.87 
 
 		 467 aa  566  1e-160  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0874999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0599  threonine synthase  56.93 
 
 		 468 aa  525  1e-148  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0484  threonine synthase  56.49 
 
 		 463 aa  522  1e-147  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.632525  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0480  threonine synthase  55.91 
 
 		 461 aa  525  1e-147  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.475299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1831  threonine synthase  55.7 
 
 		 461 aa  523  1e-147  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1146  threonine synthase  55.75 
 
 		 463 aa  521  1e-147  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2330  threonine synthase  55.84 
 
 		 463 aa  524  1e-147  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.351518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0620  threonine synthase  56.65 
 
 		 461 aa  523  1e-147  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0489  threonine synthase  56.49 
 
 		 463 aa  521  1e-147  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.513608  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1413  threonine synthase  55.94 
 
 		 466 aa  519  1e-146  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.778378  normal  0.196154 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3233  threonine synthase  55.22 
 
 		 470 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3149  threonine synthase  54.17 
 
 		 462 aa  509  1e-143  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.211768  normal  0.632693 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1588  threonine synthase  54.11 
 
 		 470 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.742925  normal  0.0416146 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3578  threonine synthase  53.13 
 
 		 470 aa  504  1e-141  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0635  threonine synthase  53.75 
 
 		 471 aa  504  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.05572  normal  0.105186 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1398  threonine synthase  54.29 
 
 		 465 aa  504  1e-141  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3254  threonine synthase  52.92 
 
 		 470 aa  503  1e-141  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0242603 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3450  threonine synthase  53.02 
 
 		 470 aa  501  1e-140  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.182634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0921  threonine synthase  55.89 
 
 		 473 aa  499  1e-140  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.400205  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0692  threonine synthase  53.33 
 
 		 474 aa  498  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0760  threonine synthase  54.55 
 
 		 465 aa  497  1e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3524  threonine synthase  52.48 
 
 		 470 aa  494  1e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.970017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0536  threonine synthase  53.35 
 
 		 465 aa  493  9.999999999999999e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.376888  normal  0.520587 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4315  threonine synthase  53.81 
 
 		 462 aa  493  9.999999999999999e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.236333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0308  threonine synthase  54.47 
 
 		 465 aa  488  1e-137  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00604196 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2341  threonine synthase  53.46 
 
 		 471 aa  489  1e-137  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1251  threonine synthase  52.28 
 
 		 473 aa  488  1e-137  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0268  threonine synthase  54.41 
 
 		 471 aa  486  1e-136  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.964457  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0459  threonine synthase  54 
 
 		 459 aa  477  1e-133  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0839  threonine synthase  51.53 
 
 		 471 aa  471  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0859  threonine synthase  50.32 
 
 		 460 aa  473  1e-132  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00125642  hitchhiker  0.0000000245714 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0722  threonine synthase  49.68 
 
 		 471 aa  472  1e-132  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.259471 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1075  threonine synthase  53.09 
 
 		 435 aa  465  9.999999999999999e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.515489  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0229  threonine synthase  50.75 
 
 		 472 aa  464  1e-129  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4795  threonine synthase  50.44 
 
 		 476 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.420552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0262  threonine synthase  50.85 
 
 		 472 aa  461  9.999999999999999e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0907  threonine synthase  50.98 
 
 		 472 aa  457  1e-127  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0822  threonine synthase  50.77 
 
 		 472 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.214669 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1787  threonine synthase  53.65 
 
 		 467 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4578  threonine synthase  50.22 
 
 		 472 aa  451  1e-125  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4498  threonine synthase  49.78 
 
 		 465 aa  449  1e-125  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.395589  normal  0.347683 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2280  threonine synthase  48.37 
 
 		 460 aa  437  1e-121  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.12968  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2395  threonine synthase  49.89 
 
 		 461 aa  435  1e-120  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000411335  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1892  threonine synthase  46.12 
 
 		 460 aa  426  1e-118  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000135451  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1631  threonine synthase  47.84 
 
 		 461 aa  428  1e-118  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000000988233  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2985  threonine synthase  48.04 
 
 		 458 aa  422  1e-117  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.17832e-26 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1298  threonine synthase  48.37 
 
 		 458 aa  423  1e-117  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000609388  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1502  threonine synthase  45.4 
 
 		 463 aa  419  1e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.06587e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1695  threonine synthase  46.12 
 
 		 461 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0662  threonine synthase  45.5 
 
 		 462 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.419372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0696  threonine synthase  45.5 
 
 		 462 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0150581 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_65754  threonine synthase  42.24 
 
 		 511 aa  382  1e-104  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.148721 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2379  threonine synthase  43.68 
 
 		 476 aa  377  1e-103  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499285 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2558  threonine synthase  44.44 
 
 		 476 aa  373  1e-102  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3205  threonine synthase  44.44 
 
 		 476 aa  373  1e-102  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.87945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49056  predicted protein  44.52 
 
 		 504 aa  371  1e-101  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.3635  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0905  threonine synthase  42.89 
 
 		 475 aa  368  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1049  threonine synthase  42.89 
 
 		 475 aa  368  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2465  threonine synthase  42.86 
 
 		 473 aa  363  3e-99  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.191399 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2137  threonine synthase  42.64 
 
 		 473 aa  362  1e-98  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0606467 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0844  threonine synthase  44.1 
 
 		 480 aa  360  3e-98  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3518  threonine synthase  46.82 
 
 		 453 aa  360  3e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.116965  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01150  threonine synthase, putative  41.55 
 
 		 547 aa  358  9e-98  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.779366  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2191  threonine synthase  42.98 
 
 		 476 aa  354  2e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.10374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2230  threonine synthase  43.28 
 
 		 475 aa  353  2.9999999999999997e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0456531  hitchhiker  0.000150597 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0932  threonine synthase  42.8 
 
 		 482 aa  352  5e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.713242 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0439  threonine synthase  41.12 
 
 		 480 aa  352  5.9999999999999994e-96  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1420  threonine synthase  43.47 
 
 		 483 aa  352  1e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.226673  normal  0.0367452 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2573  threonine synthase  44.58 
 
 		 487 aa  350  3e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.866855  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03031  threonine synthase (Eurofung)  40.89 
 
 		 517 aa  350  4e-95  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0991235 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0446  threonine synthase  40.5 
 
 		 480 aa  350  4e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.31582  normal  0.521575 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1913  threonine synthase  41.72 
 
 		 475 aa  348  9e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.142116  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5218  threonine synthase  43.1 
 
 		 475 aa  348  1e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.160302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1763  threonine synthase  42.94 
 
 		 483 aa  348  1e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.158411 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2024  threonine synthase  42.25 
 
 		 472 aa  348  1e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2382  threonine synthase  42.77 
 
 		 475 aa  347  2e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1791  threonine synthase  42.94 
 
 		 483 aa  347  2e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.50005  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1264  threonine synthase  42.47 
 
 		 481 aa  347  2e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.974615 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2199  threonine synthase  42.51 
 
 		 483 aa  347  3e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000410505  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1328  threonine synthase  42.68 
 
 		 481 aa  346  6e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.377271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1542  threonine synthase  42.25 
 
 		 470 aa  345  8e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1239  threonine synthase  42.98 
 
 		 481 aa  344  1e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00928598 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1203  threonine synthase  42.47 
 
 		 481 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.053417 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1853  threonine synthase  42.51 
 
 		 483 aa  343  4e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1877  threonine synthase  42.51 
 
 		 483 aa  343  4e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102088  hitchhiker  0.0000174271 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>